Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,791,834 | G→C | 7.1% | G162R (GGT→CGT) | rseP → | regulatory intramembrane protein RIP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,791,834 | 0 | G | C | 7.1% | 211.9 / 6.2 | 71 | G162R (GGT→CGT) | rseP | regulatory intramembrane protein RIP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/31); new base C (3/2); total (38/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.11e-01 |
GCTATCCTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCCGACGAGCCGGAC > NC_002947/1791687‑1791980 | gCTATCCTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACgg < 1:91796/149‑1 (MQ=255) tCCTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTg < 6:252395/148‑1 (MQ=255) cTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTc > 5:35506/1‑149 (MQ=255) tttttCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcg < 6:224245/147‑1 (MQ=255) tttttCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGCCAAGCCGACCAACGGTTGGTcgg > 5:22711/1‑148 (MQ=255) tttttCTGGGTGCTGGCGATCCTTGGTACCCTGCAAATCCTCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcgt < 6:22711/148‑2 (MQ=255) tttCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcggcg < 4:65680/148‑1 (MQ=255) tttCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcggcg < 5:6725/148‑1 (MQ=255) ttCTGGGTGCTGGCGATGCTGTGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACCGTTGGTcggctt < 5:98644/148‑3 (MQ=255) tGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCaa > 3:366644/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTg > 5:390856/1‑148 (MQ=255) gATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTgg > 4:138749/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGt > 8:276699/2‑149 (MQ=255) tGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACTGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGtt > 6:346878/1‑149 (MQ=255) tGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGCCCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGCCCAACGGGTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTtcgt > 6:368629/1‑149 (MQ=255) ggTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTtcgtc < 2:78810/148‑1 (MQ=255) ccAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTgg < 8:142938/149‑1 (MQ=255) aGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGc > 1:8577/1‑149 (MQ=255) aGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGc < 3:120678/149‑1 (MQ=255) gCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCgg > 8:41040/1‑148 (MQ=255) cGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTAcc < 5:353484/149‑1 (MQ=255) gTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCtt > 8:269429/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGCGGTCGACAGTGTCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGGCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGc < 6:13057/148‑1 (MQ=255) aTCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGTCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACCGTTGGTcggctt > 1:41566/1‑102 (MQ=255) aTCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACCGTTGGTcggctt < 2:41566/103‑3 (MQ=255) tCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCa < 4:9159/148‑1 (MQ=255) tCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCa < 5:145745/148‑1 (MQ=255) gcgGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTgg < 6:390856/149‑1 (MQ=255) tCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTg > 3:161247/1‑149 (MQ=255) gACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTgcg > 1:165945/1‑149 (MQ=255) gCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTg < 6:243839/92‑1 (MQ=255) gCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAg > 5:282922/1‑149 (MQ=255) gCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAg > 1:303043/1‑149 (MQ=255) tGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCACGATGAGGgcgc > 6:296142/1‑148 (MQ=255) gCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAgcg > 8:127508/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAgcg > 2:329678/1‑149 (MQ=255) aGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAgcgc > 8:364707/1‑148 (MQ=255) ggCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACAAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAg > 3:61766/1‑149 (MQ=255) tGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTg > 2:231546/1‑149 (MQ=255) tGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAAATGGTTCGTCGTCTGGGCAACAGCGCTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTg > 1:314561/1‑149 (MQ=255) ccGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAg < 3:138749/149‑1 (MQ=255) ccGCGGGTCAGGAAATTGTCTCTGTGCATCGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGGCTGGCCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAg < 7:300672/149‑1 (MQ=255) gcgGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGt > 5:298033/1‑149 (MQ=255) gcgGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGACAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGt < 3:25815/149‑1 (MQ=255) tCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGc > 1:163225/1‑149 (MQ=255) cAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGagag > 5:255961/1‑83 (MQ=255) cAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGagag < 6:255961/83‑1 (MQ=255) ggAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTg > 7:309810/1‑148 (MQ=255) gAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGcc < 6:175065/130‑1 (MQ=255) gAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGcc > 5:175065/1‑130 (MQ=255) gAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGa < 4:161247/149‑1 (MQ=255) aaaTTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGAc < 7:269429/149‑1 (MQ=255) aaTTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGa > 5:17052/1‑147 (MQ=255) ttGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGt > 8:38180/1‑149 (MQ=255) gTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGtt < 5:346878/148‑1 (MQ=255) tgGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAg < 1:33320/149‑1 (MQ=255) tgGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAg < 6:35506/149‑1 (MQ=255) gATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAgg < 7:276699/148‑1 (MQ=255) aTGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgc < 6:298033/149‑1 (MQ=255) aTGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgc < 1:231546/149‑1 (MQ=255) aTGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgc > 6:45307/1‑149 (MQ=255) tGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgcg < 2:303043/149‑1 (MQ=255) tGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgcg < 6:282922/149‑1 (MQ=255) ggCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgcgc > 1:8428/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCGCCCATCGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgcgc < 1:329678/148‑1 (MQ=255) aaGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCcga > 4:284452/1‑149 (MQ=255) aaGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCcga > 1:179220/1‑149 (MQ=255) cgCCGACCAACCGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCcgac > 5:183620/2‑149 (MQ=255) gCCGACCAACCGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCcgac > 1:149646/1‑148 (MQ=255) gACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCCGACGAGc > 6:350101/1‑149 (MQ=255) gACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCCGACGAGc < 4:366644/149‑1 (MQ=255) aCGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCCGACGAGCCGGAc > 6:367561/1‑149 (MQ=255) | GCTATCCTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAG‑CATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCCGACGAGCCGGAC > NC_002947/1791687‑1791980 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |