Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,859,108 | C→G | 7.3% | intergenic (+28/+73) | PP_1661 → / ← PP_1662 | dehydrogenase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,859,108 | 0 | C | G | 7.3% | 216.7 / 5.3 | 68 | intergenic (+28/+73) | PP_1661/PP_1662 | dehydrogenase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/28); new base G (3/2); total (38/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 |
GCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAA > NC_002947/1858960‑1859255 | gcgTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTc < 2:95137/149‑1 (MQ=255) gcgTGGCCAGCAAGGGGAGTTTCAGCTGTGCTTCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCGGGCCTGATCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCTGGGCTGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTc < 8:355029/149‑1 (MQ=255) gTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCg > 5:263892/1‑149 (MQ=255) ccAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCa > 6:61863/1‑148 (MQ=255) cAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAAt > 6:279680/1‑149 (MQ=255) aGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATg > 4:307494/1‑149 (MQ=255) gTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCg‑cag > 7:257228/1‑149 (MQ=255) gAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCg‑cagca > 3:233230/1‑149 (MQ=255) ttGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCTTTAGGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCAttt < 1:146169/149‑1 (MQ=255) ttGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCAttt > 5:259416/1‑149 (MQ=255) aGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTggg > 5:112904/1‑149 (MQ=255) aGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTggg > 5:114389/1‑149 (MQ=255) aGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTggg < 5:24068/149‑1 (MQ=255) cTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGt < 5:217783/149‑1 (MQ=255) aTCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCa < 6:263892/149‑1 (MQ=255) aaTGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACt > 3:307673/1‑148 (MQ=255) acgacCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGc < 3:307494/148‑1 (MQ=255) cgacCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGcc > 4:126249/1‑148 (MQ=255) gggCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGt > 8:144057/1‑147 (MQ=255) ggCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAg < 7:144057/149‑1 (MQ=255) gCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGGGTCAgg < 6:121709/149‑1 (MQ=255) gCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCACGCGAGTCAgg < 6:26474/149‑1 (MQ=255) ttACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCg‑c > 1:309783/1‑107 (MQ=255) ttACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCg‑c < 2:309783/107‑1 (MQ=255) ggggCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTcgc < 3:126249/149‑1 (MQ=255) ggCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAAt < 6:259416/149‑1 (MQ=255) gAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGc > 5:318228/1‑148 (MQ=255) aaCCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCAt < 5:13893/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGCAGCCTGTCGGTAGATGTGCGTTTCGGGGGGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCATTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCAtt < 1:81231/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CAG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCAt < 7:163128/148‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATtgtgtg < 2:61414/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATtgtgt < 8:257228/148‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATtgtgt < 4:307673/148‑1 (MQ=255) gCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTgg > 4:373513/1‑149 (MQ=255) ccTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAgg < 7:158367/104‑1 (MQ=255) ccTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAgg > 8:158367/1‑104 (MQ=255) ccTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGgcgcg > 2:319443/1‑149 (MQ=255) tGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGTGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCt > 5:393376/1‑149 (MQ=255) tCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTg < 5:61863/148‑1 (MQ=255) ggTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAgg < 5:99164/107‑1 (MQ=255) ggTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAgg > 6:99164/1‑107 (MQ=255) gTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGTGTCAGGGGTTCGCGGCAATGGGCAGGGTGATTGTGTGGCGCGCTGGttt > 5:393021/1‑149 (MQ=255) gTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGttt > 6:152520/1‑149 (MQ=255) ggTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCCGACAGAATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGAAGGGTCATTGGTTGGCGCGCTGGTTTTc > 1:111608/1‑148 (MQ=255) gTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGc < 8:314244/117‑1 (MQ=255) gTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGc > 7:314244/1‑117 (MQ=255) ggggCTGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGTGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAg < 5:110611/148‑1 (MQ=255) gCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTc > 1:267259/1‑148 (MQ=255) gtAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGCGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAAcgcg < 4:233230/149‑1 (MQ=255) gCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGTGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTACAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTAt > 1:219649/1‑149 (MQ=255) ccTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTg > 3:312966/1‑149 (MQ=255) aTGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGc > 7:214959/1‑149 (MQ=255) gagCAACCCCAAAATGCTGCGGCATTG‑CCG‑GAGCATCGTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCt > 2:306925/3‑149 (MQ=37) gCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTc > 7:329802/1‑149 (MQ=255) aCCCCAAAATGCTGCGGCATTG‑CCG‑GAGCATCGTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCgtg > 3:30367/1‑149 (MQ=38) ccccAAAATGCTGCGGCATTG‑CCG‑GAGCATCGTGGGGTTGC‑CACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGtt > 3:174396/1‑149 (MQ=38) cccACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTc < 4:379647/144‑1 (MQ=255) cccACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTc > 3:379647/1‑144 (MQ=255) cccACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGtt < 3:373513/149‑1 (MQ=255) cccACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGtt > 4:382154/1‑149 (MQ=255) cccACGATGCTCAGGCAATG‑CAG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGACCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGtt > 2:220603/1‑149 (MQ=255) ccaaaaTGCTGCGGCATTG‑CCG‑GAGCATCGTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTc < 1:306925/144‑1 (MQ=38) ccACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTc < 6:114389/149‑1 (MQ=255) ccACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTc < 6:112904/149‑1 (MQ=255) ccACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTc < 8:329802/149‑1 (MQ=255) cACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCg > 4:344172/1‑149 (MQ=255) cACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCg > 5:176776/1‑149 (MQ=255) aaTGCTGCGGCATTG‑CCG‑GAGCATCGTGGGGTTGC‑CACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTAt < 4:174396/148‑1 (MQ=38) gCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATg > 2:308486/1‑148 (MQ=255) tCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGaa > 1:188469/1‑149 (MQ=255) | GCGTGGCCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATG‑CCG‑CAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAA > NC_002947/1858960‑1859255 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |