| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,914,294 | C→T | 7.5% | Q221* (CAG→TAG) ‡ | pcaQ → | transcriptional regulator PcaQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,914,294 | 0 | C | T | 7.5% | 191.8 / 4.1 | 66 | Q221* (CAG→TAG) ‡ | pcaQ | transcriptional regulator PcaQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/35); new base T (2/3); total (28/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.24e-01 | |||||||||||
CCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTCGAGCTTGACCTGGGTGTGCG > NC_002947/1914152‑1914442 | ccTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGc > 5:284570/1‑149 (MQ=255) gcgcCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCTGGATGCCgca > 4:245620/1‑142 (MQ=255) gcgcCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCTGGATGCCgca < 3:245620/144‑3 (MQ=255) cgcCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCTGGATGCCgcattgca < 2:98426/148‑8 (MQ=255) cgcCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAgc < 3:188569/148‑1 (MQ=255) gcCCGGTTCACCCGCTGATGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTCTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAgcgc < 6:77495/149‑1 (MQ=255) ccGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCt < 7:316011/149‑1 (MQ=255) cGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTg < 5:318147/149‑1 (MQ=255) gggTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTgg < 5:389953/149‑1 (MQ=255) cccGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑Acccc > 8:136725/1‑149 (MQ=255) cccGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AAccc < 6:158350/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCt > 8:93793/1‑149 (MQ=255) aGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCt > 5:45072/1‑149 (MQ=255) cACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCt > 3:120753/1‑147 (MQ=255) cACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGa < 6:45072/149‑1 (MQ=255) ccGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCgg > 7:287912/1‑149 (MQ=255) cGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGgc > 8:133144/1‑149 (MQ=255) gTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGgcg > 3:198727/1‑149 (MQ=255) gTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGgcg < 4:367697/149‑1 (MQ=255) ggAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGgcgc > 6:47145/1‑148 (MQ=255) cGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACct < 6:19025/149‑1 (MQ=255) cGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACct > 2:199310/1‑149 (MQ=255) gAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACctg < 7:93793/149‑1 (MQ=255) gAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCCGGCTCAGGGCCAgcgacagggt < 5:218121/149‑8 (MQ=255) gACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑ATCCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACctgctg < 5:43287/149‑1 (MQ=255) aCAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCCTGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTgg < 2:132315/149‑1 (MQ=255) aCAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTgg < 6:385043/149‑1 (MQ=255) aCAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGGGCTGCGGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACTGCCTGTGTGGGCAATGCGGCAGCCAGATGGGGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTgg < 6:379901/149‑1 (MQ=255) cAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTggg < 5:196815/149‑1 (MQ=255) ttACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGc < 8:207554/121‑1 (MQ=255) ttACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGc > 7:207554/1‑121 (MQ=255) ccGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCTTCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCtgtg > 1:32654/1‑149 (MQ=255) cTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTgtgggt < 7:38081/149‑1 (MQ=255) atggtggtgCCGGCCGGCGGCAGCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTgtgggt > 8:130514/4‑149 (MQ=255) tgctgcCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGgcg < 6:284570/149‑1 (MQ=255) tgcCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGcgccg > 6:275/1‑149 (MQ=255) gccgccGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGcgccgc > 5:242425/1‑149 (MQ=255) cggccgg‑cggCAGCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGt < 7:130514/147‑1 (MQ=255) ccgccgGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCcgcg > 2:102964/1‑149 (MQ=255) gccggccgGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTgg < 3:146709/119‑1 (MQ=255) gccggccgGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCACTGAGCCGGCGCTACCTGCTgg > 4:146709/1‑119 (MQ=255) ccggcACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGcc < 4:120753/149‑1 (MQ=255) gcACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAGGAACCCTGTCGCTGGCCCTCAGCCCCCGCTAAATGATGTGTATCGCTGTCCTGTGGGTGGCGCCGCGAGATGACg > 1:121150/1‑149 (MQ=255) ccaccaTCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGtgctg < 1:199310/149‑1 (MQ=255) caccaTCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGcgccgc < 2:261174/134‑1 (MQ=255) caccaTCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGcgccgc > 1:261174/1‑134 (MQ=255) ccaTCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTc > 3:187641/1‑149 (MQ=255) ccaTCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTc < 7:133144/149‑1 (MQ=255) aTCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGa > 7:285638/1‑149 (MQ=255) tCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGAc < 7:65111/149‑1 (MQ=255) tCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGAc < 3:350421/149‑1 (MQ=255) aTGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGt < 2:281782/149‑1 (MQ=255) tGCCGTCAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGTA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTg < 4:124989/149‑1 (MQ=255) ccGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGc < 8:287912/149‑1 (MQ=255) cGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGc > 1:370734/1‑148 (MQ=255) gACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCg > 8:7277/1‑148 (MQ=255) aCAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGaa < 4:198727/149‑1 (MQ=255) cAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAAc > 5:77858/1‑149 (MQ=255) tttGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTc < 1:102964/147‑1 (MQ=255) tttGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTc > 4:153284/1‑147 (MQ=255) tttGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTCg < 2:370734/148‑1 (MQ=255) tgCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTCGAGCtt > 3:263032/1‑149 (MQ=255) ccGGCATCTGGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTCGa > 2:32565/2‑139 (MQ=255) ccGGCATCTGGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCAGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTCGa < 1:32565/138‑1 (MQ=255) cGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGCTGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTCGAGCTTGACCTgg < 2:121150/149‑1 (MQ=255) ggCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTCGAGCTTGACCTggg < 4:281846/149‑1 (MQ=255) cAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTCGAGCTTGACCTGGGTGTGCg < 8:285638/149‑1 (MQ=255) | CCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTACCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGA‑‑AACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCGTGATGCCGTGCTGCTCGACCTGCGCCGTGGCGAACTGGTCGAGCTTGACCTGGGTGTGCG > NC_002947/1914152‑1914442 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |