| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,053,631 | T→A | 9.4% | intergenic (‑31/+35) | PP_1828 ← / ← PP_1829 | hypothetical protein/alpha/beta family hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,053,631 | 0 | T | A | 9.4% | 174.0 / 8.3 | 64 | intergenic (‑31/+35) | PP_1828/PP_1829 | hypothetical protein/alpha/beta family hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/28); new base A (4/2); total (34/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.11e-01 | |||||||||||
TCGGCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGG > NC_002947/2053483‑2053777 | gcggCAGTGCTGCCTGGCGTTGCAGCTGGAAATGTGCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTAt < 3:46161/148‑1 (MQ=255) gCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCgg > 1:289023/1‑149 (MQ=255) cAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCgg > 1:31783/1‑148 (MQ=255) gTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGGGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggcag < 5:34598/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATgg > 1:302406/1‑149 (MQ=255) ggCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCt > 8:101456/1‑148 (MQ=255) gCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCTGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTga < 2:256098/149‑1 (MQ=38) cGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTgag < 2:31783/149‑1 (MQ=255) gTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTgaga > 5:12149/1‑149 (MQ=255) agcTGTAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGa < 5:301/149‑1 (MQ=255) ttgggcggTCCGCGCGGCCCCGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTGCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGAc < 8:76447/146‑1 (MQ=255) ttCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGAc > 6:17345/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGGTCAGCCCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGAc > 7:355770/1‑149 (MQ=255) ggcggGCCGCGCGGCCCCGGGCTGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTGCGGCCGGCGCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTa < 3:220385/149‑1 (MQ=255) ggcggGCAGCGCGGCCCAGGGCTGGGGGGGGGTTTCGTGGGGTTCTTCGGCCGGCGCGACGGCGGTGGGGGTGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTa < 3:215392/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCg > 7:311374/1‑148 (MQ=255) aGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGaa < 2:340447/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCCCCGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGcc > 5:200797/1‑145 (MQ=255) gCTCGGCCCCGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGcc < 6:200797/145‑1 (MQ=255) cTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAgg > 2:383641/1‑149 (MQ=255) tCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAgg > 5:103186/1‑148 (MQ=255) tCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTAGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAgg > 5:386225/1‑148 (MQ=255) ggcagggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTg > 8:102708/1‑148 (MQ=255) gcagggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGa < 6:103186/149‑1 (MQ=255) gcagggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGa < 7:101456/149‑1 (MQ=255) ctggggggggGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGAGGGCGGGGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGAt < 2:289023/147‑1 (MQ=255) gggggggTTTCCTGGTGTTCTTCGGCCGGATCTACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCATCTATGCATTCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAAc < 2:132751/147‑1 (MQ=255) cGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACg > 5:144230/1‑149 (MQ=255) gggggTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGt > 3:200866/1‑149 (MQ=255) gggggTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGt < 6:12149/149‑1 (MQ=255) ggTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTcac < 5:17345/149‑1 (MQ=255) cTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATtcg > 7:171558/1‑149 (MQ=255) gggTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATtcgctc > 8:200991/1‑149 (MQ=255) ttcttcGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTcac < 2:256937/137‑1 (MQ=255) ttcttcGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTcac > 1:256937/1‑137 (MQ=255) cgacggccggcGCGACGGCGGGGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCTCCCa < 2:302406/146‑1 (MQ=255) ttcGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAg > 6:226415/1‑149 (MQ=255) ccggcTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCAc < 8:86537/149‑1 (MQ=255) ggcggTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCgg < 4:165645/149‑1 (MQ=255) tggtCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGa < 6:144230/149‑1 (MQ=255) catcaGGGGTTGTCCTCAGATATTCCTGCTGTATCTGCAGGCATTGCTGAGACCTGAGA‑CTTTTTGACTTAGGCCGAAGTCAAATGCTGGATTAACGTCACAATTCGCTCGCCCTGCTCACGCGCCAGGGGAAGCTGGGGGTTGAGGt < 6:27342/148‑1 (MQ=255) atcaGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAg > 8:104394/1‑149 (MQ=255) atcaGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAg < 8:171558/149‑1 (MQ=255) gggCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGt > 1:81289/1‑149 (MQ=255) ggCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCGCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGt > 1:296663/1‑149 (MQ=255) ccTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgc > 6:297355/1‑149 (MQ=255) cTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgct > 7:109488/1‑149 (MQ=255) cTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgc < 8:311374/148‑1 (MQ=255) tCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCGGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCCGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGctgctg > 1:297640/1‑149 (MQ=255) tCAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGctgctg > 7:45366/1‑149 (MQ=255) cAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTcgc > 7:119595/1‑141 (MQ=38) cAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTcgc < 8:119595/141‑1 (MQ=38) cAGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAACGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTgg > 8:274832/1‑149 (MQ=38) aGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGc > 7:252730/1‑149 (MQ=255) ctGCCTGCTGTATCGCCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CGGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCAt < 8:347027/148‑1 (MQ=255) aTGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGTACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAgg < 1:259304/126‑1 (MQ=255) aTGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAgg > 2:259304/1‑126 (MQ=255) ccTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGcc > 6:22518/1‑149 (MQ=255) ctgctgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAACTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGccc > 1:312948/1‑149 (MQ=255) gTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTggg > 6:213579/1‑149 (MQ=255) tATCGGGAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATCAACGTCACAATTCGCTCCCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTgg < 6:386225/147‑1 (MQ=255) tATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTgggg > 7:32675/1‑149 (MQ=255) tATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTgggg < 2:296663/149‑1 (MQ=255) tATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTgg < 7:200991/147‑1 (MQ=255) tATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTgg < 7:102708/147‑1 (MQ=255) tCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgc < 1:61369/129‑1 (MQ=255) tCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctgc > 2:61369/1‑129 (MQ=255) | TCGGCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGC‑CTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTGCTGGCTCATGCCCTTGGGG > NC_002947/2053483‑2053777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |