Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,084,299 | C→G | 5.9% | G226G (GGG→GGC) | PP_1863 ← | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,084,299 | 0 | C | G | 5.9% | 215.0 / 3.6 | 68 | G226G (GGG→GGC) | PP_1863 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/34); new base G (2/2); total (32/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.25e-01 |
CATGCAGTCGGTGATTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGGTGTTGAACAACGCCACCGGCATCGGCCGC > NC_002947/2084155‑2084443 | cATGCAGTCGGTGATTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCcgg > 6:334835/1‑149 (MQ=255) cATGCAGTCGGTGATTGGCGAGCGGGTCTGCGTACAGCGCACCAGCAATACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCcgg < 8:365392/149‑1 (MQ=255) aTGCAGTCGGTGATTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCcggc > 3:261586/1‑149 (MQ=255) tGCAGTCGGTGATTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCcggcg < 7:313539/149‑1 (MQ=255) tGCAGGCGGTGATTGGCGAGTGTGTCTGCGTACTGCGCACGAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAAGGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCcggcg < 4:229361/149‑1 (MQ=255) gTCGGTGATTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGa < 5:133689/149‑1 (MQ=255) gTCGGTGATTGGCGAGGGGGGCGGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGGGCGGTCACCGCCGGGCTGGCAGTGa < 4:204977/149‑1 (MQ=255) tCGGTGATTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGAc < 4:261586/149‑1 (MQ=255) ggTGATTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGa < 7:229731/149‑1 (MQ=255) tGATTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATg < 3:289924/149‑1 (MQ=255) gATTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTTTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATgg > 4:316241/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGTGGGGGTCTGCGTACTTCTCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCAGCCAGAATGCGGATGTTGCGCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCGAGCCCGGCGGTGACGAttg < 4:290696/148‑3 (MQ=255) aTTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGTAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATgg < 5:42875/148‑1 (MQ=255) aTTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATgg > 1:284505/1‑148 (MQ=255) gCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGATTCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCaa < 1:95718/148‑1 (MQ=255) gCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCa > 7:87137/1‑146 (MQ=255) cGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAgt < 2:178890/149‑2 (MQ=255) gggggTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATcg < 5:334835/149‑1 (MQ=255) ggggTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATcgc > 2:272787/1‑149 (MQ=255) gCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCATCTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAgg > 6:39700/1‑149 (MQ=255) gcgcACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGc > 8:339262/1‑149 (MQ=255) gcACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTg < 6:247101/149‑1 (MQ=255) cAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGgtg > 1:339772/1‑148 (MQ=255) aGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAACCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTa < 6:60331/149‑1 (MQ=255) cATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAAt < 1:304892/148‑1 (MQ=255) ttGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACg < 2:339772/149‑1 (MQ=255) tGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATc > 7:249447/1‑148 (MQ=255) gggCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGa > 4:208072/1‑149 (MQ=255) aaCTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTgg > 6:313732/1‑124 (MQ=255) aCTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTg < 6:380419/122‑1 (MQ=255) cagCGGCAGCCCTTCGCTCTCAACCAGAATGCGCATGTTGACCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGCTCACTCCCACCCCGGCGCTGACGATGCCAAAGATCGCCTCCAGGAATGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGccat > 8:245564/3‑147 (MQ=255) cTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCt > 4:135737/1‑149 (MQ=255) tGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAAt < 8:113508/139‑1 (MQ=255) tGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAAt > 7:113508/1‑139 (MQ=255) cGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGTGGTCACTGCCAGCCCGGCGTTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGccgt < 7:245564/146‑3 (MQ=255) ggCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGc > 7:149804/1‑149 (MQ=255) gCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCt < 7:174948/144‑1 (MQ=255) gCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCt > 8:174948/1‑144 (MQ=255) aGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTc > 8:226963/1‑149 (MQ=255) cTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAgc > 2:126930/1‑149 (MQ=255) ttCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAgcg > 3:158923/1‑149 (MQ=255) tctcACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCGCTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTg > 1:297894/1‑149 (MQ=255) tcACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTg < 7:339262/147‑1 (MQ=255) tcACCCAGAATGCGGATGTTACCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTg > 2:313637/1‑147 (MQ=255) aCCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGc < 3:208072/146‑1 (MQ=255) cccAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGt > 2:323148/1‑149 (MQ=255) ccAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTc > 4:41479/1‑149 (MQ=255) ccAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTc > 5:307273/1‑149 (MQ=255) cAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGGCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTc > 3:318813/1‑148 (MQ=255) gATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGAc < 6:307273/149‑1 (MQ=255) ttGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGaa < 5:39700/149‑1 (MQ=255) cccccGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCa < 3:316241/149‑1 (MQ=255) cccGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCGATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGaa < 1:382400/144‑1 (MQ=255) cccGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCGATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGaa > 2:382400/1‑144 (MQ=255) ccGA‑TCAGGCTCAGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCGTCTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCTCGACAGAAGCAg > 6:322543/1‑147 (MQ=255) cGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGGCCGGGGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCGAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCTGGCGCGACAGAAGCAGTCg < 4:318813/149‑1 (MQ=255) cGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCGTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCg < 1:272787/149‑1 (MQ=255) a‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGgt < 1:313637/149‑1 (MQ=255) cAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGgtgt > 2:226310/1‑149 (MQ=255) aGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCGCTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGgtgt < 2:297894/148‑1 (MQ=255) aGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGGTGtt < 3:41479/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGCAGCTGCGCGGGCACTGCCAGCCCGGGGGGGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGGTGTTg < 2:284505/149‑1 (MQ=255) cAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGGTGTTGaacaac < 8:249447/148‑1 (MQ=255) cAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGGTGTTGAACAACg < 8:149804/149‑1 (MQ=255) tCACCGCCGGGCTGGCAGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGGTGTTGAACAACGCCACCGGCATc > 3:364395/1‑149 (MQ=255) cTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGGTGTTGAACAACGCCACCGGCATCGGc < 3:135737/149‑1 (MQ=255) tGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGGTGTTGAACAACGCCACCGGCATCGGcc > 6:157159/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGGTGTTGAACAACGCCACCGGCATCGGCCGc > 3:376417/1‑149 (MQ=255) | CATGCAGTCGGTGATTGGCGAGGGGGTCTGCGTACTGCGCACCAGCATTACATTGGCCATGGGCAACTGCGGCAGCCCTTCGCTCTCACCCAGAATGCGGATGTTGCCCCCGA‑TCAGGCTCTGCAGCTGCGCGGTCACTGCCAGCCCGGCGGTGACGATGGCAAAGATCGCCGCCAGGCTTGGGCTGGTGTAGGCAATACGGTAATCGATGCCCTGTGCCTCCAGCGCATTGCAGGTCCAGGCGCGACAGAAGCAGTCGGTGTTGAACAACGCCACCGGCATCGGCCGC > NC_002947/2084155‑2084443 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |