| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 11,657 | G→C | 7.0% | P185P (CCG→CCC) ‡ | dnaN → | DNA polymerase III subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 11,657 | 0 | G | C | 7.0% | 270.7 / 7.3 | 85 | P185P (CCG→CCC) ‡ | dnaN | DNA polymerase III subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/43); new base C (2/4); total (38/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.57e-02 | |||||||||||
GCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTAC > NC_002947/11512‑11803 | gccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATc < 4:107177/149‑1 (MQ=255) ccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATc > 2:285651/1‑148 (MQ=255) ccTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATc > 4:311610/1‑148 (MQ=255) gAGCGTACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGAGGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCagga < 4:262005/149‑1 (MQ=255) gAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCagga < 6:178073/149‑1 (MQ=255) gAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCagga < 5:146210/149‑1 (MQ=255) gAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCagg < 2:148608/148‑1 (MQ=255) gAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCaaa < 1:230689/148‑3 (MQ=255) gAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTCCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCaaa < 6:131671/148‑3 (MQ=255) gAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTAATACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCaaa < 1:224892/148‑3 (MQ=255) aGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCaggag < 1:338924/149‑1 (MQ=255) cAGCTTCTCCATGTCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CCCCATGCTGCATGAGGTTTCCCGCAACAAGTTGCGCGATCTATACACCGACGGTCACCGCCTCGCGCTTTGCTCGATCAGCCCGCCGATCAAGCAGAAGCATCGa > 8:362603/1‑148 (MQ=255) aGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCaaa < 1:4164/139‑3 (MQ=255) aGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCaaa > 2:4164/1‑137 (MQ=255) gCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGacac < 1:48996/149‑1 (MQ=255) ttCGCCATGGCCCAGCAGTTTGTGCGCTTTTACCTCAA‑CGGCTTGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCTCGCTGTATCCACCGACGGTCACCCCCTCGGGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCa < 8:320724/149‑1 (MQ=255) cGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAg < 4:146732/148‑1 (MQ=255) cGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAg < 4:102886/148‑1 (MQ=255) ccATGGCCCAGCAGGAAGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCCGGt > 5:301260/1‑148 (MQ=255) cATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTc > 7:332992/1‑148 (MQ=255) gCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCg < 5:191679/148‑1 (MQ=255) cccAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTg < 3:350749/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGc > 1:303835/1‑149 (MQ=255) tgtgCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGt > 2:54067/1‑138 (MQ=255) tgtgCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGt < 1:54067/138‑1 (MQ=255) tgtgCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAg < 2:74737/149‑1 (MQ=255) cgcTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTAt > 5:236241/1‑149 (MQ=255) gcTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATc < 5:380325/149‑1 (MQ=255) tATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGt > 2:139902/1‑131 (MQ=255) tATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGt < 1:139902/131‑1 (MQ=255) gaaaCCTCAAGCAGCATGCCG‑TTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATc > 2:207970/4‑101 (MQ=38) gaaaCCTCAAGCAGCATGCCG‑TTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGCCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATc < 1:207970/98‑1 (MQ=37) aTTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCg > 8:66514/1‑129 (MQ=255) aTTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCg < 7:66514/129‑1 (MQ=255) ttACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTg > 2:76501/1‑148 (MQ=255) cTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCagga > 1:359351/1‑104 (MQ=255) cTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCagga < 2:359351/104‑1 (MQ=255) cTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGt < 8:332503/125‑1 (MQ=255) cTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGt > 7:332503/1‑125 (MQ=255) cTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGtt > 3:282261/1‑149 (MQ=255) cTCAA‑CGGCATGCTGATTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCACGAGGGTCGCCACCAGGGCATAGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAg > 6:383220/1‑147 (MQ=255) tCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTg > 8:349787/1‑149 (MQ=255) aa‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTg < 7:349787/147‑1 (MQ=255) aa‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGgc < 5:67788/149‑1 (MQ=255) aa‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGACG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGgc < 3:311610/149‑1 (MQ=255) cGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGgcgc > 4:356949/1‑149 (MQ=255) tgctgcTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctg < 2:314586/149‑1 (MQ=255) tgctgcTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctg > 3:100218/1‑149 (MQ=255) ctgctTGAGGTTTCCCGCAACAGGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGTGCAGGAGGATCGAGACCAGGTCATCGTGGCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctgct < 7:362603/149‑1 (MQ=255) tgctTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCAGCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTTCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctgctg < 8:332992/149‑1 (MQ=255) tgctTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctgctg > 6:232774/1‑149 (MQ=255) ttGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGTAAACATGGAGTTGCCGCGCATCCTGccc > 1:211596/1‑149 (MQ=255) gAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctg > 4:37901/1‑141 (MQ=255) gAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCctg < 3:37901/141‑1 (MQ=255) cGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAgg > 8:301364/1‑149 (MQ=255) gCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAgg > 8:63561/1‑148 (MQ=255) cAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCGCCGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGt < 1:285651/149‑1 (MQ=255) aaCACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAt < 3:356949/149‑1 (MQ=255) aaCACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTAt < 7:204168/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATc < 5:232774/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTATCCACCGACGCTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCAGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATc > 8:158837/1‑149 (MQ=255) gcTGTATCCACCTACGGTCACCGCCTGTCGCTTTGCTCGATGAGAGCGCCGTTCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGt < 7:149276/149‑1 (MQ=255) tATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTg > 1:376988/1‑149 (MQ=255) tATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTg < 5:378059/149‑1 (MQ=255) aTCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTgg > 3:295785/1‑149 (MQ=255) aCCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGc > 2:42158/1‑142 (MQ=255) aCCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGc < 1:42158/142‑1 (MQ=255) 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tcctGCTCGATCGGCGCGCTCATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCactac > 1:346833/4‑149 (MQ=255) tttGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCactact < 7:78005/149‑1 (MQ=255) tGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGTCACTACTg < 1:230850/148‑1 (MQ=255) tGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTAGCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTg < 2:303835/148‑1 (MQ=255) gCTCTATGAGAGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGTAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGt > 2:158800/1‑149 (MQ=255) cTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGt < 4:100218/148‑1 (MQ=255) tCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGt > 2:360625/1‑147 (MQ=255) gATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGa < 4:114608/147‑1 (MQ=255) aGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAg > 4:295206/1‑101 (MQ=255) aGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAg < 3:295206/101‑1 (MQ=255) gcCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTa > 5:197032/1‑149 (MQ=255) ccGATCGAGCAGGAGGAGCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGGATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTAc < 6:167510/149‑1 (MQ=255) | GCCTGATCGAGCGAACCAGCTTCGCCATGGCCCAGCAGGATGTGCGCTATTACCTCAA‑CGGCATGCTGCTTGAGGTTTCCCGCAACACGTTGCGCGCTGTATCCACCGACGGTCACCGCCTGGCGCTTTGCTCGATGAGCGCGCCGATCGAGCAGGAGGATCGACACCAGGTCATCGTGCCG‑CGTAAAGGTATCCTGGAGTTGGCGCGCCTGCTGACCGATCCTGAAGGTATGGTCAGCATCGTGCTGGGCCAGCATCACATCCGCGCCACTACTGGTGAGTTCACCTTTAC > NC_002947/11512‑11803 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |