| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,264,559 | G→C | 5.7% | R170P (CGC→CCC) | accD → | acetyl‑CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,264,559 | 0 | G | C | 5.7% | 220.0 / 2.1 | 70 | R170P (CGC→CCC) | accD | acetyl‑CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/28); new base C (2/2); total (39/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 | |||||||||||
GCATGCCGATCGTGGTTAGCGCCTTCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGCCAGCCTGGCGATGCTCGGCGAC > NC_002947/2264412‑2264707 | gCATGCCGATCGTGGTTAGCGCCTTCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTgcgcgc < 4:195441/149‑1 (MQ=255)gCATGCCGATCGTGGTTAGCGCCTTCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTgcgcgc < 2:248914/149‑1 (MQ=255)gCATGCCGATCGTGGTTAGCGCCTTCGAGTTCTCGTGCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTgcgcgc < 8:276620/149‑1 (MQ=255) cATGCCGATCGTGGTTAGCGCCTTCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCa > 8:188265/1‑149 (MQ=255) aTGCCGATCGTGGTTAGCGCCTTCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCAt < 6:46090/149‑1 (MQ=255) gCCGATCGTGGTTAGCGCCTTCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATg > 5:216155/1‑148 (MQ=255) gcgcCTTCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGAtc < 5:324075/149‑1 (MQ=255) ccTTCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCg < 6:216155/149‑1 (MQ=255) ctgcGAGTTCTCGTTCATCGGCGGCGCCAGGGGTGCCAGCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTCCGGCGAACTCTGCCCTGGAAACCCGCTGCCCAATGGGTTGCTTCTCCCCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGACGCGCTGATCTCGc < 8:279309/146‑1 (MQ=255) ttCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCt > 5:287504/1‑149 (MQ=255) tCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTATCCGCTTCGGGCGGTGTGCGCATGGAGGAAGCGCTGATCTCGCt > 8:182390/1‑148 (MQ=255) cGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCt < 7:87205/147‑1 (MQ=255) gAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGa < 6:225249/148‑1 (MQ=255) gAGTTCTCGCTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGa < 6:54011/148‑1 (MQ=255) gTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTTCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCTCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGTCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGc < 4:66261/149‑1 (MQ=255) ttCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTGGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATg > 2:318826/1‑147 (MQ=255) aTGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCaa < 3:262859/149‑1 (MQ=255) gggCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGc < 6:208493/137‑1 (MQ=255) gggCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGc > 5:208493/1‑137 (MQ=255) ggcggcTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGa < 6:287504/148‑1 (MQ=255) gcggcTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGa > 4:307783/1‑132 (MQ=255) gcggcTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGa < 3:307783/132‑1 (MQ=255) ggcTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCCACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACctc > 1:264484/1‑149 (MQ=255) gcTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAg < 6:330093/143‑1 (MQ=255) gcTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAg > 5:330093/1‑143 (MQ=255) cTCCATGGTTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTg < 8:156101/149‑1 (MQ=255) tCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGc > 1:168788/1‑149 (MQ=255) cATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGcc < 7:188265/148‑1 (MQ=255) gggTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGc > 2:370480/1‑149 (MQ=255) cATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGgcgc > 5:121853/1‑149 (MQ=255) aGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGAc > 6:252591/1‑121 (MQ=255) gcTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCgaagaa < 1:370480/149‑1 (MQ=255) cTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCCCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGAt < 1:327814/102‑1 (MQ=255) cTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCCCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGAt > 2:327817/1‑102 (MQ=255) cTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCCCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGAt < 1:327817/102‑1 (MQ=255) cTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCCCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGAt > 2:327814/1‑102 (MQ=255) cGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCa > 1:261503/1‑149 (MQ=255) cGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGATCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATccc > 1:324092/1‑149 (MQ=255) gTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCACGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCg > 5:235116/1‑149 (MQ=255) tGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTGGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGt < 1:318826/149‑1 (MQ=255) ggCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGcc > 2:109671/1‑100 (MQ=255) ggCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGcc < 1:109671/100‑1 (MQ=255) ggCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCa > 5:209115/1‑149 (MQ=255) aCTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCg > 6:14398/1‑149 (MQ=255) tATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCgg > 7:207667/1‑148 (MQ=255) tATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCgg > 3:330715/1‑148 (MQ=255) ccTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTAGTga > 8:167352/1‑149 (MQ=255) ccTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTga > 5:29874/1‑149 (MQ=255) cTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTgcgc < 6:217381/117‑1 (MQ=255) cTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTgcgc > 5:217381/1‑117 (MQ=255) tGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTgacc > 6:34078/1‑149 (MQ=255) gAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGTGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTgacc < 7:182390/147‑1 (MQ=255) gAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTgaccga > 1:82185/1‑149 (MQ=255) aaaCCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGAGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTAGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCAACCCGTTCAAAACGTTACTgaacgacc > 7:54507/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGgt > 7:253632/1‑149 (MQ=255) cTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGgtgt < 4:330715/149‑1 (MQ=255) cAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGc > 4:107628/1‑149 (MQ=255) aaTGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTgaccgacc < 7:93734/137‑1 (MQ=255) aaTGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTgaccgacc > 8:93734/1‑137 (MQ=255) tGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGgt < 2:168788/149‑1 (MQ=255) tGGTATGCTTCTCCGCTTGCGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGgt < 4:288026/149‑1 (MQ=255) ttGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGttt > 8:183274/1‑149 (MQ=255) ttCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGc > 6:131833/1‑149 (MQ=255) tctcCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCACGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGc > 1:220459/1‑148 (MQ=255) tcCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTgcgc < 4:46766/87‑1 (MQ=255) tcCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTgcgc > 3:46766/1‑87 (MQ=255) cGCTTCGGGAGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCATATGTCCAAGACCTCTGCCGTGATGGCGCGCATGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCCACCCGCTGTATGGCGGTGTTTCCGCCAGcc > 2:173112/1‑149 (MQ=255) cGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGCCAGCCTgg < 2:261503/147‑1 (MQ=255) cGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGCCAGCCTgg < 2:82185/147‑1 (MQ=255) cGGGAGGTGCGCTCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCATATGGCCATGACGTGTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGGGAAGAAGGCATGCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTTTGGCGGTGTTTCCGCGAGCCTgg < 1:173112/147‑1 (MQ=255) ggCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGCCAGCCTGGCGAt > 6:149523/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGCCAGCCTGGCGATGCt > 4:44649/1‑149 (MQ=255) gTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGCCAGCCTGGCGATGCTc < 2:220459/149‑1 (MQ=255) cgcATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGCCAg > 2:134735/1‑131 (MQ=255) gcATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGCCAGCCTGGCGATGCTCGGCGAc < 2:264484/149‑1 (MQ=255) | GCATGCCGATCGTGGTTAGCGCCTTCGAGTTCTCGTTCATGGGCGGCTCCATGGGTGCCATCGTCGGCGAGCGCTTCGTCCGTGCGGCCAACTATGCCCTGGAAAACCGCTGCCCAATGGTTTGCTTCTCCGCTTCGGGCGGTGCGCGCATGCAGGAAGCGCTGATCTCGCTGATGCAGATGGCCAAGACCTCTGCCGTGCTGGCGCGCCTGCGCGAAGAAGGCATCCCGTTCATCTCGGTACTGACCGACCCGGTGTATGGCGGTGTTTCCGCCAGCCTGGCGATGCTCGGCGAC > NC_002947/2264412‑2264707 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |