Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,450,415 | C→A | 7.2% | R223L (CGC→CTC) | PP_2146 ← | SNF2/RAD54 family helicase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,450,415 | 0 | C | A | 7.2% | 217.7 / 4.2 | 69 | R223L (CGC→CTC) | PP_2146 | SNF2/RAD54 family helicase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/33); new base A (2/3); total (33/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 |
GCAGCGCAGCATCGCTTCGCCGCTGTACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACGAAGCGCGGTGGCTCGTAGAGGAAATCGTAAAGG > NC_002947/2450267‑2450561 | gcagcgcagcATCGCTTCGCCGCTGTACCACCGCCCCCGGTTATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGgcgc > 6:351450/1‑149 (MQ=255) gcagcaTCGCTTCGCCGCTGTACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAACCATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTg < 1:201542/149‑1 (MQ=255) agcaTCGCATCGCCGCTGTACCACCGCCCCCGTTAATTTCCTTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGATGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGaa < 4:372268/149‑1 (MQ=255) gcaTCGCTTCGCCGCTGAACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGAGCTgttc > 4:255404/1‑145 (MQ=255) caTCGCTTCGCCGCTGTACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGAGCTgttcca > 8:19593/1‑144 (MQ=255) ttCGCCGCTGTACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGAGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAC‑CATCCGCCCGGGTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGc > 7:145884/1‑149 (MQ=255) gccgcTGTACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCAc > 6:315229/1‑149 (MQ=255) gccgcTGTACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGAGCTGTTCCAGCGCGccct < 7:19593/149‑3 (MQ=255) gccgcTGTACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGAGCTGTTCCAGCGCGccct < 4:42779/149‑3 (MQ=255) gccgcTGAACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGAGCTGTTCCAGCGCGccc < 3:255404/148‑2 (MQ=255) ccgcTGTACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGTACAGCTCGCCAcc > 6:32775/1‑149 (MQ=255) cgcTGTACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCt > 8:164375/1‑149 (MQ=255) ccaccGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGc > 3:320510/1‑149 (MQ=255) ccGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGcc > 2:268978/1‑129 (MQ=255) ccGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGcc < 1:268978/129‑1 (MQ=255) cGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCg < 1:294436/149‑1 (MQ=255) aTTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGc > 8:8847/1‑149 (MQ=255) tCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCcgc > 1:293026/1‑149 (MQ=255) gTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTTGAGCGGTAGCCGCGAt > 1:328089/1‑149 (MQ=255) gTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGCACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTACAGTCGGTAGCCGCGATCCt > 6:156048/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCt < 7:145549/148‑1 (MQ=255) tCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCt < 5:166923/148‑1 (MQ=255) tCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCt < 2:293026/148‑1 (MQ=255) cAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGgc > 4:310269/1‑149 (MQ=255) aGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCGTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGgcc > 6:229286/1‑149 (MQ=255) aGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGgcc > 1:191476/1‑149 (MQ=255) gTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGgccgccg < 6:263660/149‑1 (MQ=255) aCCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGCCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGgccgccgcc > 2:360699/1‑149 (MQ=255) aaCTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCaa < 4:343687/149‑1 (MQ=255) aaCTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCaa < 5:351450/149‑1 (MQ=255) aCTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAg < 5:315229/149‑1 (MQ=255) aCTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAg < 1:222967/149‑1 (MQ=255) cTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAgg < 3:153782/149‑1 (MQ=255) ggCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGcc < 7:127626/148‑1 (MQ=255) gCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGTACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCga < 5:32775/149‑1 (MQ=255) gCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCga < 4:292080/149‑1 (MQ=255) cGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCgag < 3:47053/149‑1 (MQ=255) tGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGagag > 7:300926/1‑149 (MQ=255) cgcAGCGGGCCGTCATGCAGCAGGGGGAGTGCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGTCGCTCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCTAGAGCAg < 7:343734/149‑1 (MQ=255) cACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGgc < 7:164375/149‑1 (MQ=255) cGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCa < 1:110072/149‑1 (MQ=255) cGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCa < 3:310269/149‑1 (MQ=255) cGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCa < 4:210816/149‑1 (MQ=255) gggCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGgcg > 8:266496/1‑146 (MQ=255) cTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCa < 5:164113/144‑1 (MQ=255) cTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCa > 6:164113/1‑144 (MQ=255) cTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGAAAATTGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGAAGAATg > 7:330926/1‑149 (MQ=255) aTGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCgg < 1:360699/148‑1 (MQ=255) tGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTTGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCAGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGTGGAt < 2:191476/149‑1 (MQ=255) tGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGAt > 8:9146/1‑149 (MQ=255) gCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTc < 5:156048/148‑1 (MQ=255) gCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGAGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCt > 1:271194/1‑149 (MQ=255) gTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGa > 6:225080/1‑103 (MQ=255) gTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGtt < 8:300926/148‑1 (MQ=255) gTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTa < 4:320510/149‑1 (MQ=255) cGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTAc > 7:143119/1‑148 (MQ=255) gtgtCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACg > 4:310067/1‑147 (MQ=255) cGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCaa < 3:153357/100‑1 (MQ=255) cGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCaa > 4:153357/1‑100 (MQ=255) gaa‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTc < 6:47103/129‑1 (MQ=255) gaa‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTc > 5:47103/1‑129 (MQ=255) gaa‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACGAAGCGCGGTg > 4:235471/1‑149 (MQ=255) cATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACGAAGCGCGGTGGCt > 6:361626/1‑149 (MQ=255) cGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTc < 8:164003/122‑1 (MQ=255) cGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTc > 7:164003/1‑122 (MQ=255) cccGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCGTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACGAAGCGCGGTGGCTCGTa > 7:267011/1‑147 (MQ=255) cccGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACGAAGCGCGGTGGCTCGTaga < 8:143119/149‑1 (MQ=255) ccGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACGAAGCGCGGTGGCTCGTagag < 2:328089/149‑1 (MQ=255) ggTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACGAAGCGCGGTGGCTCGTagagc > 7:262674/1‑147 (MQ=255) ggTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACGAAGCGCGGTGGCTCGTAGAgg > 4:341480/1‑148 (MQ=255) cgcgcTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACGAAGCGCGGTGGCTCGTAGAGGAAATCGTAAAgg > 2:325771/1‑149 (MQ=255) | GCAGCGCAGCATCGCTTCGCCGCTGTACCACCGCCCCCGGTAATTTCCGTTGTCCAGGCGTACCCAGCGAAACTCGGCGTGGCGCACCGGGCCTTCATGAAGCAGGGGGAGGTCGGTGTCGAAGAA‑CATCCGCCCGGTTTCGAGGGCGCGCTGGAACAGCTCGCCACCTTCATGGCCCTTCAGTCGGTAGCCGCGATCCTGGCCGCCGCCCTGATTCAAGGCCGAGAGCAGGCGCAGAATGCGGATGTCTTCGTCTGTTACGAAGCGCGGTGGCTCGTAGAGGAAATCGTAAAGG > NC_002947/2450267‑2450561 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |