Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,487,122 | A→G | 5.7% | S58G (AGC→GGC) | PP_2181 → | Cro/CI family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,487,122 | 0 | A | G | 5.7% | 206.8 / 2.0 | 70 | S58G (AGC→GGC) | PP_2181 | Cro/CI family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/33); new base G (2/2); total (34/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.37e-01 |
TGGCAGTACTGATTCGCGACCTGCGCAAGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGCCCTCCATAACGGGC > NC_002947/2486979‑2487268 | tGGCAGTACTGATTCGCGACCTGCGCAAGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATATCACAGCCATCAGCg > 7:270252/1‑147 (MQ=255) gCAGTACTGATTCGCGACCTGCGCAAGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGaa < 6:13489/147‑1 (MQ=255) aTTCGCGACCTGCGCAAGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGgtg > 7:297905/1‑148 (MQ=255) aTTCGCGACCTGCGCAAGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATATCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGgt < 8:270252/147‑1 (MQ=255) tCGCGACCTGCGCAAGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTAt > 6:45750/1‑149 (MQ=255) tCGCGACCTGCGCAAGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTAt > 6:329178/1‑149 (MQ=255) cgACCTGCGCAAGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCca > 1:30783/1‑149 (MQ=255) gcgcAAGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGcc > 3:357187/1‑148 (MQ=255) aGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTc < 5:92577/149‑1 (MQ=255) gTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCCGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCt < 6:92946/149‑1 (MQ=255) ttCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCTCAGCGCTTCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTa < 4:377360/149‑1 (MQ=255) aaGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACaa < 5:119716/149‑1 (MQ=255) aGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAg > 6:169717/1‑149 (MQ=255) gggCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGc < 4:349757/149‑1 (MQ=255) gCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTg < 2:380661/149‑1 (MQ=255) gCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTg < 3:214788/149‑1 (MQ=255) ccTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTgg < 5:298074/149‑1 (MQ=255) gACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGAc > 6:211067/1‑148 (MQ=255) cacTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCATTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACaaa < 5:329178/149‑1 (MQ=255) ggCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAAcccc < 4:11182/148‑1 (MQ=255) cGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCACGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCcgc > 1:273994/1‑148 (MQ=255) gAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGa < 5:169717/149‑1 (MQ=255) gAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGa < 6:108414/149‑1 (MQ=255) cTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCt > 5:235925/1‑149 (MQ=255) cacaGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGAc < 2:273994/149‑1 (MQ=255) cacaGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGAc > 1:383797/1‑149 (MQ=255) acaGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACt > 5:48558/1‑149 (MQ=255) aGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTgg < 5:211067/149‑1 (MQ=255) cgcATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGt < 2:383797/149‑1 (MQ=255) aTCGTCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGAc < 8:175572/149‑1 (MQ=255) cGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGAcccgccc < 5:45750/149‑1 (MQ=255) tCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCa > 5:282373/1‑149 (MQ=255) gTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCAc > 2:387333/1‑147 (MQ=255) cTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGAATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTc > 1:125473/1‑149 (MQ=255) tttCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCg > 7:123714/1‑149 (MQ=255) tCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGc < 6:48558/148‑1 (MQ=255) tCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGc < 6:235925/148‑1 (MQ=255) ccAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTgg > 4:147741/1‑118 (MQ=255) ccAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTgg < 3:147741/118‑1 (MQ=255) ccAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTg < 1:387333/148‑1 (MQ=255) acagagcGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGc > 2:353908/7‑149 (MQ=255) cAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCa > 1:389612/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCa < 2:125473/149‑1 (MQ=255) tCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTg > 5:34579/1‑149 (MQ=255) aaCGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCGGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTg < 8:362612/113‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCGGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTg < 8:357832/113‑1 (MQ=255) aaCGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCGGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTg > 7:362612/1‑113 (MQ=255) aaCGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCGGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTg > 7:357832/1‑113 (MQ=255) cggcgTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTg < 4:357187/149‑1 (MQ=255) gcgTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTgg > 2:104100/1‑148 (MQ=255) gtgtCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCAt < 2:30783/149‑1 (MQ=255) tCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCTTCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCAc > 7:146745/1‑149 (MQ=255) tCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCAc > 3:350722/1‑149 (MQ=255) cACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCAcc > 3:80212/1‑149 (MQ=255) aCGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCAcc > 7:8787/1‑148 (MQ=255) gCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGAt < 4:65235/149‑1 (MQ=255) gCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGAt > 3:65235/1‑149 (MQ=255) gTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGc < 4:350722/149‑1 (MQ=255) cGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTCGCATCGc > 1:159010/1‑149 (MQ=255) gATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGcc > 4:161656/1‑149 (MQ=255) acaGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCg < 7:137234/98‑1 (MQ=255) acaGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCg > 8:137234/1‑98 (MQ=255) acaGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGCCCTc < 4:80212/146‑1 (MQ=255) acaGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGCCCTCCAt < 8:123714/149‑1 (MQ=255) gCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGCCCTCCATAAc < 1:104100/149‑1 (MQ=255) gCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGCCCTCCATAAc < 8:316441/149‑1 (MQ=255) ccATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGCCCTCCATAACg > 6:209339/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGCCCTCCATAACggg > 1:377249/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGCCCTCCATAACggg > 6:161477/1‑149 (MQ=255) tCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACACACCCCGCGAGCGCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGCCCTCCATAACGGgc < 8:297905/149‑1 (MQ=255) | TGGCAGTACTGATTCGCGACCTGCGCAAGTTCAAGGGCCTGACACTGGGCGAGCTGGCACAGCGCATCGGCCGTTCGGTGGGCTTTCTGTCCCAGGTCGAACGCGGCGTGTCACGCCCGACCGTGGCCGATCTCACAGCCATCAGCGAAGAGCTCGGTGTATCCACAGCCTACTTCTACAAGCTGGACAAACCCCGCGAGCTCGACTGGGTGACCCGCCCGCACGAGCGTCGCACGCTGCACCTGGCCGGTGGCATCACCGATGTGCTGGCATCGCCCTCCATAACGGGC > NC_002947/2486979‑2487268 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |