| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,835,596 | C→G | 6.5% | intergenic (‑179/+61) | aldA ← / ← sad‑I | aldehyde dehydrogenase/NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,835,596 | 0 | C | G | 6.5% | 219.6 / 2.4 | 70 | intergenic (‑179/+61) | aldA/sad‑I | aldehyde dehydrogenase/NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/26); new base G (2/3); total (41/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
GTAATATTCAGATATGTCAATATGTAGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGATTAGCTCGCGCCCGT > NC_002947/2835454‑2835742 | gTAATATTCAGATATGTCAATATGTAGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATtca > 7:219319/1‑149 (MQ=255) atTCAGATATGTCAATATGTAGCTTTGTTTTCCGGCACTTATGCATAGTCACCGCACCCTTGCAGATCACTTATGGATCGGCCGGGAACGCGCCGTCCTTGCCGCCAGGGTTGCATATTTAGACAAGCCCCCCTGGAGGTATtcagc > 1:86124/1‑145 (MQ=255) tCAGATATGTCAATATGTAGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TGTCCTCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAa‑gg < 5:85083/148‑1 (MQ=255) tCAGATATGTCAATATGTAGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAa‑g > 2:377298/1‑147 (MQ=255) gATATGTCAATATGTAGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCCCCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAG‑CCTCCTTGATGAATAGATCAa‑ggggggc < 6:317531/149‑3 (MQ=255) tatGTCAATATGTAGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAG‑CCTCCTTGATGAATAGATCAa‑ggggggctg < 4:53840/149‑5 (MQ=255) tatGTCAATATGTAGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAG‑CCTCCTTGATGAATAGATCAa‑ggggggctg < 6:360627/149‑5 (MQ=255) atatGTAGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCAt < 8:172067/149‑1 (MQ=255) tatGTAGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGTCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCAt > 3:153697/1‑148 (MQ=255) aGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTa > 4:180946/1‑149 (MQ=255) gCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTa < 1:377298/148‑1 (MQ=255) tttGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAt‑t > 2:188179/1‑148 (MQ=255) cGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCg > 3:367235/1‑149 (MQ=255) aCTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGa > 8:264157/1‑149 (MQ=255) aTGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGAtgtg > 8:250540/1‑149 (MQ=255) tGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGc < 7:264157/149‑1 (MQ=255) gCATA‑TCTCCGCACCCTTGCGGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGAtgtg > 1:3740/1‑147 (MQ=255) gCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGAtgtg > 1:336124/1‑147 (MQ=255) cATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCa < 3:151708/148‑1 (MQ=255) tcCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAg > 6:255752/1‑149 (MQ=255) cGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGt > 1:264719/1‑148 (MQ=255) gcggCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGgc < 2:3740/145‑1 (MQ=255) cAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGc < 6:169433/129‑1 (MQ=255) cAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGc > 5:169433/1‑129 (MQ=255) gCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGcgcg > 3:341905/1‑148 (MQ=255) tCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTc > 2:13465/1‑148 (MQ=255) aCTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCaa > 2:232851/1‑148 (MQ=255) cTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAata < 4:19441/149‑1 (MQ=255) ttCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAatat > 2:94866/1‑149 (MQ=255) cTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGtt < 3:143195/129‑1 (MQ=255) cTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGtt > 4:143195/1‑129 (MQ=255) gATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGAt > 6:274366/1‑148 (MQ=255) gATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGAt < 8:261549/148‑1 (MQ=255) gATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGAt < 7:362156/148‑1 (MQ=255) gATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGAt < 2:336124/148‑1 (MQ=255) aGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGTCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGc < 4:153697/149‑1 (MQ=255) gCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGc > 8:257757/1‑148 (MQ=255) ggAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGAt > 3:337149/1‑103 (MQ=255) ggAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGAt < 4:337149/103‑1 (MQ=255) gcCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTtgt > 6:181488/1‑149 (MQ=255) ccGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTtgtg > 7:138180/1‑149 (MQ=255) cGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGa < 5:181488/149‑1 (MQ=255) cGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGa > 3:34317/1‑149 (MQ=255) ttCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGAc < 1:232851/149‑1 (MQ=255) ttCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGAc > 6:356806/1‑149 (MQ=255) cgcgCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGAc < 7:250540/147‑1 (MQ=255) cgcgCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGAc < 1:188179/147‑1 (MQ=255) gcCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAAtt > 3:193671/1‑149 (MQ=255) gcCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAAtt > 1:60857/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTc < 3:180946/149‑1 (MQ=255) gTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGAAGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGa > 7:321305/1‑149 (MQ=255) ttGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGAt < 1:13465/149‑1 (MQ=255) cTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGcc > 1:206352/1‑148 (MQ=255) tATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTATGAGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGcc > 1:300883/1‑148 (MQ=255) tATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGccc > 3:193700/1‑148 (MQ=255) tATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATAAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCtgaaggcc > 1:290213/1‑140 (MQ=255) tAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGc < 8:219319/148‑1 (MQ=255) tCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGAt < 8:96157/137‑1 (MQ=255) tCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGAt > 7:96157/1‑137 (MQ=255) tCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGAt > 4:114286/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGAt > 3:285331/1‑149 (MQ=255) tCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGATAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGa > 8:40029/1‑148 (MQ=255) acAGCCACCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATTTGAAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTTATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGAt < 1:114018/147‑1 (MQ=255) ccagcctccTTGATGAATAGATCAAGGGGGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGAt > 2:232515/8‑148 (MQ=38) cAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGAtt < 8:138180/148‑1 (MQ=255) cAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGAtt < 2:206352/148‑1 (MQ=255) cAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGAt > 7:215283/1‑147 (MQ=255) cAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGAt > 5:235849/1‑147 (MQ=255) cTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGACCAAGCCGATTAGCTCacgc > 7:276111/1‑149 (MQ=255) tCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGATTAGCTCGCGCCCGt < 7:257757/148‑1 (MQ=255) | GTAATATTCAGATATGTCAATATGTAGCTTTGTATTCCGGCACTTATGCATA‑TCTCCGCACCCTTGCAGCTCACTTCTGGATCAGCCGGGAACGCGCCGTGCTTCGCGCCAGGGTTGCCTATGTAGTCCAGCCCCCCTTGATCTATTCATCAA‑GGAGGCTGGCTGCATCAGGTAT‑TGATGTTTGCGTTGATGTGCAGATGAAGTTAGAACGGCGCGTCAATATCGATGACGCTAATCAGCTTGTGATTGACGAATTCCTTGATGCCCAAGCCGATTAGCTCGCGCCCGT > NC_002947/2835454‑2835742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |