Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,862,209 | C→G | 9.4% | Q205H (CAG→CAC) | gllB ← | 4‑oxalmesaconate hydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,862,209 | 0 | C | G | 9.4% | 188.5 / 8.7 | 64 | Q205H (CAG→CAC) | gllB | 4‑oxalmesaconate hydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/31); new base G (3/3); total (30/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 |
ACGCGTGGGAACACGCTCTGCAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCGGCTTGTAGCCTTCAGC > NC_002947/2862066‑2862355 | aCGCGTGGGAACACGCTCTGCAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATCCAGTGCAt > 2:312676/1‑149 (MQ=255) tGGGAACACGCTCTGCAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATgg‑cgg < 7:12330/149‑1 (MQ=255) tGGGAACACGCTCTGCAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATCCAGTGCATgg‑ccg < 1:312676/149‑3 (MQ=255) aaCACGCTCTGCAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATa > 2:143682/1‑149 (MQ=255) acacGCTCTGCAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATAc > 5:335389/1‑149 (MQ=255) acGCGCTGCCTGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGGGCGCTGGGTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACtt < 6:11594/149‑1 (MQ=255) gCTCTGCAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACtttt > 6:363281/1‑149 (MQ=255) gCTCTGCAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACtttt < 1:309185/149‑1 (MQ=255) cAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGt < 6:199814/146‑1 (MQ=255) cAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGt < 8:286405/146‑1 (MQ=255) cAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTcc > 6:390512/1‑148 (MQ=255) tCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACAcc > 3:120699/1‑147 (MQ=255) cGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGa < 4:96971/148‑1 (MQ=255) ggCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCTGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAg < 1:269088/148‑1 (MQ=255) aGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATg > 6:149122/1‑149 (MQ=255) gACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGt > 4:9450/1‑149 (MQ=255) gACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGt > 5:356319/1‑149 (MQ=255) gATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCa < 5:390512/149‑1 (MQ=255) atgatgCGTGCGCAGGACATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCCCAGCAGGGCTACACGCGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGCTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATCG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAg < 4:81631/149‑1 (MQ=255) gcgtgcgCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAAc < 1:143682/148‑1 (MQ=255) gcgtgcgCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAAc < 2:240119/148‑1 (MQ=255) gcgcTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATCCAGTGCATgg‑ccggc < 2:244515/108‑5 (MQ=255) gcgcTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATCCAGTGCATgg‑ccggc > 1:244515/1‑104 (MQ=255) tGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCggg > 2:326216/1‑149 (MQ=255) ggTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGgc > 4:196924/1‑149 (MQ=255) gTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGgc < 7:29151/148‑1 (MQ=255) gCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGAGATGCAGGGCTACAAGGGTGTGAGTACTCCCAGAGATGTTCCTGGCCGGCAATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTAGTCCCACACAGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCAGGGCGCCAt > 1:291275/1‑149 (MQ=255) cccACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTc < 6:335389/149‑1 (MQ=255) cccACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGACGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAg > 6:370672/1‑128 (MQ=255) cccACGTTACGCTTGCCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAg < 5:370672/128‑1 (MQ=255) gcatGGCCTGCACGCCGCCCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACACCCAGAGGTGTTACATGCCGGCCATGCACTGGAAGG‑CGGCATACTTTTTGTACCACACCGAGGTAATGTACAGGAACCTGTCCCGGCGCCATACGCACTGCTCg > 4:61178/4‑149 (MQ=255) gCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCt < 4:89784/148‑1 (MQ=255) cACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGc < 5:363281/148‑1 (MQ=255) aCGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCgg > 6:168987/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCgg < 3:265215/149‑1 (MQ=255) cgccgcGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGc < 3:9450/149‑1 (MQ=255) gccgcGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCt > 4:124833/1‑149 (MQ=255) gcTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAg < 3:61178/149‑1 (MQ=255) cAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGc < 7:183798/147‑1 (MQ=255) cAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCg > 2:26358/1‑148 (MQ=255) tACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACcg > 1:314424/1‑149 (MQ=255) cacGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACcggc > 4:30999/1‑149 (MQ=255) gggTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGt > 3:354365/1‑149 (MQ=255) ggTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTg < 6:197410/149‑1 (MQ=255) gtgt‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTgc < 5:149122/149‑1 (MQ=255) taCTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAAc > 2:304317/1‑149 (MQ=255) taCTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAAc < 1:26358/149‑1 (MQ=255) tCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGAt > 7:43104/1‑149 (MQ=255) agagGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGAtcttc < 6:356319/149‑1 (MQ=255) ttggtCCTGGACGTCCATGCACTGGATGG‑CGGCAGACTTGTTGTCCCACACCTAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGTCGCCATTCGCACTGCGCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGAtcttctag < 2:291275/144‑3 (MQ=255) gtTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGccc > 3:204594/1‑149 (MQ=255) ttCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCg > 5:290226/1‑149 (MQ=255) ttCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCg > 3:111089/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCgg < 4:204594/148‑1 (MQ=255) gccggccATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCGGCtt < 4:111089/147‑1 (MQ=255) cccgccATCCAGTGCATGGCCGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCGGCTTg > 2:39811/4‑148 (MQ=255) ccgccATCCAGTGCATGGCCGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCGGCTTGt < 1:39811/146‑1 (MQ=255) gccATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCGGCTTGTAGcc < 3:30999/149‑1 (MQ=255) gccATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCGGCTTGTAGcc < 8:43104/149‑1 (MQ=255) aTGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCGGCTTGAAGCCtt > 1:136119/1‑148 (MQ=255) gCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGAtcttc > 2:169213/1‑127 (MQ=255) gCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGAtcttc < 1:169213/127‑1 (MQ=255) aCTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCGGCTTGTAGCCTTCAGc > 5:301581/1‑148 (MQ=255) aCTGGAGGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTTGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCGGCTTGTAGCCTTCAGc < 6:301581/148‑1 (MQ=255) | ACGCGTGGGAACACGCTCTGCAGGCCTTCGGCGTAGACGATGTTGCGTGCGCTGGTTATGCCCACGTTACGCTTGGCCTGCACGCCGCGCTGCAGGGCTACACGGGTGT‑AGTACTCCCAGAGGTGTTCCTGGCCGGCCATGCACTGGATGG‑CGGCATACTTTTTGTCCCACACCGAGGTAATGTCCAGGAACGTGTCCGGGCGCCATTCGCACTGCTCGGGCTGGTGCGGCTCAAAGGCGTAGACCGGCGGTGCGCCAACGATCTTCTCGCCCGGCTTGTAGCCTTCAGC > NC_002947/2862066‑2862355 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |