| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,217,457 | A→G | 7.6% | I83V (ATC→GTC) | oprJ → | outer membrane protein OprJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,217,457 | 0 | A | G | 7.6% | 187.2 / 5.1 | 66 | I83V (ATC→GTC) | oprJ | outer membrane protein OprJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/30); new base G (2/3); total (33/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.72e-01 | |||||||||||
CGGCCGAATGGGGCGATGCAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTCAGCAGCACCTATCAGGTGGGC > NC_002947/3217311‑3217603 | cggcCGAATGGGGCGATGCAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATc < 6:129800/149‑1 (MQ=255) gcCGAATGGGGCGATGCAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATc > 4:40301/1‑147 (MQ=255) ccGAATGGGGCGATGCAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAg < 6:239950/149‑1 (MQ=255) cGAATGGGGCGATGCAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGc < 4:233486/149‑1 (MQ=255) gAATGGGGCGATGCAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCa < 8:282958/149‑1 (MQ=255) aTGGGGCGATGCAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGATGTCGAGCAgg < 5:189486/149‑1 (MQ=255) aTGGGGCGATGCAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGAAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGATGTCGAGCAgg < 8:294571/149‑1 (MQ=255) aTGCAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGTAGGCAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCATTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGt > 1:120915/1‑149 (MQ=255) cAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCa < 2:253257/148‑1 (MQ=255) aGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAg > 4:321448/1‑148 (MQ=255) aGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAg > 3:284181/1‑148 (MQ=255) gCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTa < 3:40301/149‑1 (MQ=255) ggCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCg < 4:240518/149‑1 (MQ=255) aTACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATc < 1:366470/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATcc > 8:311356/1‑148 (MQ=255) aCTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATc > 4:221720/1‑147 (MQ=255) tGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGc > 4:33268/1‑149 (MQ=255) gCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCgg > 5:307150/1‑149 (MQ=255) gCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCgg < 3:79895/149‑1 (MQ=255) cACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCTCCAGACCCTGCTCGATGTCGAGCAgg < 1:209433/121‑1 (MQ=255) cACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGATGTCGAGCAgg > 2:209433/1‑121 (MQ=255) gAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGt < 4:101599/149‑1 (MQ=255) gTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCgg < 2:258833/149‑1 (MQ=255) ttGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAAGAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCggg < 7:250220/149‑1 (MQ=255) ttGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCggg > 6:290744/1‑149 (MQ=255) ttGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCggg < 4:284181/149‑1 (MQ=255) ggACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGc < 6:307150/148‑1 (MQ=255) gcaggcaTTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCTGGCTTGaa < 3:321448/147‑1 (MQ=255) aggcaTTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGc > 6:122458/1‑148 (MQ=255) ccAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGAACCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTAACGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCg > 7:358816/1‑149 (MQ=255) aGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGc > 1:343716/1‑148 (MQ=255) gT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTg > 4:279501/1‑149 (MQ=255) t‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGc < 5:290744/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTg > 1:168475/1‑149 (MQ=255) gTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTgcggc > 8:341438/1‑149 (MQ=255) tACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCttt > 6:43617/1‑149 (MQ=255) aCCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTc > 1:227932/1‑149 (MQ=255) cgcgCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCCGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGa < 7:203430/149‑1 (MQ=255) cgcgCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCttt > 7:33735/1‑146 (MQ=255) cgcgCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCttt < 8:33735/146‑1 (MQ=255) cgcTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGAGGCGATTTCGAGc > 1:133359/1‑149 (MQ=255) cTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGa < 2:120915/149‑1 (MQ=255) ggACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATg > 1:349839/1‑149 (MQ=255) gACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCTTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATgg < 5:43617/149‑1 (MQ=255) gACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGAt < 3:221720/147‑1 (MQ=255) gACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGAt < 7:311356/147‑1 (MQ=255) acaacaACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCgctcgg > 1:140122/1‑144 (MQ=255) caacaaCCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGcc > 4:27668/1‑149 (MQ=255) aacaacCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCcg > 5:155557/1‑149 (MQ=255) aacCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCCGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCcgc > 2:186302/1‑147 (MQ=255) ccGCTCCTAGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCGCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAgg < 7:356586/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCTTGCTCCAGACCCTGCACGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGGCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAgg < 8:359492/149‑1 (MQ=255) cTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTc < 2:84840/129‑1 (MQ=255) cTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTc > 1:84840/1‑129 (MQ=255) cTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGgtgt > 2:79974/1‑147 (MQ=255) ttGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTcag > 4:6812/1‑149 (MQ=255) gcCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTCagcagc < 1:79974/149‑1 (MQ=255) ccAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGCCCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTCAgcagca > 2:305654/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTCAGCAGCACCTAt > 5:167696/1‑148 (MQ=255) cGACGTCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTCAGCAGCACCTATCAGGTgg > 1:166271/1‑149 (MQ=255) gACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCg > 7:290623/1‑112 (MQ=255) gACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCg < 8:290623/112‑1 (MQ=255) gACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTc > 6:75090/1‑129 (MQ=255) gACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTc < 5:75090/129‑1 (MQ=255) aCATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTCAGCAGCACCTATCAGGTGGGc < 2:349839/149‑1 (MQ=255) aCATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTCAGCAGCACCTATCAGGTGGGc < 3:33268/149‑1 (MQ=255) aTCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTCAGCAGCAc > 6:67327/1‑134 (MQ=255) | CGGCCGAATGGGGCGATGCAGCCGGCCATACTGGCCACTCGGTGGAGCAGTTGGACTGGCAGGCATTCATCGTCGACCCAGTGCTGCGT‑‑‑CAGCTGGTCGGTACCGCGCTGGACAACAACCGCTCCTTGCGCCAGACCCTGCTCGACATCGAGCAGGCCCGTGCGCAGTACCGGATCCAGCGGGCCGACCGGGTGCCGGGCTTGAATGCCAGCGCCTCCGGTAATCGCCAGCATTTGCCTGCGGCGCTTTCGAGCGATGGCCGCGAGGGTGTCAGCAGCACCTATCAGGTGGGC > NC_002947/3217311‑3217603 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |