Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,271,146 | G→C | 9.9% | R313R (CGC→CGG) ‡ | PP_2869 ← | FMN‑binding oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,271,146 | 0 | G | C | 9.9% | 210.7 / 8.3 | 70 | R313R (CGC→CGG) ‡ | PP_2869 | FMN‑binding oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/29); new base C (3/4); total (37/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGGCAAGCCACGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGCCATCGGTGGCACGATATGGACCGCGCCA > NC_002947/3270999‑3271293 | gggCAAGCCACGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCcgc > 6:267792/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCCACGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCcgcg > 5:110451/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCACGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCgg > 7:44250/1‑149 (MQ=255) gCCACGATGGAAATGGCCGATTCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGGCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCa < 5:222686/149‑1 (MQ=255) gCCACGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCCGCCTGGCCGCGGGc > 6:82032/1‑147 (MQ=255) ccACGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCCGCGGCCAg > 1:345/1‑149 (MQ=255) aCGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAgg < 5:371812/148‑1 (MQ=255) aCGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAgg > 6:371812/1‑148 (MQ=255) aCGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCCGCGGCCAggc < 2:14118/149‑2 (MQ=255) aCGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCCGCGGCCAggc < 2:345/149‑2 (MQ=255) gATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGAt > 6:21041/1‑148 (MQ=255) aaTGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCg < 8:44250/149‑1 (MQ=255) atgcatgcCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTg < 5:21041/149‑1 (MQ=255) catgcCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGAACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATAGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATTCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCGCGGCTTCCTggg < 1:283656/148‑1 (MQ=255) atgcCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGc > 4:379576/1‑149 (MQ=255) atgcCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGc > 8:218092/1‑149 (MQ=255) gcCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTgg > 2:52665/1‑144 (MQ=255) gcCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTgg < 1:52665/144‑1 (MQ=255) gcCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTg > 7:41080/1‑149 (MQ=255) gcCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCCGCGGCCAgg < 1:173374/126‑1 (MQ=255) gcCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCCGCGGCCAgg > 2:173374/1‑126 (MQ=255) ccTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTg < 7:171139/148‑1 (MQ=255) cTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACTTCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGt < 3:333390/149‑1 (MQ=255) tGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGtt > 6:345863/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGAt < 5:345863/149‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGAt < 3:217320/149‑1 (MQ=255) tGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATg < 3:314518/149‑1 (MQ=255) ggCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCTGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGcc > 4:351189/1‑149 (MQ=255) ggCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCgg > 7:122222/1‑125 (MQ=255) ggCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCgg < 8:122222/125‑1 (MQ=255) gCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGccc > 5:45604/1‑149 (MQ=255) gCGATGCAGGCGCACACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGccc > 8:50285/1‑149 (MQ=255) gATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCgg > 2:46709/1‑149 (MQ=255) tGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTg < 5:267792/149‑1 (MQ=255) aGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGAc > 6:188928/1‑148 (MQ=255) gTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGa > 4:102793/1‑149 (MQ=255) gACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGc > 7:17522/1‑147 (MQ=255) gACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCa < 7:50285/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGGATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGGTGATGCGCCCGGGGACGCACAGGGGGATAGCCAg > 8:346951/1‑149 (MQ=255) aCCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATACGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAg > 7:69948/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCt > 7:348010/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCt < 3:186850/149‑1 (MQ=255) gCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGtt > 5:370771/1‑149 (MQ=255) gCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGtt > 4:324597/1‑149 (MQ=255) ccGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTg > 4:265255/1‑149 (MQ=255) cgcgTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGACCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTTATGTGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGc < 2:79144/149‑1 (MQ=255) cgTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCtt < 8:41080/149‑1 (MQ=255) ttCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTg > 3:106591/1‑148 (MQ=255) cGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGaa < 3:324597/148‑1 (MQ=255) cGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGaa < 6:45604/148‑1 (MQ=255) tCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTg > 5:199453/1‑149 (MQ=255) ttGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGc > 8:294954/1‑148 (MQ=255) cATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTcgc < 4:37742/149‑1 (MQ=255) aTCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTcgcg > 1:175839/1‑149 (MQ=255) aTCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGAAGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGctcgac > 4:195975/1‑143 (MQ=255) gACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGc < 2:175839/149‑1 (MQ=255) aCGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTGATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGcc < 6:110451/149‑1 (MQ=255) gCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACg > 1:167204/1‑149 (MQ=255) cAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGc > 4:336373/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCgg > 6:263619/1‑149 (MQ=255) cGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCTGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGc < 3:102793/149‑1 (MQ=255) aTGCCGCACACATGAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGCCATCgg < 7:348039/149‑1 (MQ=255) tGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGtt > 6:88926/1‑135 (MQ=255) tGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGtt < 5:88926/135‑1 (MQ=255) gCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGCCATCGGTg > 6:359962/1‑149 (MQ=255) cacacaTCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGCCATCGGTGGCAc < 1:46709/149‑1 (MQ=255) acaTCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGCTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGCCATCGGTGGCACGat < 5:263619/149‑1 (MQ=255) tgatccTGGCCCGTGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCATGTACGCCGGTTCGATGGCCATCGGTGGCACGATATg > 6:202267/5‑149 (MQ=255) atccTGGCCCGCGGACAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTTCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGCCATCGGTGGCACGata < 7:121647/143‑1 (MQ=255) aGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGCCATCGGTGGCACGATATGGa < 7:15576/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGCCATCGGTGGCACGATATGGAcc > 1:303717/1‑149 (MQ=255) gCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGCCATCGGTGGCACGATATGGACcgcg < 8:17522/148‑1 (MQ=255) cgcgGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATACGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCGGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTGCGATGGCCATCGGGGGCACGATATGCACCGCGCCa < 8:69948/149‑1 (MQ=255) | GGGCAAGCCACGATGGAAATGGCCGATGCATGCCTGGTTGCAGGCGATGCAGGCGCGCACGTCTTCGACCTGGCCGCGTTCGGTCTTGGCTGGCATCGACGGATCGCAGATCAGCGCCCGGGTCATGCCGCACACATCAGCCTGGCCGCGGGCCAGGATCAGCTCGGCTTCCTGGGGCTGGTTGATGCGCCCGGTGACGAACAGGGGGATAGCCAGCTGTTGCTTGAAGGTGCCAGCCTCGCGGGCCAGGTACGCCGGTTCGATGGCCATCGGTGGCACGATATGGACCGCGCCA > NC_002947/3270999‑3271293 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |