| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 44,126 | C→G | 5.2% | G467R (GGC→CGC) | cadA‑I ← | cadmium translocating P‑type ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 44,126 | 0 | C | G | 5.2% | 250.3 / 3.7 | 77 | G467R (GGC→CGC) | cadA‑I | cadmium translocating P‑type ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/35); new base G (2/2); total (40/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.15e-01 | |||||||||||
GGTCTCCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCACGCACGCCGCGGCCAATCATGTTGCTCATGTTC > NC_002947/43982‑44274 | ggTCTCCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGAGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCTTACCACCATTGTGGTAATGCctgac > 6:363588/1‑149 (MQ=255) gTCTCCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCctgac < 7:251835/148‑1 (MQ=255) gTCTCCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCctgac > 8:251835/1‑148 (MQ=255) tctcCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCCATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCCCGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCctgact > 8:166197/1‑148 (MQ=255) ctcCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCctgactg < 8:13290/148‑1 (MQ=255) aGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACg > 2:104962/1‑147 (MQ=255) aGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGCAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACg > 1:81258/1‑147 (MQ=255) gAAATCATGCCCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAACCTTCTCGAGTGCCTCTATGGCCCCCTCCCGGGGAGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTAGGCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAg < 5:161360/149‑1 (MQ=255) atttccATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTTAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCt < 2:81258/144‑1 (MQ=255) aCCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCg > 3:317566/1‑148 (MQ=255) ccATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCa < 5:95436/149‑1 (MQ=255) aTGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGc > 1:178953/1‑149 (MQ=255) cGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTc > 8:224216/1‑149 (MQ=255) gATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAgg < 7:108507/148‑1 (MQ=255) aTGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGc > 1:167982/1‑149 (MQ=255) ccATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGcc > 8:362985/1‑149 (MQ=255) ccATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGcc > 7:98079/1‑149 (MQ=255) ccATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGcc < 2:39589/149‑1 (MQ=255) cATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCt > 7:161413/1‑149 (MQ=255) aTCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCtt < 7:41146/149‑1 (MQ=255) tctctAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCt > 7:8803/1‑149 (MQ=255) tctAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTg < 5:243131/145‑1 (MQ=255) tctAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCt < 8:9121/147‑1 (MQ=255) tctAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCt < 5:112660/147‑1 (MQ=255) tctAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCGGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTg < 7:166197/145‑1 (MQ=255) aaGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTg > 5:139845/1‑149 (MQ=255) aGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTGCCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAg < 6:334878/146‑1 (MQ=255) cTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCgg < 4:317566/149‑1 (MQ=255) ttCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCTCAACCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCgg > 1:306605/1‑148 (MQ=255) gAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGaa < 7:91014/146‑1 (MQ=255) gAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATa < 6:275924/148‑1 (MQ=255) gAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATAc < 1:350815/149‑1 (MQ=255) gTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCa < 2:231967/149‑1 (MQ=255) tGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCAt < 3:10711/149‑1 (MQ=255) ccTCTTTTGCCCCCTCCCGGCGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTg < 5:363588/149‑1 (MQ=255) ctctTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTgg > 3:327887/1‑149 (MQ=255) tttGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTAc > 5:214198/1‑149 (MQ=255) ccccTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCa < 5:36930/136‑1 (MQ=255) ccccTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCa > 6:36930/1‑136 (MQ=255) ccGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCg < 1:234195/148‑1 (MQ=255) ccGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGa < 2:167982/149‑1 (MQ=255) gtgtgtCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTg < 7:362985/149‑1 (MQ=255) tgtgtCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGc < 1:114430/149‑1 (MQ=255) tgtgtCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGc < 8:161413/149‑1 (MQ=255) tgtgtCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGc < 3:233175/149‑1 (MQ=255) tgtCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGcc > 3:26641/1‑148 (MQ=255) tCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAAt > 3:223115/1‑149 (MQ=255) cAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATc < 7:224216/148‑1 (MQ=255) cAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATc < 6:77796/148‑1 (MQ=255) cAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATc < 8:8803/148‑1 (MQ=255) aGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGAc > 8:280343/1‑149 (MQ=255) ccGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGaa < 1:60345/149‑1 (MQ=255) gATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGACTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATATCGACCTTGCCAATCCAGACGAACt > 4:160921/1‑149 (MQ=255) cgcCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGccc > 5:64074/1‑148 (MQ=255) gcCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCAt > 6:198705/1‑149 (MQ=255) cccAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATc < 5:198705/149‑1 (MQ=255) ccAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGCCGAACTGCCCATc > 8:92203/1‑148 (MQ=255) ccAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATc > 8:292113/1‑148 (MQ=255) aTCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCt > 5:184404/1‑149 (MQ=255) ttGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAg > 8:320227/1‑148 (MQ=255) ttGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAg > 1:302087/1‑148 (MQ=255) tCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAgcacg > 4:174181/1‑149 (MQ=255) aGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAgcacgca < 2:211077/149‑1 (MQ=255) tcaggCCGTACCACCATGGTGGTACGGCGTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAgcacgcac > 4:45969/5‑149 (MQ=255) tcaggCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGCCGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAgcacgcac > 5:307520/5‑149 (MQ=255) 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ccaccaTGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACAATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCAAGCACGCCGCGGcc > 6:195361/1‑148 (MQ=255) accaTGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCACGCACGCCGCGGCCAAt > 2:131014/1‑149 (MQ=255) ccaTGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCACGCTCGCCGCGGCCAATc < 2:306605/149‑1 (MQ=255) ccaTGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCACGCACGCCGCGGCCAAt > 7:125528/1‑148 (MQ=255) aTGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCATGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCATCACGCACGAAGCGGCCAATCAt > 7:323021/1‑149 (MQ=255) 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cGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCACGCACGCCGCGGCCAATCATGTTGCTCa < 7:320227/148‑1 (MQ=255) ccTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCACGCACGCCGCGGCCAATCATGTTGCTCATGtt < 1:104962/149‑1 (MQ=255) ctgactgaCGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCACGCACGCCGCGGCCAATCATGTTGc < 1:366909/141‑1 (MQ=255) ctgactgaCGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCACGCACGCCGCGGCCAATCATGTTGc > 2:366909/1‑141 (MQ=255) ctgactgaCGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCACGCACGCCGCGGCCAATCATGTTGCTCATGTTc > 6:172084/1‑149 (MQ=255) | GGTCTCCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCCCATCTCTCTAAGCTTCTGGAGTGCCTCTTTGGCCCCCTCCCGGGGTGTGTCCAATAGCCCGATAGCGCCCAGATCCTTGTCAGCACGCCGTACCACCATGGTGGTACGGCCTGACTGACGTAGACGCTCCGCAGCCTCCAGGGCTGCCTTGCTGAGTGCGGGAATACCATTGGTACCGAACATCTCGACCTTGCCAATCCAGACGAACTGCCCATCAAGCTCAGCACGCACGCCGCGGCCAATCATGTTGCTCATGTTC > NC_002947/43982‑44274 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |