| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 223,870 | G→C | 7.5% | G233G (GGG→GGC) ‡ | PP_0171 → | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 223,870 | 0 | G | C | 7.5% | 255.5 / 9.2 | 80 | G233G (GGG→GGC) ‡ | PP_0171 | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/38); new base C (4/2); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.09e-01 | |||||||||||
CCCTGGATGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGTTCAAC > NC_002947/223722‑224014 | cccTGGATGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCgggg > 6:158708/1‑149 (MQ=255)cccTGGATGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCgggg > 1:334286/1‑149 (MQ=255) gATGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCgg < 3:44947/147‑1 (MQ=255) gATGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGGTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGt > 8:81913/1‑149 (MQ=255) gATGCGCGGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCgg < 2:34147/147‑1 (MQ=255) tGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACAGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTgc < 8:178618/149‑1 (MQ=255) cgcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTgcgc < 2:59776/149‑1 (MQ=255) cgcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGCCCCGGGTgcgg < 5:60114/149‑2 (MQ=255) cgcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGCCCCGGGTgcgg < 4:121845/149‑2 (MQ=255) gcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCg < 1:282755/141‑1 (MQ=255) gcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCg > 2:282755/1‑141 (MQ=255) tGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGGTGTGGGAGGAAGTGGGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGcc > 4:298619/1‑149 (MQ=255) tGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCAAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGcc > 3:42638/1‑149 (MQ=255) gACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGcc > 6:348030/1‑148 (MQ=255) cccGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGCGGAAGTGCGGTGCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTGGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAg < 4:311463/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAgg > 3:205823/1‑149 (MQ=255) cGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGt < 2:269937/149‑1 (MQ=255) cGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGt > 7:18833/1‑149 (MQ=255) cGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGt > 4:166487/1‑149 (MQ=255) gcgcAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGc < 6:349270/149‑1 (MQ=255) aaGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAg > 7:121024/1‑149 (MQ=255) gATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGcc < 3:298619/149‑1 (MQ=255) gATGCAGGAAGAGCTGTTGCGGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGcc < 4:109840/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATc < 2:121347/148‑1 (MQ=255) ggAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCAAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAAt < 4:42638/149‑1 (MQ=255) aaGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAc < 3:67841/149‑1 (MQ=255) gCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCC < 1:39369‑M1/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTggg < 5:158708/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTG < 4:119470‑M1/147‑1 (MQ=255) tgctgTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGc > 8:32818/1‑149 (MQ=255) ggaggaAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCaa > 2:178752/1‑127 (MQ=255) ggaggaAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCaa < 1:178752/127‑1 (MQ=255) gaggaAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTgg < 7:32818/149‑1 (MQ=255) 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ccTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGACTGGGTGGCAGCGACTTccaggc < 4:256098‑M2/147‑7 (MQ=255) ccTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGGTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGGGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCa < 1:372977/149‑1 (MQ=255) ttgttCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGaagtcgctgccacccaggctgcccaggccgta < 8:18833‑M1/147‑33 (MQ=255) ttCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCTTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGaagtcgctgccacccaggctgcccaggccgtattgat < 4:294853‑M1/149‑38 (MQ=255) aCCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTAt > 7:81368/1‑149 (MQ=255) cccACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATc > 1:60034/1‑149 (MQ=255) aCTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGCCGGGCACTGGCCTGGaagtcgctgccacccaggctgcccaggccgtattgat < 2:84298‑M1/149‑38 (MQ=255) aCTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTccaggc < 7:261897‑M2/130‑7 (MQ=255) aCTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTccaggc > 8:261897‑M2/1‑124 (MQ=255) cATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGtt < 3:166487/149‑1 (MQ=255) tCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTg > 7:307703/1‑149 (MQ=255) gaagaaGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCt < 2:334286/149‑1 (MQ=255) gaagaaGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCt > 8:254807/1‑149 (MQ=255) aagaagCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTg > 2:273662/1‑149 (MQ=255) gaagCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGtt < 8:307703/149‑1 (MQ=255) 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ttgtCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACaa > 4:168109/1‑149 (MQ=255) tCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCt > 2:326888/1‑149 (MQ=255) gccgcACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTg > 4:15543/1‑149 (MQ=255) gccgcACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTG > 4:140671‑M1/1‑52 (MQ=255) gccgcACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTG < 3:140671‑M1/52‑1 (MQ=255) cgcgcACCCGCCCCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTg > 3:87519/3‑149 (MQ=255) gcgcACCCGCCCCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTgg > 5:326391/2‑149 (MQ=255) gcgcACCCGCCCCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTgg > 2:218893/2‑149 (MQ=255) ccgcACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTgg < 2:60034/149‑1 (MQ=255) ccgcACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTgg > 4:285721/1‑149 (MQ=255) gcACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGt > 5:185420/1‑149 (MQ=255) gcACCCGCCCCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGt > 1:137768/1‑149 (MQ=255) cccGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGTTc > 1:308328/1‑148 (MQ=255) cGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGTTCAAc > 4:214610/1‑149 (MQ=255) | CCCTGGATGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAG‑TGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGTTCAAC > NC_002947/223722‑224014 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |