Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,674,290 | A→G | 7.5% | L89P (CTC→CCC) | PP_3238 ← | transcriptional regulator PyrR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,674,290 | 0 | A | G | 7.5% | 148.7 / 2.5 | 53 | L89P (CTC→CCC) | PP_3238 | transcriptional regulator PyrR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/25); new base G (2/2); total (26/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.60e-01 |
GAGCACCGCGCTGATGAGGTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCTCACCACGCCGCTGAATGCCTAC > NC_002947/3674142‑3674438 | gaGCACCGCGCTGATGAGGTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGtga < 3:249780/149‑1 (MQ=255) ccGCGCTGATGAGGTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGtgagttga < 5:53725/149‑1 (MQ=255) ccGCGCTGATGAGGTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGtga < 8:55660/144‑1 (MQ=255) ccGCGCTGATGAGGTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGtga > 7:55660/1‑144 (MQ=255) cgcgCTGATGAGGTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGtgagttgag > 3:310279/1‑149 (MQ=255) gcgcTGATGAGGTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGtgagttgagt < 4:240212/149‑1 (MQ=255) cTGATGAGGTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATg < 3:201235/149‑1 (MQ=255) atgaGGTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATgc < 7:139017/147‑1 (MQ=255) gTGGCGCGCCCCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGCTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGc > 1:258748/1‑148 (MQ=255) gTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGc > 5:105982/1‑148 (MQ=255) gcgcACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGTAAGAgg < 4:310279/149‑1 (MQ=255) gTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAag > 4:320029/1‑137 (MQ=255) gTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAag < 3:320029/137‑1 (MQ=255) ggCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCt < 2:198446/148‑1 (MQ=255) ggCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTg < 8:272507/149‑1 (MQ=255) gAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCa > 1:229800/1‑148 (MQ=255) aGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAgcgc < 6:105982/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCAGGTCATCGACCAGCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGTTGGAGCTTGGGGAGTTCCGGGTTTTCTGTTAGTTGAGTATGCGCATGCAAGATTCTCATTTCGTCTGCA‑TAGCGCtt < 4:171298/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGAAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCtt < 6:210077/149‑1 (MQ=255) gCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGtgagtt > 4:270239/1‑98 (MQ=255) gCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGtgagtt < 3:270239/98‑1 (MQ=255) aGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCgg > 3:184249/1‑149 (MQ=255) gCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCggg < 2:229800/149‑1 (MQ=255) gCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCggg < 5:118392/149‑1 (MQ=255) agagagTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTa < 5:248028/149‑1 (MQ=255) agagTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTa > 2:337727/1‑147 (MQ=255) gTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCg < 3:198944/149‑1 (MQ=255) tGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCgg > 3:3741/1‑149 (MQ=255) ccTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCaa < 6:135389/149‑1 (MQ=255) cTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTagag > 5:285595/1‑142 (MQ=255) cTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTACGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTagag < 6:285595/142‑1 (MQ=255) cGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGTGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATg‑g < 2:258748/148‑1 (MQ=255) gTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑gcg > 4:346754/1‑149 (MQ=255) cACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCAc > 7:97297/1‑149 (MQ=255) cATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGGGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGtt > 1:273118/1‑148 (MQ=255) cATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGGGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGtt > 1:267697/1‑148 (MQ=255) cATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCt > 5:380578/1‑98 (MQ=255) cATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCt < 6:380578/98‑1 (MQ=255) caGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑gcg < 1:21659/128‑1 (MQ=255) caGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTg > 7:114440/1‑147 (MQ=255) caGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTg > 3:239423/1‑147 (MQ=255) caGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTg > 2:274805/1‑147 (MQ=255) caGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTAAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑gcg > 2:21659/1‑128 (MQ=255) aGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAg > 2:100951/1‑149 (MQ=255) aGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAg < 4:184249/149‑1 (MQ=255) cAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCgg < 6:62125/108‑1 (MQ=255) aaGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTg < 3:346754/149‑1 (MQ=255) cGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGGGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAgg < 2:273118/149‑1 (MQ=255) cGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGGGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAgg < 2:267697/149‑1 (MQ=255) gCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGgcg > 5:322397/1‑149 (MQ=255) ggTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTgc > 4:286557/1‑149 (MQ=255) ggTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTgc < 3:286557/149‑1 (MQ=255) ggCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCgg < 4:3741/147‑1 (MQ=255) ggCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCt > 6:249948/1‑149 (MQ=255) gCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATGAGCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCt < 1:100951/149‑1 (MQ=255) cGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCTCACCAcgcc > 2:146431/1‑149 (MQ=255) gggTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCAGTAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCTCACCAcgcc > 1:291468/1‑149 (MQ=255) tttCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCTCACCACGCCGCTg > 8:197396/1‑148 (MQ=255) ggTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCTCACCACGCCGCTGAATGc > 6:61960/1‑149 (MQ=255) gTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCTCACCACGCCGCTGAATGcc < 6:322397/149‑1 (MQ=255) gTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCTCACCACGCCGCTGAATGcc > 6:375142/1‑149 (MQ=255) agttgagtATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCACTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCTCACCACGCCGCTGAATGCCTAc < 1:274805/149‑1 (MQ=255) | GAGCACCGCGCTGATGAGGTGGCGCGCACCCAGTTCGGCGAGGTAGGCGCAGGTGCGTAGCAGAGAGTGCCCTTCGTAGAGCACGTCATCGACCACCAGCAAGGTGGTTCCGGCAAGGTCGAGCTTGGCGAGTTCCGGGTTTTCGGTGAGTTGAGTATGCGCATGCAAGAGGCTCAGGTCGTCTGCA‑TAGCGCTTGACCTTGATCGGGTAGAGCGGCAATG‑GCGCAGCACCGTTCAGTGCTTGCAGGTGCAGTTGCAGGCGCTGCGCCAGCGGCTCACCACGCCGCTGAATGCCTAC > NC_002947/3674142‑3674438 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |