| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,865,973 | C→T | 8.0% | R302Q (CGG→CAG) | PP_3415 ← | LacI family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,865,973 | 0 | C | T | 8.0% | 173.1 / 4.3 | 63 | R302Q (CGG→CAG) | PP_3415 | LacI family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/32); new base T (3/2); total (29/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.59e-02 | |||||||||||
GAGTCGCGCGAGAAGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGGTCGTCGTTACAGA > NC_002947/3865827‑3866120 | gAGTCGCGCGAGAAGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGccgcccgc > 7:219264/1‑149 (MQ=255) gcgcgAGAAGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGgt‑gt > 1:224074/1‑149 (MQ=255) gcgcgAGAAGGCCTTGGCGGGCACTCACAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGgt‑gt > 1:9123/1‑149 (MQ=255) cgcgAGAAGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAACGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGGCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCGGGCTGCGgt‑ggg < 2:344876/149‑3 (MQ=255) cgAGAAGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCg < 6:140427/149‑1 (MQ=255) gagaAGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTTCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGa < 1:304858/149‑1 (MQ=255) gagaAGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGt‑gtggcg < 2:9123/149‑4 (MQ=255) gagaAGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAAATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCACACCGCGGGCTGCGgt‑ggggcg < 7:183593/149‑6 (MQ=255) gaAGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAAt > 7:222159/1‑149 (MQ=255) aaGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATg < 2:345036/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGa < 7:102458/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAg < 7:314665/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAg < 2:165311/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAg < 5:293034/149‑1 (MQ=255) gggCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCg > 6:148108/1‑149 (MQ=255) tctcAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCAc > 8:317968/1‑149 (MQ=255) tctcAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCAc > 5:65349/1‑149 (MQ=255) tctcAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCAc > 4:294815/1‑149 (MQ=255) tctcAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGCG‑GTGCGAATGGAGGTACGCCGTGGCa > 8:181296/1‑148 (MQ=255) tcAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCAc < 4:249053/147‑1 (MQ=255) tctctctcAACATCAGATCAAAGCCAAGATCCTTCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCAAGCAGCGCCAGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCACCCAGCCGG‑CTGCGAATGGACGACAGACGTGGCACCATAAGCGcc > 8:315683/1‑149 (MQ=255) tcGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCCGCCCGCGGG‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGcc > 7:297178/1‑147 (MQ=255) tcGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACACGCTTCCCATCCATCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGcc > 7:291904/1‑147 (MQ=255) gcgcACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGa < 8:275220/147‑1 (MQ=255) aCCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCgg < 6:146301/149‑1 (MQ=255) aCCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCgg < 3:294815/149‑1 (MQ=255) cATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGga < 5:25424/149‑1 (MQ=255) tCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCgg > 3:203690/1‑145 (MQ=255) tCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCgg > 5:148687/1‑145 (MQ=255) cTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGt > 2:297785/1‑149 (MQ=255) aaaGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGtt < 3:349444/147‑1 (MQ=255) aaaGCCCAGATCCCGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATTGtt < 5:355634/147‑1 (MQ=255) cccAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAAcc > 6:258235/1‑149 (MQ=255) ccAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAAcc > 7:305081/1‑148 (MQ=255) ccAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAAcc > 3:322503/1‑148 (MQ=255) aGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGAc > 3:21120/1‑149 (MQ=255) gctgcGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGc > 5:11969/1‑148 (MQ=255) aTTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGc < 6:148687/149‑1 (MQ=255) cGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGt < 5:148108/148‑1 (MQ=255) gCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTcc < 4:203690/149‑1 (MQ=255) cccATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCAccc > 3:217855/1‑149 (MQ=255) cccATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCAc < 2:224074/147‑1 (MQ=255) cccATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCAc < 7:181296/147‑1 (MQ=255) ccATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCAcccc < 4:217855/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGTACCTCCACCCCtt < 7:315683/149‑1 (MQ=255) aTCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCtt > 4:228229/1‑149 (MQ=255) cAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGa < 6:11969/148‑1 (MQ=255) aGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACg > 7:169639/1‑149 (MQ=255) gCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACg > 8:5268/1‑148 (MQ=255) aaCGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCaa < 5:87854/149‑1 (MQ=255) aaCGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCaa < 8:169639/149‑1 (MQ=255) aCGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAg < 4:21120/149‑1 (MQ=255) gcgcCTTTTCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATTGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCAGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCTACCATCGCCACCTGTCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTgcagc < 7:270533/149‑1 (MQ=255) cgcCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTgcagca > 6:389189/1‑149 (MQ=255) ccTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCAcc < 7:317968/149‑1 (MQ=255) ccGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGcc < 4:322503/148‑1 (MQ=255) cgccccgcccCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGa < 8:305081/149‑1 (MQ=255) cgcacACCGCGGGCTGCGGTGGGGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAg > 2:366253/5‑149 (MQ=255) cccACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGgtc < 8:222159/149‑1 (MQ=255) cacACCGCGGGCTGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGgtc > 6:161852/3‑149 (MQ=255) cacACCGCGGGCTGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGgtc > 5:8736/3‑149 (MQ=255) ccACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCTGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGgtcg > 2:324334/1‑149 (MQ=255) cACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGgtcgt > 5:220286/1‑149 (MQ=255) aCCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGgtcgtc < 5:389189/149‑1 (MQ=255) cccGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGGTCGTCGTTa > 5:155872/1‑146 (MQ=255) cccGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGGTCGTCGTTACag < 1:297785/149‑1 (MQ=255) ccGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGGTCGTCGTTACaga < 6:65349/149‑1 (MQ=255) ccGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGGTCGTCGTTACaga < 1:252826/149‑1 (MQ=255) cgcgGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGGTCGTCGTTACag > 7:173785/1‑147 (MQ=255) | GAGTCGCGCGAGAAGGCCTTGGCGGGCACTCTCAGGTGCTCTCGCGCACCATCAGCTCAAAGCCCAGATCCTGCTGCGCATTCGTCACCCGCTTCCCATCCAGCAACGCCAGCAGCGCCTGTGCCGCGCCCCGCCCCACCGCAGCCCGCGGT‑GTGCGAATGGAGGTCAGCCGTGGCACCATATGCGCCGAGGCCGGGAGATCGTTGAAACCGACCATCGCCACCTGGCGTGGCACCTCCACCCCTTGACGCAAGGCCTGCAGCACCGCGCCCTGAGCCAGGTCGTCGTTACAGA > NC_002947/3865827‑3866120 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |