| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,106,357 | G→C | 8.9% | S205R (AGC→AGG) ‡ | PP_3613 ← | L‑sorbosone dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,106,357 | 0 | G | C | 8.9% | 237.5 / 10.4 | 78 | S205R (AGC→AGG) ‡ | PP_3613 | L‑sorbosone dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/32); new base C (3/4); total (42/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.92e-01 | |||||||||||
GTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCTACATACAGCTTGCCGTTG > NC_002947/4106210‑4106504 | gTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGAGTTCGCCGGACTCGGCATAAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGAGCTACACCTCCCGGCCGCCCTCGGTGATGATGCTCTTAGCGCCGATAACCACATACAAGATGCGAACATACGGGc > 6:286140/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGCTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGACGCGACCATCCGGGCTGATg > 7:153771/1‑149 (MQ=255) gCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGAGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATg > 2:83879/1‑149 (MQ=255) aaGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGt > 8:31197/1‑149 (MQ=255) aGCCTGTGGCATAGGGCCTGTGTGCGCCGTTCTCGGCATCAACCTGGCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGTTGTTGCTGTTCGAGCGGATGCCCACATACAAGAAGCGACCATCAGCCCGGATGGTc < 7:159549/149‑1 (MQ=255) aGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCTATACCCACATACAAGAAGCGACCATCAGCCCGGATGGTc < 8:206866/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGt > 3:43827/1‑147 (MQ=255) gCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCa < 3:340927/149‑1 (MQ=255) ccGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAg < 5:392204/149‑1 (MQ=255) ccGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCAGCCCGGATGGTcgc < 4:280712/149‑3 (MQ=255) cGGTGTCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAgg < 6:252954/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAgg < 5:351087/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCAGCCCGGATGGTcgct < 1:99687/149‑4 (MQ=255) tGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGcc < 5:122019/149‑1 (MQ=255) cATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTg < 7:200317/149‑1 (MQ=255) aTAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTgg > 6:226690/1‑149 (MQ=255) ggCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTcc > 2:286309/1‑148 (MQ=255) gCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCaa < 5:226690/149‑1 (MQ=255) ggTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAAtgg > 4:357005/1‑149 (MQ=255) tctcGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCa < 2:234291/149‑1 (MQ=255) cGGCATCACCCTGCCAGACCATGGCCCGATCGAGCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGcc < 8:318417/149‑1 (MQ=255) gCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCgg < 6:238183/149‑1 (MQ=255) aTCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCt < 2:69766/119‑1 (MQ=255) aTCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCt > 1:69766/1‑119 (MQ=255) aaCCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGt > 4:310725/1‑149 (MQ=255) ccTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCg > 8:72774/1‑149 (MQ=255) cTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCgg > 2:72710/1‑149 (MQ=255) ccAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGa < 3:357005/149‑1 (MQ=255) cATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCttgg > 1:279439/1‑149 (MQ=255) gggCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGATCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGGGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCttggtt < 2:287571/148‑1 (MQ=255) gCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCttggttgg > 2:63838/1‑149 (MQ=255) cgatcgatCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCgg > 5:86575/1‑149 (MQ=255) gatcgatcTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCggg > 7:17244/1‑149 (MQ=255) gatcTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGt > 6:279435/1‑149 (MQ=255) tctcCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCg > 5:11823/1‑149 (MQ=255) cACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTAGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCt > 3:16347/1‑149 (MQ=255) aCCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTg > 4:237985/1‑149 (MQ=255) ccTCCAGGCCGAGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTgg < 1:83879/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGt > 3:101129/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGt > 2:475/1‑149 (MQ=255) gcgcTCGGTGATGTTGATGTTCGATCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCATTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGAGGGCCGTCgg > 3:139484/1‑134 (MQ=255) tCGGCGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttcctt < 5:201220/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGccttcctt < 7:72774/147‑1 (MQ=255) ggTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTg < 5:279435/148‑1 (MQ=255) gTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTa < 1:475/149‑1 (MQ=255) aTGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGt < 1:72710/148‑1 (MQ=255) aTGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGt > 2:148585/1‑148 (MQ=255) ttGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCaaa < 8:17244/149‑1 (MQ=255) ttCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGTGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCAc < 1:148585/149‑1 (MQ=255) gAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAg > 6:345841/1‑149 (MQ=255) gAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCCGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCa < 2:279439/148‑1 (MQ=255) aTACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATc > 7:238807/1‑149 (MQ=255) tACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATcc < 5:345841/149‑1 (MQ=255) cccACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTg < 7:31197/149‑1 (MQ=255) ccACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCGTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTgg > 4:248994/1‑149 (MQ=255) ccACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTgg > 8:166367/1‑149 (MQ=255) ccACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTgg > 1:243050/1‑149 (MQ=255) ccACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTgg > 3:104843/1‑149 (MQ=255) cacaTACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGt < 3:310725/149‑1 (MQ=255) acaTACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCTTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGtt < 1:63838/149‑1 (MQ=255) acaTACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATCGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTCGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCTAAGCGAACCAGCGCATCCTGGtt > 8:238717/1‑149 (MQ=255) tACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTa > 6:369345/1‑119 (MQ=255) tACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTa < 5:369345/119‑1 (MQ=255) cAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCta < 3:237985/149‑1 (MQ=255) aagaagCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGtt < 4:175278/143‑1 (MQ=255) aagaagCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGtt > 3:175278/1‑143 (MQ=255) agaagCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGc < 4:49016/145‑1 (MQ=255) agaagCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGc > 3:49016/1‑145 (MQ=255) aagCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCtacata > 7:47459/1‑149 (MQ=255) gCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCtacata > 3:73325/1‑147 (MQ=255) ctgACCATCAGCCCGGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCtacata > 7:212620/3‑147 (MQ=255) ctgACCATCAGCCCGGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCtacata > 3:205417/3‑147 (MQ=255) ctgACCATCAGCCCGGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTGGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCtacata > 4:72465/3‑147 (MQ=255) gACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCta < 8:223717/141‑1 (MQ=255) gACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCta > 7:223717/1‑141 (MQ=255) aCCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTgg < 7:251934/137‑1 (MQ=255) aCCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTgg > 8:251934/1‑137 (MQ=255) cATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCTACATACAGCTTg > 7:265158/1‑149 (MQ=255) ggCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCTACATACAGCTTGCCGTTg < 4:43827/149‑1 (MQ=255) ggCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCTACATACAGCTTGCCGTTg < 4:101129/149‑1 (MQ=255) | GTTACGCAAGCCGGTGGCATAGGGCCGGTGTGCGCCGGTCTCGGCATCAACCTGCCAGACCATGGCCCGATCGATCTCCACCTCCAGGCCGCGCTCGGTGATGTTGCTGTTCGAGCCGATACCCACATACAAGAAGCGACCATCCGGGCTGATGGTCAGGGCCTTGGTCCAATGGTGGTTGATTTCAGCCGGCAGGTCGGTGACCTTGGTTGGCGGGCCGTCGGCCTGGGTCTGGCCTTCCTTGTAGTCAAAGCGCACCAGCGCATCCTGGTTGGCTACATACAGCTTGCCGTTG > NC_002947/4106210‑4106504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |