| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,244,986 | C→A | 7.9% | G12V (GGC→GTC) | aruH ← | arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,244,986 | 0 | C | A | 7.9% | 241.0 / 7.0 | 76 | G12V (GGC→GTC) | aruH | arginine‑‑pyruvate transaminase AruH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/36); new base A (4/2); total (38/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
GCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATTTCTTCCATCT > NC_002947/4244838‑4245127 | gCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGc > 4:274431/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGcc > 2:362524/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCg > 6:204488/1‑149 (MQ=255) gcgcgcAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGc < 7:363715/149‑1 (MQ=255) gcAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCATCGCCGG‑CGACGGCGCTg < 7:141063/149‑1 (MQ=255) tGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTgg > 7:160317/1‑149 (MQ=255) tCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTgg < 5:15062/147‑1 (MQ=255) tCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGt < 3:330463/149‑1 (MQ=255) cGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTg < 6:259061/149‑1 (MQ=255) gATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTg < 6:264691/148‑1 (MQ=255) cgccTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTgg < 3:340545/139‑1 (MQ=255) cgccTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTgg > 4:340545/1‑139 (MQ=255) gccTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGc < 5:277279/149‑1 (MQ=255) cTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑TGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCg > 4:196450/1‑148 (MQ=255) gacgaTAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTa < 7:171896/147‑1 (MQ=255) tAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATg < 1:362524/149‑1 (MQ=255) ggCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGc < 4:62732/149‑1 (MQ=255) gAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTcc > 7:317489/1‑149 (MQ=255) aGTGTCGAAGGCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCt < 7:182573/149‑1 (MQ=255) tCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTc > 1:376633/1‑148 (MQ=255) tCGAAGGCCGGGTCACCCACCGACATCAGCACGATGGCCTTGTCCTCACCCTGCAGCGCCATGGCGCGGTAGTGGATGGCCCAGGCCGCATCGCCGTCCGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCttt < 1:291009/148‑1 (MQ=255) gAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGTGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCaa < 1:40406/148‑1 (MQ=255) gAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGGCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGc < 4:343456/123‑1 (MQ=255) aGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGGCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGGCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATgg < 3:224874/149‑1 (MQ=255) gggTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAAtt < 8:160317/149‑1 (MQ=255) ggTCACCCACCGTCAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAAttt < 8:317489/149‑1 (MQ=255) cccaccGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTc > 6:357991/1‑149 (MQ=255) cccccGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCGGGGGATGCGTTGGGGGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCGTTGCAATGGCAATTGCAGGcg > 4:33164/4‑149 (MQ=255) ccaccGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTc > 8:153022/1‑148 (MQ=255) ccaccGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTc > 1:349146/1‑148 (MQ=255) ccaccGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTc > 6:134342/1‑148 (MQ=255) caccGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTcga > 4:70206/1‑149 (MQ=255) accGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCGTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGc < 1:241648/107‑1 (MQ=255) accGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGc > 2:241648/1‑107 (MQ=255) cagcagcagGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTa > 8:101840/1‑149 (MQ=255) cagcagGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCt > 8:259551/1‑149 (MQ=255) cagcagGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATCGCAATTTCAGTCGACGAGTATCt > 3:275278/1‑149 (MQ=255) agcagGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCtt > 5:355282/1‑149 (MQ=255) agcagGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCtt > 3:184371/1‑149 (MQ=255) tccttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGa < 5:204488/149‑1 (MQ=255) cttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑TGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGaa < 3:196450/148‑1 (MQ=255) ttgtcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAAtt > 3:310654/1‑149 (MQ=255) tcctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGcc < 2:349146/149‑1 (MQ=255) ctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATTTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGcca > 7:343192/1‑147 (MQ=255) ctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTgg > 4:367400/1‑140 (MQ=255) ctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTgg < 3:367400/140‑1 (MQ=255) ctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGcccc < 7:259551/149‑1 (MQ=255) ctCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGccc > 6:370675/1‑148 (MQ=255) aGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATa < 3:274431/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGgtg > 4:140211/1‑149 (MQ=255) aGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTGGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGtt > 3:20858/1‑128 (MQ=255) aGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTGGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGtt < 4:20858/128‑1 (MQ=255) aGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATc > 7:27578/1‑149 (MQ=255) gggCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCggg > 8:308919/1‑119 (MQ=255) gggCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCggg < 7:308919/119‑1 (MQ=255) 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gATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCATTTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTTCAAATCGGCGAGCAAcgcgg > 1:36901/1‑148 (MQ=255) gATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGa > 3:166587/1‑140 (MQ=255) gATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGa < 4:166587/140‑1 (MQ=255) cccAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCttt < 7:251983/68‑1 (MQ=255) cccAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCttt > 8:251983/1‑68 (MQ=255) ccaacGCATCGCCGG‑CGACGGCGCTGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGa < 2:297741/128‑1 (MQ=255) ccaacGCATCGCCGG‑CGACGGCGCTGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGa > 1:297741/5‑132 (MQ=255) ccaacGCATCGCCGG‑CGACGGCGCTGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGAtt > 7:91525/5‑149 (MQ=255) ccGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATttct < 2:376633/149‑1 (MQ=255) cGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATttctt > 4:339666/1‑149 (MQ=255) cGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATttctt < 8:27578/149‑1 (MQ=255) gCATCGCCGG‑CGACGGCGCTGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTT‑GAAATGCCCCAAAAGGGGTTAAAAAAGGCGAGCAAAGCGCCGGTTGAttaatg > 5:6848/1‑144 (MQ=255) gCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATCCGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATttcttc > 3:53606/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATttcttc < 6:340660/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATttcttc > 5:340660/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATttcttc < 7:101840/149‑1 (MQ=255) atcgcCGG‑CGACGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATTTCTTCCa > 1:336374/3‑149 (MQ=255) gcCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATTTCTTCCAtct > 2:15194/1‑149 (MQ=255) | GCCAGCGCGCAGGCTGTCGATGGCCGCCTCGACGATAGGCGCGGGAGTGTCGAAGTCCGGGTCACCCACCGACAGCAGCAGGATGTCCTTGTCCTCAGCCTGCAGCGCCAGGGCGCGGTAGTGGATGTCCCAGGCCGCAGCGCCGT‑CGCCGGCGATGCGTTGGGTGAGCTTGGCGTAGCGCATGGCAATCTCCTTTCAATGGCAATTTCAGTCGACGAGTATCTTCGGGTTGGAATTGCCCCATACGGTGTACAAATCGGCGAGCAACGCGCC‑GTTGATTTCTTCCATCT > NC_002947/4244838‑4245127 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |