| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,273,231 | A→T | 7.7% | Y216N (TAC→AAC) | glcC ← | transcriptional regulator GlcC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,273,231 | 0 | A | T | 7.7% | 232.7 / 6.0 | 77 | Y216N (TAC→AAC) | glcC | transcriptional regulator GlcC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/34); new base T (3/3); total (40/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCCAGCCATCCATACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCACT > NC_002947/4273090‑4273375 | cccAGCCATCCATACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACcgc < 8:153485/149‑1 (MQ=255) atccatACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCAtgct > 5:211731/1‑149 (MQ=255) atccatACGCATGGGCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCAtgct < 2:208702/149‑1 (MQ=255) atACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTTGTACCGCGCagtcat < 7:207860/146‑6 (MQ=255) atACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTTGTACCGCGCagtcat > 8:207860/1‑141 (MQ=255) gCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATc > 7:321213/1‑148 (MQ=255) gCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATc > 1:297702/1‑148 (MQ=255) gTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTg < 4:364784/149‑1 (MQ=255) tCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTgg < 6:188453/149‑1 (MQ=255) gCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCg < 6:211731/149‑1 (MQ=255) ccTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTTGTACCGCGCagtcat > 1:148499/1‑127 (MQ=255) ccTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTTGTACCGCGCagtcat < 2:148499/132‑6 (MQ=255) ccAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTgc > 2:131493/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTgcg > 5:84002/1‑149 (MQ=255) ggCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCt < 6:84002/149‑1 (MQ=255) tgctCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTTGTACCGCGCagtcat > 6:36623/1‑114 (MQ=255) tgctCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTTGTACCGCGCagtcat < 5:36623/119‑6 (MQ=255) ctctTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCgg < 4:136812/148‑1 (MQ=255) ctctTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCgg > 3:136812/1‑148 (MQ=255) tctTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCgg > 3:110819/1‑147 (MQ=255) ctTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAg > 3:322491/1‑149 (MQ=255) ttCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCa < 3:168898/147‑1 (MQ=255) tCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgtt > 2:62607/1‑149 (MQ=255) tctcCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgttgtt > 7:255540/1‑148 (MQ=255) tcCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGAc > 7:28886/1‑149 (MQ=255) ccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgttgtt < 3:99257/144‑1 (MQ=255) ccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGa < 6:300299/146‑1 (MQ=255) ccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGAcc > 4:36191/1‑148 (MQ=255) ccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGAc < 8:321213/147‑1 (MQ=255) ccGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCGCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTAGAAgttgtt < 1:384701/144‑1 (MQ=255) cGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGa < 4:322491/149‑1 (MQ=255) tGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCaaa > 6:40929/1‑148 (MQ=255) tGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCaaa > 3:65168/1‑148 (MQ=255) gcgTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCg < 1:62607/149‑1 (MQ=255) cgTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGt < 7:217808/149‑1 (MQ=255) aTGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAggtg > 6:201535/1‑126 (MQ=255) gCCGTTGATATGCTCACGCGCCTCCCGCTCCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCCCGCATGCTGCCGATCAAACTGGAGTTTATGCGCTGACCGGAAGTACAAGTACTACACCGACGCAAACACCGTGATc > 4:61278/1‑148 (MQ=255) gCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTg < 6:380922/145‑1 (MQ=255) gCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTg > 5:380922/1‑145 (MQ=255) ccGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGTGTGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgttg > 1:79704/1‑124 (MQ=255) ccGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgttg < 2:79704/123‑1 (MQ=255) ccGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCaa > 1:215455/1‑149 (MQ=255) cGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAAc < 2:297702/149‑1 (MQ=255) cGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAAc > 4:254951/1‑149 (MQ=255) gTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATAAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCAGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACg > 2:244656/1‑149 (MQ=255) tatGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAgg < 3:36191/149‑1 (MQ=255) tatGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAg < 3:254951/148‑1 (MQ=255) tGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGt > 4:257629/1‑148 (MQ=255) cTCACGCGCCGCCCGCAGCGCCTGCTCGGGCAGA‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATCCAGCCGATCAATCTGGCGATTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTAGATGACCCACGCAAACACCGTGCTCAACGACAGGacac > 4:9404/1‑149 (MQ=255) tCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCCTGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCCCt > 4:377612/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgttgtt < 7:362455/109‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAgttgtt > 8:362455/1‑109 (MQ=255) gcgcCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACTCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGc > 6:144800/1‑149 (MQ=255) gcccgcTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTg < 8:33864/149‑1 (MQ=255) cccgcTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTg > 1:22042/1‑148 (MQ=255) cccgcTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTg > 5:284602/1‑148 (MQ=255) cccgcTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGc < 8:28886/149‑1 (MQ=255) gcTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAgg < 6:284602/149‑1 (MQ=255) tGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAggg > 2:386918/1‑148 (MQ=255) cTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCa > 6:10637/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCa > 7:93493/1‑149 (MQ=255) aGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTgg < 3:46707/149‑1 (MQ=255) aGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCAGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTgg < 1:183630/149‑1 (MQ=255) gttCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGtt < 5:40929/148‑1 (MQ=255) ttCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTAt < 4:110819/149‑1 (MQ=255) ttCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTAt > 8:327947/1‑149 (MQ=255) ttCCATGACTCCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTAt < 4:152604/149‑1 (MQ=255) cATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGc > 7:13660/1‑148 (MQ=255) cATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGc > 6:79965/1‑148 (MQ=255) cATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGc > 3:137448/1‑148 (MQ=255) cATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGc < 2:22042/148‑1 (MQ=255) aTGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGa > 8:314357/1‑149 (MQ=255) gcgGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCAc < 2:215455/149‑1 (MQ=255) gcgGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCAc > 1:209312/1‑149 (MQ=255) cgGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAAc < 8:278524/90‑1 (MQ=255) cgGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCACt < 8:255540/149‑1 (MQ=255) cgGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCACt < 8:93493/149‑1 (MQ=255) | CCCAGCCATCCATACGCATGGTCGCCCTGACCAGGCGCTGCTCTTCCTGCTCGATCTCCCGCAAACTGTCGCGTATGCCGTTGATATGCTCACGCGCCGCCCGCTGCGCCTGCTCGGGCAGT‑TGTTCCATGACTGCGCGGTACAACCGCGCATGCTGCCGATCAATCTGGCGTTTCTGCGCTGGCCGGCAGTACAAGTTGTTGACCGACGCAAACACCGTGCTCAACGTCAGGTCACTGAGCGATTGCAGGGTATGCACCAGCACTGGGTTATGCGACGCCTCACT > NC_002947/4273090‑4273375 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |