Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,126,647 | +C | intergenic (‑101/+48) | tdcG‑II ← / ← gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,126,645 | 1 | . | C | 88.5% | 159.1 / 15.2 | 52 | intergenic (‑99/+50) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/0); new base C (19/27); total (25/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.70e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAA‑CCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGG > NC_002947/1126499‑1126781 | ggAGGGGCTGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTAACCGCGAAT‑GCGGTGGTATAGCCACCATAG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑aaa > 5:374886/1‑147 (MQ=255) gAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAA‑c > 7:281361/1‑147 (MQ=255) ggtcgatgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAA‑cccgc < 1:331795/144‑4 (MQ=255) gccgatgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAA‑cccgct < 2:263912/147‑5 (MQ=255) atgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTa < 8:281361/147‑1 (MQ=255) tgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAATAGCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTa < 1:278391/147‑1 (MQ=255) gccgatCTTCAACCGCTCGAAGACGCTCAGTGACATGGCGCCCTCCTCCCAGGTTGTTGGGTGCACATTGACCCCTCTAGGCGC‑GGG‑ATTACACGCGAAT‑GCGGAGCTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTaca < 1:299939/147‑1 (MQ=25) atCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTTACCGCGAAT‑TCGGAGGTTTAGGCACCATAG‑CCTTAG‑C‑GGG‑G‑AAACCCGCGCCTACCCag‑a > 7:74106/1‑147 (MQ=255) tGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTTACCGCCCAA‑TCGGAGGGATAGGCACCAACG‑CAATAG‑C‑CGG‑TAAAA‑CCCCTCCCACACAA‑AG‑ccc > 4:356202/1‑147 (MQ=255) aaCAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTTACCCCCAAT‑GCGGAGGGATATCCCCCAACG‑CCTTCG‑CGGGG‑T‑AAC‑CCCCGCCTACACCG‑AG‑ccccc > 2:122289/1‑145 (MQ=255) aaCAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACag‑a < 5:282555/141‑1 (MQ=255) tCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCa < 6:351750/147‑1 (MQ=255) aGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTAGCC‑GGG‑A‑AAA‑CCGCTCCGAAAAAG‑AG‑ACCGCCACCCaac > 7:81794/1‑144 (MQ=38) gACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTTCCCCCGAAT‑TCGGAGGTATAGCCACCAACG‑CATTAG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCGCCGACACAG‑AG‑CCCGCCACCCCA‑GCC‑a > 2:264492/1‑147 (MQ=255) gTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGc < 1:82794/145‑1 (MQ=255) tcctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGG‑TTTACCCCCAAAG‑GGGGGGGT‑TAGCCACCCACGCCATAGC‑C‑GGG‑T‑AAA‑CCCCACCGAAACAA‑AGCCCCCCCCCCCAA‑CCC‑AGG‑GGGGGGGGGGGCGGTCAgg > 2:322616/1‑147 (MQ=255) tcctGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGGTTTTAACCCCAAAT‑‑AGGGGGTATATCCACCAAAG‑CAATAT‑CGGGG‑T‑AAA‑CCCCGACAAAAAAC‑AA‑CCCCCCCCCCAA‑ACC‑ACGTGGGGGGGGGGGCTaaaaag > 8:107770/1‑142 (MQ=255) gCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTAACCCCGGAT‑TGGGCGGGATAGGCAACATAG‑CATTAG‑C‑GGGTT‑AAC‑CCGCGCCTACACAC‑AG‑ACCGCCCCCCAA‑ACC‑CGGGGGCGGGGAGGGGTATCAGGCGTc > 2:32598/1‑147 (MQ=255) cAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTATCCGCGAAT‑GCGTAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTc < 4:259434/145‑1 (MQ=255) cAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCTCCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTc < 1:322616/145‑1 (MQ=255) cAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTc < 7:107770/145‑1 (MQ=255) cAGGTTGTGGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGT‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTcc < 4:129632/146‑1 (MQ=255) tttgttgGGTGGACATGGACCCCTGTCGGGGC‑GGT‑TTTCCGCGCTATG‑GGGGTGGAATAGCCACCATCG‑CATTCG‑G‑GGT‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGAt < 1:345433/146‑1 (MQ=255) tGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTAACCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTAG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCtcga > 2:54864/1‑147 (MQ=255) cgc‑gGG‑TTTCCCCGCGAAA‑GCCGACGTATAGCCACCACCG‑CCCTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAC‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGCGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGAAAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACAcc < 6:207298/147‑1 (MQ=255) gc‑gGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCa > 8:215163/1‑147 (MQ=255) ggttttACCCGGTATT‑GCGTAGGTATCGCCACAATCG‑CTTTCG‑C‑GGT‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAgg < 5:222699/144‑1 (MQ=255) gg‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGt < 3:101085/147‑1 (MQ=255) tttACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGAAGGGCAGGCGCACACCAGGTTg > 4:142369/1‑147 (MQ=255) ttACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGc < 1:264492/147‑1 (MQ=255) aCCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCg < 2:50419/146‑1 (MQ=255) ccGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CTTTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGt < 4:91828/146‑1 (MQ=255) ccGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTc > 3:43088/1‑147 (MQ=255) ccGCGAAA‑GCGGAGGTATACCCCCCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCCCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGTTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTc < 1:103948/147‑1 (MQ=255) cggtaaT‑GCGGTGGAATACCCACAATCC‑CATTCG‑G‑GGT‑T‑AAACCCGCCCCAACAAAGCCG‑CCCGCCACCCAACGCCTAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCgg < 1:122289/143‑1 (MQ=255) cgcgAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCg > 5:300698/1‑147 (MQ=255) cgcgAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCg > 4:144812/1‑147 (MQ=255) gcgAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGc > 7:84753/1‑147 (MQ=255) gAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGt > 2:99239/1‑147 (MQ=255) gAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGt > 7:164487/1‑147 (MQ=255) aGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGtt < 3:356202/147‑1 (MQ=255) aGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGtt > 7:144340/1‑147 (MQ=255) aGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGtt > 8:150322/1‑147 (MQ=255) ggTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTg < 1:99239/147‑1 (MQ=255) tataGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGt > 1:123096/1‑146 (MQ=255) atcttccaTCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GAC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCTTCCTGATAGCTCTCGATCGACTGGCAGGCGCACACCAGTTTGCTGTCTCCGAACACGTTGTCGa < 8:285578/141‑1 (MQ=255) aGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGAc > 7:41515/1‑147 (MQ=255) aGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGAc > 3:318224/1‑147 (MQ=255) caccaTCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCg > 4:341301/1‑147 (MQ=255) caccaTCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCg > 2:203823/1‑147 (MQ=255) caccaTCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCg < 1:203823/147‑1 (MQ=255) caccaTCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCg < 8:74106/147‑1 (MQ=255) tCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGa < 2:123096/147‑1 (MQ=255) tCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGa > 6:190265/1‑147 (MQ=255) cG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGAc < 1:54864/147‑1 (MQ=255) g‑c‑gGG‑T‑AAACCCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggcgg < 8:81794/146‑1 (MQ=255) | GGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC‑GGG‑TTTACCCGCGAAT‑GCGGAGGTATAGCCACCATCG‑CATTCG‑C‑GGG‑T‑AAA‑CCGCTCCTACACAG‑AG‑CCCGCCACCCAA‑GCC‑AGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGG > NC_002947/1126499‑1126781 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |