| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,013,885 | T→C | intergenic (+90/+20) | xpt → / ← PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,013,885 | 0 | T | C | 98.2% | 192.7 / NA | 56 | intergenic (+90/+20) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (32/23); minor base A (1/0); total (33/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCA > NC_002947/6013746‑6014025 | gggCCGGGGTGATGGCGGTGTATGGTGTTGTGGTCAGCTTCATCGAATAACCGCGCCACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGCAGCACAGTTCTCTAACGCTGTGCCTTACCTGT‑‑GGTAGCGGGCGTGCCCGCGAATg < 6:24273/146‑1 (MQ=25) ccGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑c < 4:255895/145‑1 (MQ=255) ccGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑c > 3:255895/1‑145 (MQ=255) aGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGGGGCCGCACAGGTGTGGAACGCTGTGCCGGTCCAGT‑‑GGGCGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCCCAACCCtt > 6:295301/1‑147 (MQ=37) gTCGCTGGAAGGTGGGGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCttt < 5:370184/147‑1 (MQ=255) ggAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACCCCCCCAACCCCAGCTGGACCACACGTCGCCAAAGCATTGGCCGAACAGA‑‑GGGGGCCGGCGAGCCCGCCAATTG‑ACCCAACCCATTTAtatt > 4:276490/1‑144 (MQ=255) cgggtggtCACCTCCATCGAATAACCGCCCCACCTGCTTCGCTGTCACTCCCTCCCCCCCCGGTGCAGCACAGGTCTCCAACGCTGTGCCGTACTTGT‑‑GGGCGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTgccg < 6:14887/144‑1 (MQ=255) gtggggcCACCTTCATCGAATAACCCCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACCGGGGCAGCACAGGCCTCGACCGCTTTCCCGTACCTGT‑‑GGTAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTgccgc < 4:193413/147‑1 (MQ=25) tgtggtCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTgcc > 4:295104/1‑144 (MQ=255) tgtggtCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTgcc < 3:295104/144‑1 (MQ=255) gCTGCATCGACTCAACGCGACACCTGCTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCg < 4:254130/146‑1 (MQ=38) aTCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACTGGTGCAGCACAGTTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑TCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaa < 5:90665/145‑1 (MQ=255) aTCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCca < 1:258271/145‑1 (MQ=255) aTCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaa < 1:14366/145‑1 (MQ=255) acacCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCCGCACAGGTGTCGAACGCTGTGCCGTACCGGTTAGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTTTATGGTTGCGGCCCGCCCCGCCAACAACAAGCGCTgg > 1:121072/1‑146 (MQ=37) cacCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTaaa < 5:295301/147‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑ttc > 2:64905/1‑145 (MQ=255) cTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑ttc < 1:64905/145‑1 (MQ=255) cGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGcccc > 1:205616/1‑147 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTg > 2:64394/1‑147 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTg > 5:356951/1‑147 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGGGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTaa < 1:189032/126‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGAGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTaa > 2:189032/1‑126 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCg > 7:30012/1‑147 (MQ=255) cTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCAGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCAAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGc > 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caGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 6:75969/1‑146 (MQ=255) caGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 4:369736/1‑146 (MQ=255) caGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 2:239076/1‑146 (MQ=255) caGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTAccc > 4:155148/1‑146 (MQ=255) tGCAGCACAGGGCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGATTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAAc < 1:242300/147‑1 (MQ=255) gcagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTg < 8:319571/147‑1 (MQ=255) gcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTATTATCTCGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAt > 6:276523/1‑147 (MQ=255) tctcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGcc > 4:237290/1‑145 (MQ=255) tctcGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑ACGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGcc > 2:236181/1‑145 (MQ=255) aaCGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTg > 6:233062/1‑147 (MQ=255) aaCGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCAGCCCCAGGTg > 7:32042/1‑147 (MQ=255) gCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCt < 8:30012/147‑1 (MQ=255) tgtgCCGTCCCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCttt < 5:241072/147‑1 (MQ=255) tgtgCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGTCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCttt < 4:378005/147‑1 (MQ=255) cGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc > 2:104049/1‑147 (MQ=255) gTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCACCTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAcc > 8:303740/1‑147 (MQ=255) gTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAcc < 5:233062/147‑1 (MQ=255) ccTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCt > 8:91832/1‑147 (MQ=255) gggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCgg < 2:121072/146‑1 (MQ=255) gggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCg < 4:243532/145‑1 (MQ=255) gggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGc > 5:77683/1‑147 (MQ=255) gggAGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGc > 5:140707/1‑147 (MQ=255) aGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGcccc > 3:241483/1‑147 (MQ=255) aGCGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGcccc < 2:205616/147‑1 (MQ=255) cGGGCGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCTCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCgg < 8:70675/147‑1 (MQ=255) cGTGCCCGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACATCAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCa > 8:28181/1‑147 (MQ=255) | TGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGT‑‑GGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGG‑CCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG‑TTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCA > NC_002947/6013746‑6014025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |