| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5496516 = | 115 (1.550) | 4 (0.060) | 4/256 | 4.4 | 3.5% | coding (169/1332 nt) | cobG | precorrin‑3B synthase |
| ? | NC_002947 | = 5496512 | 112 (1.640) | coding (173/1332 nt) | cobG | precorrin‑3B synthase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCCGAGGGACGAGGGATGACAGTGGGGGCT > NC_002947/5496367‑5496655 | gTTGCGCACATCGTCACCCGCGGAATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTcc < 1:84845/148‑1 (MQ=255) ttGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTcc < 5:21104/147‑1 (MQ=255) tCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAAAGCCACGAAACTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTccgccgccgccg > 2:237321/1‑148 (MQ=255) cccGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACg < 5:38145/147‑1 (MQ=255) ccGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACgg > 5:267405/1‑147 (MQ=255) ccGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGc > 7:194626/1‑148 (MQ=255) cgcgGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGc > 4:230755/1‑147 (MQ=255) cgcgGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑t > 2:390536/1‑148 (MQ=255) ggCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTc < 4:309373/147‑1 (MQ=255) gCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAATACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAg < 1:34395/148‑1 (MQ=255) cctCGCGTGGTCCCCCGCCGGCCGCGAGCAGTGGCTCGACAAAACCCCCACGCTCGCTGCCAATGCCACGACTCTGCAGCTTGCCACCGTTGGGGGCCTCGATCCCGCCGCCCGCAAAACGCTCGGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAg < 4:372826/145‑1 (MQ=255) cATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAg < 5:227923/147‑1 (MQ=255) cATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAg < 5:251364/147‑1 (MQ=255) cATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAg < 3:230755/147‑1 (MQ=255) tCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGAAGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGcc > 3:199903/1‑147 (MQ=255) cgcgTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTc > 2:416796/1‑142 (MQ=255) cgcgTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTc < 7:209209/142‑1 (MQ=255) cgcgTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTc > 8:209209/1‑142 (MQ=255) cgcgTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTc < 1:416796/142‑1 (MQ=255) cccAGGCCGGCTTCGAGCAGTGCCTCTACCAAAGCTCGATGCTCGCTGCAAATGCCACGAATCTGCATGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATAACGCCGCCAGCAAAACGATCAGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGc > 1:257579/1‑146 (MQ=255) cccAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCgg > 4:213775/1‑145 (MQ=255) cccAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCgg > 5:363176/1‑145 (MQ=255) cccAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGcc < 3:198417/147‑1 (MQ=255) ccAGGCGGGCTGCGAGCTGTGCCTCGACCAAAGAGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCcag < 1:314546/148‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCca < 8:244839/147‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCCCggggtt > 8:83521/1‑144 (MQ=255) cAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCcag > 3:375748/1‑147 (MQ=255) cAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCca > 5:132546/1‑146 (MQ=255) ggCCGGCTGAGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATATGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCcagcag > 2:99162/1‑148 (MQ=255) gCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCcagcag < 3:213775/147‑1 (MQ=255) ccGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCcagca < 3:212091/145‑1 (MQ=255) ccGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCcagca > 4:212091/1‑145 (MQ=255) ccGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCcagca > 6:293732/1‑145 (MQ=255) cGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCcagcagcag < 2:361972/148‑1 (MQ=255) tGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCAAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGcc > 4:118192/1‑147 (MQ=255) gAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGcc < 1:373814/133‑1 (MQ=255) gAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGcc > 2:373814/1‑133 (MQ=255) aGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCAGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCg > 2:326916/1‑148 (MQ=255) gCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGc < 3:32427/147‑1 (MQ=255) cTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGc > 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tGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTc < 3:6660/88‑1 (MQ=255) tGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCAc < 5:293732/147‑1 (MQ=255) tGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCAc < 6:132546/147‑1 (MQ=255) cAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGACCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACg < 5:266248/145‑1 (MQ=255) aTGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTccgccgccgccg > 6:389452/1‑73 (MQ=255) aTGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTccgccgccgccg < 5:389452/73‑1 (MQ=255) gCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCgg > 6:80218/1‑111 (MQ=255) 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(MQ=255) cTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCT‑‑‑CCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCca > 7:396896/1‑147 (MQ=255) tGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATgcg > 4:98138/1‑146 (MQ=255) cAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCca > 8:162718/1‑83 (MQ=255) cAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCca < 7:162718/83‑1 (MQ=255) cAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGcc > 5:40842/1‑146 (MQ=255) ggTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCgg > 1:151027/1‑110 (MQ=255) ggTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCgg < 2:151027/110‑1 (MQ=255) ggTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCcaca < 4:94725/147‑1 (MQ=255) tgtgaCGGTTGTTTGTCTCGATTACGCCGCCATCAAAACGCT‑‑‑CCGCCGCAGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGTCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCg < 8:396896/143‑1 (MQ=255) cACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAAcccc < 4:375748/146‑1 (MQ=255) cACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCgg < 1:237321/148‑1 (MQ=255) cACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCgg > 8:1086/1‑148 (MQ=255) aCGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCgg > 7:279187/1‑147 (MQ=255) aCGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCgg < 6:308703/147‑1 (MQ=255) aCGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCgg > 3:288335/1‑147 (MQ=255) aCGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCT‑‑‑CCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAg < 7:88289/148‑1 (MQ=255) cGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCggg > 8:229635/1‑147 (MQ=255) cGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCgg > 4:293797/1‑146 (MQ=255) gCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCcgagg > 8:283053/1‑148 (MQ=255) ccTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCcgagg > 6:67177/1‑147 (MQ=255) cTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCAGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGACATAACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCcgaggg > 5:289149/1‑147 (MQ=255) tCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATgcg > 7:242111/1‑122 (MQ=255) tCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATgcg < 8:242111/122‑1 (MQ=255) tCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCcgcggga < 3:293797/147‑1 (MQ=255) gccgccAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGCCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCCGAGGGACGAGGGATg < 1:99162/148‑1 (MQ=255) ccgccAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCCGAGGGACGAGGGATGa > 8:130530/1‑148 (MQ=255) aaaaCGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCCGAGGGACGAGGGATGACAGTggg > 6:191350/1‑147 (MQ=255) aaaCGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGCGTTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCCGAGGGACGAGGGATGACAGTgggg > 1:19354/1‑148 (MQ=255) aCGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCCGAGGGACGAGGGATGACAGTGGGGGCt > 7:76734/1‑148 (MQ=255) aCGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCCGAGGGACGAGGGATGACAGTGGGGGCt > 7:343692/1‑148 (MQ=255) | GTTGCGCACATCGTCACCCGCGGCATCGCGTGGTCCCAGGCCGGCTGCGAGCAGTGCCTCGACCAAAGCGCGATGCTCGCTGCCAATGCCACGAATCTGCAGGTTGCCACGGTTGGTGGCCTCGATCACGCCGCCAGCAAAACGCTCCGCCGCCGCCGCCACGGC‑TTCAGCCTGCTCGGCCAGCAGCAGGCCACCCGGCAGCTTGATGCGGCAGATACCGCCATCACGGGCACTGACGATGCGCCACAACCCCGGGCAGGCCGAGGGACGAGGGATGACAGTGGGGGCT > NC_002947/5496367‑5496655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |