| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 684,841 | Δ1 bp | 5.9% | coding (1406/2400 nt) | cadA‑II ← | cadmium translocating P‑type ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 684,841 | 0 | T | . | 5.9% | 325.9 / 13.2 | 101 | coding (1406/2400 nt) | cadA‑II | cadmium translocating P‑type ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/50); new base . (3/3); total (48/53) | |||||||||||
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Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AGGGCGCCGGCCAGGCGGTAAAGGTCGGCGCTGTTGCCGTCCAGCGCCTGGCTGTGAACCACCTGCGGGCTGCCGGAGGTGAGGGTGCCGGTTTTGTCGAACACTACGCGGTTGACCGCATGGGCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTACCCCAGCCAGCCACC > NC_002947/684694‑684988 | aGGGCGCCGGCCAGGCGGTAAAGGTCGGCGCTGTTGCCGTCCAGCGCCTGGCTGTGAACCACCTGCGGGCTGCCGGAGGTGAGGGTGCCGGTTTTGTCGAACACTACGCGGTTGACCGCATGGGCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCtt > 5:321038/1‑149 (MQ=255) ggCGCCGGCCAGGCGGTAAAGGTCGGCGCTGTTGCCGTCCAGCGCCTGGCTGTGAACCACCTGCGGGCTGCCGGAGGTGAGGGTGCCGGTTTTGTCGAACACTACGCGGTTGACCGCATGGGCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGa < 4:310064/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGGCCAGGCGGTAAAGGTCGGCGCTGTTGCCGTCCAGCGCCTGGCTGTGAACCACCTGCGGGCTGCCGGAGGTGAGGGTGCCGGTTTTGTCGAACACTACGCGGTTGACCGCATGGGCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGa > 6:126585/1‑149 (MQ=255) 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aCCGCATGGGCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAg < 2:67937/149‑1 (MQ=255) ccGCATGGGCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCacggcgac > 4:282395/1‑136 (MQ=255) ccGCATGGGCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCacggcgac < 3:282395/136‑1 (MQ=255) cATGGGCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGcgcg > 5:237962/1‑149 (MQ=255) cATGGGCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGcgcg < 4:290917/149‑1 (MQ=255) gggCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGtt > 2:273221/1‑149 (MQ=255) cA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTc > 5:45072/1‑148 (MQ=255) a‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTc > 4:205745/1‑147 (MQ=255) tCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCgg > 6:357033/1‑149 (MQ=255) cAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTa < 3:385341/149‑1 (MQ=255) cAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTa > 7:43804/1‑149 (MQ=255) gggCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTAcc < 5:113272/149‑1 (MQ=255) gggCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTAcc > 6:139558/1‑149 (MQ=255) ttCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTACCccag > 2:253292/1‑149 (MQ=255) cacGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGtt < 5:279241/131‑1 (MQ=255) cacGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGtt > 6:279241/3‑133 (MQ=255) cacGGCATCC‑TGATCAAGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTACCccag > 6:359482/3‑149 (MQ=255) acGGCATCC‑TGATCAAGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTACCccagc < 5:359482/148‑1 (MQ=255) cGGCATCC‑TGATCAAGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTACCccagcc > 1:100031/1‑149 (MQ=255) tCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTACCCCAgccagcca > 1:286846/1‑149 (MQ=255) cTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTACCCCAGccagccacc < 7:253689/149‑1 (MQ=255) cTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGGTTCCAGCGGTACCCCAGccagccacc > 3:205288/1‑149 (MQ=255) ttGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTACCCCAGccagccac > 7:53381/1‑147 (MQ=255) ttGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTACCCCAGccagccac > 4:362762/1‑147 (MQ=255) | AGGGCGCCGGCCAGGCGGTAAAGGTCGGCGCTGTTGCCGTCCAGCGCCTGGCTGTGAACCACCTGCGGGCTGCCGGAGGTGAGGGTGCCGGTTTTGTCGAACACTACGCGGTTGACCGCATGGGCA‑CGCTCCAGGGCTTCGGCATCCTTGATC‑AGGATGCCGTGGCGGGCGGCGACCCCGGTACCGGCCATGATCGCGGCGGGCGTGGCCAGGCCGAGGGCGCAGGGGCAGGCGATGACCAGCACGGCGACGGCGTTGATCAGCGCGGTTTCCAGCGGTACCCCAGCCAGCCACC > NC_002947/684694‑684988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |