| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,385,793 | Δ1 bp | 5.9% | coding (85/576 nt) | PP_2093 ← | two‑component system response regulator NasT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,385,793 | 0 | T | . | 5.9% | 213.5 / 6.4 | 68 | coding (85/576 nt) | PP_2093 | two‑component system response regulator NasT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/33); new base . (2/2); total (33/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AACACGATGGGCCGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAAGCTGAAA > NC_002947/2385645‑2385940 | aacaCGATGGGCCGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCgat > 2:255923/1‑149 (MQ=255) acacGATGGGCCGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCgatg < 1:9167/149‑1 (MQ=255) gATGGGCCGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAt‑c‑t < 3:70626/149‑1 (MQ=255) gATGGGCCGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAt‑c‑t > 3:263539/1‑149 (MQ=255) aTGGGCCGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAt‑c‑t‑c < 3:207754/149‑1 (MQ=255) gggCCGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑Cg > 3:302212/1‑148 (MQ=255) ggCCGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGaa < 4:351878/149‑1 (MQ=255) gCCGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAg > 8:94446/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCCGGTCTGGGGCTTGGAGGAG‑C‑T‑GGGAGc > 8:333406/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGc > 2:314514/1‑149 (MQ=255) cgcgGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGA‑GAT‑CAT‑CGAAGcc < 8:267438/149‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGA‑GAT‑CAT‑CGAAGccc < 3:137038/149‑2 (MQ=255) cgGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCgg < 7:302958/149‑1 (MQ=255) cgGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCgg < 2:342445/149‑1 (MQ=255) tGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGaa < 4:179239/140‑1 (MQ=255) tGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGaa > 3:179239/1‑140 (MQ=255) gTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCctcac < 2:361641/149‑1 (MQ=255) agccgtGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCctcactc < 1:180583/143‑1 (MQ=255) aCGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCctcactc > 8:361455/1‑148 (MQ=255) aCGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCctcact > 2:147357/1‑147 (MQ=255) aCGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCctcact < 1:147357/147‑1 (MQ=255) ggCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAAc > 5:92029/1‑149 (MQ=255) tGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACg > 8:358607/1‑147 (MQ=255) aCCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCaac < 3:117835/149‑3 (MQ=255) aCCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAg < 2:305325/148‑1 (MQ=255) cACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCt > 7:361164/1‑147 (MQ=255) ccTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGa < 4:302212/149‑1 (MQ=255) ttCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGa < 2:217885/149‑1 (MQ=255) cATCACATAGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGCCGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCCATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCCCTCAACGCAGCCATCCGGCGACCGAGCt > 8:46758/1‑149 (MQ=255) aTCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATAGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCCGGTCTGGGGCTGCGATGAT‑C‑T‑CGACGCCGGCCGCCCTCAACGCCGCCCTCCGGCGACCGAGcgt > 8:234484/1‑147 (MQ=255) tCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGACGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTg > 8:83126/1‑149 (MQ=255) gcgGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTgg < 4:263539/148‑1 (MQ=255) gcgGTCTGGCGAGTCGGGATCGATCAGCACGACGGCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGGCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTgg < 7:46758/148‑1 (MQ=255) gcgGTCTGGCGAGTCAGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGTTGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTgg < 8:59384/148‑1 (MQ=255) cgGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGgt < 7:358607/149‑1 (MQ=255) gCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGtcgtcg < 3:347312/149‑1 (MQ=255) cGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGa < 8:361164/149‑1 (MQ=255) gAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGAt < 7:333406/149‑1 (MQ=255) tgTATCGATCAGCAGCTCGTCCGGGGGCACCGTTTCGTCGGTGGCGGGCATGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTAGATGAT‑C‑T‑GGAAGCCGGCCTGACTCAACGCAGCGCTGAGGCGACCGTGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATcagc < 6:92029/147‑1 (MQ=255) ggTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATcagc < 2:214029/148‑1 (MQ=255) tATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGATCC‑TCCGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATcagca < 1:314514/149‑1 (MQ=255) tATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTg > 7:187805/1‑125 (MQ=255) tATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTg < 8:187805/125‑1 (MQ=255) aTCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATgcg > 4:122126/1‑149 (MQ=255) aTCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAAGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATgcg > 3:86978/1‑149 (MQ=255) tCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATgcg > 3:385651/1‑148 (MQ=255) cAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATgcgc > 6:336586/1‑148 (MQ=255) gCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCaa > 3:266119/1‑148 (MQ=255) cacGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGt < 7:361455/149‑1 (MQ=255) cGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTc < 7:94446/149‑1 (MQ=255) gTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCAGGCCTCACTCAACGCAGCCCTAAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGAGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCg > 6:359288/1‑149 (MQ=255) gACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGTGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGa > 3:370411/1‑148 (MQ=255) ccGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTAGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCCCTCAACGCAGCCCTCAGGAGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGGCGATCCGCAGGATTCGCAACAGGTTCGTCCCCCTCCCGCGCCGaca > 4:94207/2‑149 (MQ=255) aGGCGGACAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCACGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCCATCAGCAGGATGCGCAACATGATCGTCCCCCACACGCGCCGACACgcg > 2:287654/1‑147 (MQ=255) gggCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATc > 5:312098/1‑149 (MQ=255) gATGGTCAGGTCTGGGGCTTCTATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTc < 7:83126/149‑1 (MQ=255) gATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTc > 2:279415/1‑149 (MQ=255) gTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGcc > 4:306944/1‑148 (MQ=255) aGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAg < 1:255923/149‑1 (MQ=255) aGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAg < 7:207727/149‑1 (MQ=255) ggTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAgg < 3:122126/149‑1 (MQ=255) ccggCTTCGA‑GAT‑CAT‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATTGGGCAACTCGCCCAAGGCATg > 5:34826/3‑148 (MQ=255) ggCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCaa < 4:266119/149‑1 (MQ=255) gCTTCGA‑GAT‑CAT‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAAg > 6:264716/1‑149 (MQ=255) cTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGTGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAAGc < 4:370411/149‑1 (MQ=255) ttCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAAGCt > 4:275604/1‑149 (MQ=255) ttCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAAGCt > 2:172177/1‑149 (MQ=255) cGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACgg < 8:225682/115‑1 (MQ=255) cGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACgg > 7:225682/1‑115 (MQ=255) cGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTAGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGCATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAACCTg > 7:168434/1‑148 (MQ=255) gatgat‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAAGCTGa < 5:188548/148‑1 (MQ=255) gatgat‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAAGCTGa > 6:188548/1‑148 (MQ=255) gatgat‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAAGCTGa < 1:287654/148‑1 (MQ=255) atgat‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAAGCTGaaa < 4:385651/149‑1 (MQ=255) | AACACGATGGGCCGCGGCTGGTCACGGCTGACCAGCACTACCTGTTCCATCACATCGCGGTCTGGCGAGTCGGTATCGATCAGCACCACGTCCGGGCGCACCGTTTCGACGCAGGCGGGCAGGTCGATGGTCAGGTCTGGGGCTTCGATGAT‑C‑T‑CGAAGCCGGCCTCACTCAACGCAGCCCTCAGGCGACCGAGCTTGCTCTGGGTGTCGTCGATCAGCAGGATGCGCAACATGTTCGTCCCCCTCACGCGCCGACACGGGCATCGGGCAACTCGCCCAAGGCATGCAAGCTGAAA > NC_002947/2385645‑2385940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |