| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,997,189:1 | +G | 9.5% | intergenic (‑158/+42) | PP_5252 ← / ← PP_5253 | hypothetical protein/arylesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,997,189 | 1 | . | G | 9.5% | 264.1 / 25.8 | 74 | intergenic (‑158/+42) | PP_5252/PP_5253 | hypothetical protein/arylesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (34/33); new base G (3/4); total (37/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.56e-01 | |||||||||||
GACTAGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAT > NC_002947/5997042‑5997335 | gACTAGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa‑a > 3:255461/1‑149 (MQ=255) aCTAGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑Ac < 5:231340/149‑1 (MQ=255) ggggCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACagacgtt > 3:134332/1‑143 (MQ=255) ggggCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑Ac > 6:81442/1‑145 (MQ=255) ggggCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑Ac < 5:81442/145‑1 (MQ=255) ccGGCAGGGTGACTGCGAAGCATGCCGGGAGATGCAAGGCGTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAg < 4:230641/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAgg < 4:134332/149‑1 (MQ=255) ggCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGa < 6:148596/149‑1 (MQ=255) cAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑c < 8:255938/149‑1 (MQ=255) gggggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑C‑gg < 3:237261/149‑1 (MQ=255) ggggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑ggg < 5:345299/149‑1 (MQ=255) gACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGttt < 8:136237/149‑1 (MQ=255) tGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑Ac < 4:72099/128‑1 (MQ=255) tGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑Ac > 3:72099/1‑128 (MQ=255) tGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTAcc > 1:63725/1‑149 (MQ=255) aaGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCcgc > 8:72634/1‑148 (MQ=255) gTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTcc < 2:236999/148‑1 (MQ=255) gTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTcc > 1:236999/1‑148 (MQ=255) gATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCcac > 1:269082/1‑148 (MQ=255) aTGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGGTTACCCGCGAATGTTTACCACaa > 3:323782/1‑149 (MQ=255) tGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAAt > 2:87876/1‑149 (MQ=255) tGCAAGGCCCGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑C‑gg < 6:178696/123‑1 (MQ=38) gCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGc > 3:137290/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTTCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAGAC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGc < 1:257372/149‑1 (MQ=255) cTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCTAAA‑ACGTGTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTACCACAATTACCGCTGAAgg > 7:174469/1‑148 (MQ=255) ttGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGaa > 7:48491/1‑149 (MQ=255) ttGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACA‑ACGTAAGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTACCACAAATACCGCTGAAGGaa > 5:146493/1‑149 (MQ=38) ttGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTACTAAA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTGCAACAATTAACGCTGAAGGa > 1:334701/1‑148 (MQ=38) gAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACg > 2:55299/1‑149 (MQ=255) gctttgCGGGGGGTTTAACAACGTTACCCCGGGTCAAGCTTTTTGCTGCCGGGGCCGGCCTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGTAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAg < 2:2565/144‑1 (MQ=37) gCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTc < 8:48491/149‑1 (MQ=255) ggTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCt > 1:104691/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCTGAAGACGGGTCGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCt < 4:255461/149‑1 (MQ=38) ctagctGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCa < 3:105700/144‑1 (MQ=255) 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aagaagGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCGGCGAAA‑ACGTGTGTATGGG‑CGGGGTTTACCC‑CGAATGTTTGCCCCAAATAACGCTGGAGGAACGCCCGCCAGTGCGGATTAAgct > 8:23219/1‑149 (MQ=255) agaagGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTACTACA‑AAGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTAAACGCGAATGTTTACCAAAATTAACGATGAAGTAACGCAATCAAGTCCTAATTCAgatt > 6:306000/1‑146 (MQ=25) gaagGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTAACCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAgctgc > 3:85224/1‑149 (MQ=255) ggTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCtgctgc < 2:269082/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATg < 2:104691/149‑1 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GTGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa < 3:361867/149‑1 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa < 1:87876/149‑1 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa < 2:63725/149‑1 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACA‑ACGTCTGTATGAG‑C‑GGGGTTAACCGCGAATTTTTACCACAATTAACGCTGAAGGAACGCCAGGAAGTCCGCATTAAGCTGCTTCGCATGa > 1:354575/1‑149 (MQ=37) tCAATCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCTCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACt < 5:306000/149‑1 (MQ=255) ctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACC‑ACGTGGGTTGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACCATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCGCCTTCAGCTGCTGCGCATGAGGCACTGCAAAACCGTgc > 2:23464/1‑149 (MQ=38) tgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCAACTAAA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTTACCGCGAATGTTTGCCACAATTAACCCTGAAGGCACGCCAGCCAGTCCTAATTAAGCTGCTGCGCATGAGTAAATGCAAAAACGTgcg > 2:105496/1‑149 (MQ=25) ccTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgcgg < 4:137290/148‑1 (MQ=255) gccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTGCGACA‑AGGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGGGAAAGTTTACCACAATTTACGCTGAAGGGACGCCAGGAACTCCTCAATAAGCTGGGGCGCATGGGTAACTGCAAAACCGAGCGGCCGCCCGGc > 8:282894/1‑148 (MQ=19) gccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCg > 5:13675/1‑146 (MQ=255) gccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCg < 6:13675/146‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCATCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATa < 1:55299/149‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATa < 4:323782/149‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCtt > 6:315178/1‑149 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTc < 2:334701/149‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCa < 7:282894/149‑1 (MQ=255) aCCCGGTCCTACA‑ACGGCTGTTGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCAGAATTAACGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCTCATGAGTCACTGCAAATCCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCgg < 8:267049/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTATCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTCCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCgg > 8:22913/1‑149 (MQ=38) aCCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCgg > 7:267049/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgc > 6:165812/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGACCGCCAGCAAGTCCTCATTGAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgc > 6:207198/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgc > 3:372226/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATacac < 6:218819/136‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATacac > 5:218819/1‑136 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCAGCATACACCTTCAGCTCGgcg > 6:102479/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTACA‑ACGGCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATacac < 6:224185/136‑1 (MQ=255) cGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 4:385356/1‑149 (MQ=255) gCTCCTACAGACGT‑TGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 5:383139/1‑148 (MQ=255) cTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCAc < 4:85224/147‑1 (MQ=255) tACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCCAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGATGCAGCGCATGACTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCACGGCATACACCTTAACCTAGGCGCCACGaa > 1:233715/1‑149 (MQ=255) cA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAt < 1:105496/148‑1 (MQ=255) a‑aCGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAt > 6:47823/1‑147 (MQ=255) | GACTAGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑ACGTCTGTAGGAG‑C‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAT > NC_002947/5997042‑5997335 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |