| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 612,734:1 | +T | 7.1% | coding (1448/1896 nt) | dxs ← | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 612,734 | 1 | . | T | 7.1% | 333.9 / 20.3 | 85 | coding (1448/1896 nt) | dxs | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (36/43); new base T (3/3); total (39/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.41e-01 | |||||||||||
GATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTC > NC_002947/612586‑612882 | gATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAAGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCAcgcg > 6:101405/1‑149 (MQ=255) tCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCg‑gg > 5:143109/1‑149 (MQ=255) tGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCAcgcgagat > 7:129770/1‑145 (MQ=255) ggCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGt < 8:102906/148‑1 (MQ=255) ggCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTa > 2:49841/1‑149 (MQ=255) ttGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCgg > 1:134910/1‑149 (MQ=255) cATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCggcc < 3:56856/148‑1 (MQ=255) aTGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCggccgg < 6:362410/149‑1 (MQ=255) aTGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCggccgg < 5:186129/149‑1 (MQ=255) ggCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCggccgggc > 8:308997/1‑149 (MQ=255) gCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCggccgggcc < 2:374901/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCggccgggccg < 4:249025/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACC‑CGCGTGGTACCggc < 6:194706/134‑3 (MQ=255) cTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACC‑CGCGTGGTACCggc > 5:194706/1‑132 (MQ=255) ggCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGtt < 8:287688/147‑1 (MQ=255) ggCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGtt < 4:336425/147‑1 (MQ=255) ggCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGtt < 8:85417/147‑1 (MQ=255) ggCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTg < 1:322351/148‑1 (MQ=255) ggCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGGGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGtt < 5:1396/147‑1 (MQ=255) ccAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCTCGATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAACGGCCCGGCCGCTGTa < 1:304945/149‑1 (MQ=255) ttGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGt < 1:259888/149‑1 (MQ=255) aCGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGcc > 2:32717/1‑149 (MQ=255) gCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCgg > 7:312375/1‑149 (MQ=255) cGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTg < 6:143109/149‑1 (MQ=255) gAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGc < 2:329324/149‑1 (MQ=255) cacCAGCAGGTCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCAGGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGTGCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTTCTGa < 7:363050/149‑1 (MQ=255) cacCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGa < 1:49841/149‑1 (MQ=255) cacCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGATACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGa < 4:3119/149‑1 (MQ=255) cacCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAAGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GTTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGa < 5:101405/149‑1 (MQ=255) acCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAg > 7:49423/1‑149 (MQ=255) cagcagGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTg > 1:333842/1‑142 (MQ=255) cagcagGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTg < 2:333842/142‑1 (MQ=255) gcagGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATc > 5:310476/1‑149 (MQ=255) ccACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTgcg > 7:313678/1‑148 (MQ=255) ccACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAACggcccggccgc > 5:101381/1‑116 (MQ=255) ccACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAACggcccggccgc < 6:101381/117‑2 (MQ=255) cACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGa < 2:141772/137‑1 (MQ=255) cACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGa > 1:141772/1‑137 (MQ=255) cTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAgt < 2:378257/149‑1 (MQ=255) tttttCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAgtt > 8:7344/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCtcg > 8:167304/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACC‑CGCGTGGTACCgg > 5:14433/1‑88 (MQ=255) ccTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACC‑CGCGTGGTACCgg < 6:14433/89‑2 (MQ=255) cTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCtcgt > 2:97986/1‑149 (MQ=255) gcggACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGTGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTgg < 1:32717/149‑1 (MQ=255) gcggACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTgg < 6:310476/149‑1 (MQ=255) gcggACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTgg > 2:382340/1‑149 (MQ=255) ctgACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTggg < 4:372016/147‑1 (MQ=255) aCCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGt < 1:97986/149‑1 (MQ=255) aCCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGt < 1:382340/149‑1 (MQ=255) ccACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGtc < 8:49423/149‑1 (MQ=255) cACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTAc < 2:121747/97‑1 (MQ=255) cACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCA‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTAc > 1:121747/1‑97 (MQ=255) cACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTACGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGCTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGtca > 8:263475/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCa < 4:80835/149‑1 (MQ=255) ttGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAg > 5:42249/1‑149 (MQ=255) ccAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCgg > 3:179533/1‑148 (MQ=255) ccAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCgg > 1:158692/1‑148 (MQ=255) cAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCggg < 2:134910/148‑1 (MQ=255) cAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCgg < 7:308997/147‑1 (MQ=255) aGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGAt < 8:312375/149‑1 (MQ=255) gTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAg > 5:75352/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAgc > 4:138926/1‑149 (MQ=255) cAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAgcg > 7:338983/1‑147 (MQ=255) cAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCa < 6:42249/149‑1 (MQ=255) cAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCa < 7:167304/149‑1 (MQ=255) gCT‑GATCGGCTCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGAGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGTGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACa < 5:4152/149‑1 (MQ=255) gCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCCCGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGa > 3:42530/1‑147 (MQ=255) gCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGa > 6:327166/1‑147 (MQ=255) tCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAgcgc > 2:346094/1‑134 (MQ=255) tCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAgcgc < 1:346094/134‑1 (MQ=255) 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ctgtacGGTACC‑CGCGTGGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAgcg < 6:174034/118‑1 (MQ=255) ctgtacGGTACC‑CGCGTGGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCAGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAgcg > 5:174034/6‑123 (MQ=255) ggCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCg < 8:225633/137‑1 (MQ=255) ggCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCg > 7:225633/1‑137 (MQ=255) ggCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCg > 7:236209/1‑149 (MQ=255) cGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTgg < 3:163996/149‑1 (MQ=255) gTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGt > 5:161308/1‑149 (MQ=255) gTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGAGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGt > 2:208525/1‑149 (MQ=255) ccACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCg > 3:159368/1‑103 (MQ=255) ccACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCg < 4:159368/103‑1 (MQ=255) cACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCggg > 3:334708/1‑149 (MQ=255) aCGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGc > 4:291494/1‑149 (MQ=255) cgcg‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGcc < 8:313678/149‑1 (MQ=255) gcg‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGATGGGGGTAATCACCAGCATGCCAGGGATGCAGCACAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGTGcc > 2:115616/1‑148 (MQ=255) g‑ggTACCGTTCAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTc > 7:136177/1‑149 (MQ=255) | GATCTGTTCGGCCACTTGCATGGCCTCGGCCAGTTGTACGCCGAACACCAGCAGGGCCACTTTTTCGCCCTGGCGGCGGACCACGCCCTTGCCGATCTCCAGTGGTTGCAGGTCTCCGCT‑GATCGGCGCATTCGGGCCGGTACCACGCG‑GGTACCGTACAGCGGCCGGGCCGTTGTACAGGTGGCCGGTGCTGAGCATCTTGCGCAGTTCGTTCTCGTCGCTGGGGGTCATCACCAGCATGCCCGGGATGCAGCGCAGGTACGACAGGTCGTAGCTGCCGGCGTGGGTCGGGCCGTC > NC_002947/612586‑612882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |