| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 100459 | 60 (0.940) | 4 (0.070) | 4/232 | NT | 6.1% | intergenic (‑51/+71) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 100507 | 71 (1.280) | intergenic (‑99/+23) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein | |||||
CCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/100297‑100459‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcatgcccgcCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAAGGCCACGCAGCACTCAAGTGGAACCCTGTACATGCACCAGCAAAACATCCTCTTCGACCTCGACGGCACCCTGAC < NC_002947/100507‑100365 CCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTC > 8:231748/1‑149 GGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGC < 7:264471/149‑1 GGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGC < 7:24651/149‑1 GTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCG > 5:345266/1‑149 TTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCTTGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGG > 4:93863/1‑149 TTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGG < 1:296058/149‑1 TTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGG < 5:400828/149‑1 TTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGGGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGG < 4:241964/149‑1 GTCGATGCCCAGCTTGGCCCGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGGCGATGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTGTTCGCGGGC < 3:232481/148‑1 GTCGATGCCCAGCGTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGC < 3:256401/148‑1 TGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCC < 1:103978/149‑1 CCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGC < 7:231748/149‑1 CCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGGCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGTCATGCCCGC < 8:322693/149‑1 CCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTAC > 1:185621/1‑149 GTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGC < 2:185621/149‑1 GAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG > 2:243231/1‑133 GAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG < 1:243231/133‑1 tgCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAAGGCCACGCAGCACTCAAGTGGAACCCTGTACATGCACCAGCAAACCATCCTCTTCGACCTCGAC > 8:267430/3‑149 GGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAAGGCCACGCAGCACTCAAGTGGAACCCTGTACATGCACCAGCAAAACATCCTCTTCGACCTCGACGGCACC < 5:92026/149‑1 TGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAAGGCCACGCAGCACTCAAGTGGAACCCTGTACATGCACCAGCAAAACATCCTCTTCGACCTCGACGGCACCCTGA < 8:172617/149‑1 GCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAAGGCCCCGCAGCACGCAAGTGGAACCCTGTACATGCACCAGCAAAACATCCTCTTCGACCTCGACGGCACCCTGAC > 3:21211/1‑149 CCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/100297‑100459‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcatgcccgcCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAAGGCCACGCAGCACTCAAGTGGAACCCTGTACATGCACCAGCAAAACATCCTCTTCGACCTCGACGGCACCCTGAC < NC_002947/100507‑100365 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |