New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 319056 | 54 (0.850) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.4% | coding (686/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 319086 | 54 (0.900) | coding (656/1815 nt) | PP_0264 | sensor histidine kinase |
ATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCA > NC_002947/318908‑319203 | aTCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCT > 4:22424‑M1/1‑149 (MQ=255) aaCCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCgg > 3:10010/1‑149 (MQ=255) aaCCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCg < 4:263573/148‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGTCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGt < 6:377867/149‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGt < 6:249795/149‑1 (MQ=255) gCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCg > 7:281879/1‑149 (MQ=255) gCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCg > 1:180000/1‑149 (MQ=255) cGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCgg < 6:319555/149‑1 (MQ=255) gcgGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCa < 7:228087/147‑1 (MQ=255) gcgGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCa > 8:228087/1‑147 (MQ=255) ggCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGc < 3:117208/149‑1 (MQ=255) gCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCg < 4:29561/149‑1 (MQ=255) cGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGTCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCgg < 4:45347/149‑1 (MQ=255) gAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGTTGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCggg > 8:59999/1‑149 (MQ=255) gATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTa < 8:130271/148‑1 (MQ=255) tGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACg > 6:170470/1‑148 (MQ=255) ttGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTtccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagc > 5:283890‑M1/1‑116 (MQ=255) cAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTtccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagcgcca < 6:283890‑M1/149‑38 (MQ=255) cAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAagcgc < 4:2952‑M2/147‑6 (MQ=255) aaCCAGTTTCCTTGATGTCGAGGGTCTGGTTGATGCATGCCTGCGGGTTGAGATCCTGCGTCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTtccgtgctaccctcacgctgaccgacgccgagcgccag < 8:272446‑M1/149‑39 (MQ=255) aGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCgg < 3:2952/149‑1 (MQ=255) cTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTGGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCcgc > 5:332727/1‑148 (MQ=255) cTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCcgc > 3:95388/1‑148 (MQ=255) gggTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCATCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGaa < 8:301102/140‑1 (MQ=255) gggTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGaa > 7:301102/1‑140 (MQ=255) gggTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGAt > 8:12421/1‑148 (MQ=255) gggTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATg < 2:180000/149‑1 (MQ=255) ggTCATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGAGCCGCGAAGTCAGGATGACCAc < 7:59999/147‑1 (MQ=255) tGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCa < 6:342660/149‑1 (MQ=255) aTCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCAtt < 4:10010/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATtg < 2:229211/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGa < 8:304129/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGAt < 6:7795/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGAAGACCACGCCATTGTGAt < 3:22424/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCg > 7:296339/1‑149 (MQ=255) ttGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCaa > 8:42491/1‑149 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACa < 4:91101/148‑1 (MQ=255) agaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAg > 2:225235/1‑149 (MQ=255) gaACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAgc > 2:97796/1‑149 (MQ=255) gaACCAGCGGCTGTGGGGACTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGAGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGACGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAgc > 8:174723/1‑149 (MQ=255) aaCCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAACCCCCAGTCGGGCCGCCAAGTCAGAATGCCAACGCAATTGTGATCGGACAGCAACAcct > 6:312913/1‑149 (MQ=255) cGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCgg < 6:332727/149‑1 (MQ=255) gCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGc < 8:281879/149‑1 (MQ=255) gggCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCgg < 5:386568/123‑1 (MQ=255) gggCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCgg > 6:386568/1‑123 (MQ=255) ggATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAggg < 7:38474/148‑1 (MQ=255) gATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCa < 6:60762/114‑1 (MQ=255) gATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCa > 5:60762/1‑114 (MQ=255) gATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGtt > 1:95049/1‑149 (MQ=255) aTAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCTGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGttt < 5:170470/149‑1 (MQ=255) ggCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGgt > 3:37842/1‑149 (MQ=255) gCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGgtg > 4:74546/1‑149 (MQ=255) gCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGGGCGGGTTGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGgt < 5:312913/148‑1 (MQ=255) gATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGtgtg < 2:126868/147‑1 (MQ=255) aTGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTc < 3:74546/149‑1 (MQ=255) gatgatGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCATTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTc > 6:41705/1‑144 (MQ=255) gatgatGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGAt < 5:223195/149‑1 (MQ=255) atgGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCATTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGa < 5:41705/148‑1 (MQ=255) gCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACttt < 2:106468/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTg < 7:42491/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGAGGGTAGCACGGAagcgccaggccatcatcgccatccagccctatccgacccaggccccacagacgcaggatctcaacccgcaggcatgcatcaaccagaccctcgacatcaaggaaactggtt < 8:272446‑M2/149‑112 (MQ=255) tGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAagcgccaggccatcatcgccatccagccctatccgacccaggccccacagccgctggttctcaacccgcaggcctggatcacccagacccgcgacatcaaggaaactggttg < 6:283890‑M2/149‑113 (MQ=255) ggCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGac > 4:366736/1‑148 (MQ=255) gcgcTtccgtgctacccgcacgctgaccgacgccgagcgccaggccatcatcgccatccagccctatccgacccaggccccacagccgctggttctcaacccgcaggcctggatcacccagacccgcgacatcaaggaaactggttg < 4:2952‑M1/147‑143 (MQ=255) gcgcTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGac < 4:95388/147‑1 (MQ=255) gcTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAagcgccaggccatcatcgccatccagccctatccgacccaggccccacagccgctggttctcaacccgcaggcctggatcacccagacccgcgacatcaaggaaactggttggcaa > 5:283890‑M2/1‑33 (MQ=255) gcTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGaccac > 1:202324/1‑148 (MQ=255) cTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTGCGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCAAAGTCGATCTCGaccacac < 8:296339/149‑3 (MQ=255) | ATCAACCAGCGTGCGCGGGGCGAGGATGCTGACTTGCCAACCAGTTTCCTTGATGTCGCGGGTCTGGGTGATCCAGGCCTGCGGGTTGAGAACCAGCGGCTGTGGGGCCTGGGTCGGATAGGGCTGGATGGCGATGATGGCCTGGCGCTCGGCGTCGGTCAGCGTGCGGGTAGCACGGAAGCGCCAGTCGGGCCGCGAAGTCAGGATGACCACGCCATTGTGATCGGTCAGCAACAGCTGCTCGGGCGTACGGCCCCACAGGGTTTCGGTGTGGTCGAGATCGACTTTGACCACCA > NC_002947/318908‑319203 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |