| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 571069 = | 78 (1.230) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 5.2% | coding (41/546 nt) | ssb | single‑stranded DNA‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 571136 = | 73 (1.230) | coding (108/546 nt) | ssb | single‑stranded DNA‑binding protein | |||||
AAGAAGCCGCCATCTATATCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCACCGTGTGTCGCTGTTCGGCAAGGTT > NC_002947/570922‑571217 | ggtctgcagcttgccttcgatgtagcactgcgaacccttgcgcaggtattcgccagcgatttcggcaaccttgccgaacagcgacacacggtgccactcggtacgctcgaccttctggcccgactgcttgtcagtccacagctcgctgg > 8:351036‑M1/149‑149 (MQ=255)aagaagCCGCCATCTATATCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCtgt > 1:131147/1‑149 (MQ=255) gaagCCGCCATCTATATCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTgg > 5:184669/1‑149 (MQ=255) gccgccATCTATATCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCa < 7:18977/149‑1 (MQ=255) agcttgccttcgatgtagcactgcgaacccttgcgcaggtattcgccagcgatttcggcaaccttgccgaacagcgacacacggtgccactcggtacgctcgaccttctggcccgactgcttgtcagtccactgctcgctgGTGGCCAg > 4:108860‑M1/142‑149 (MQ=255) gcttgccttcgatgtagcactgcgaacccttgcgcaggtattcgccagcgatttcggcaaccttgccgaacagcgacacacggtgccactcggtacgctcgaccttctggcccgactgcttgtcagtccactgctcgctgGTGGCCAgg < 8:289778‑M1/9‑1 (MQ=255) gccATCTATATCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGa > 2:371636/1‑149 (MQ=255) aTCTATATCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATcc > 5:151287/1‑149 (MQ=255) tataTCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCg > 1:200621/1‑148 (MQ=255) atatCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCg > 1:41951/1‑147 (MQ=255) tatCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATccc < 1:206664/145‑1 (MQ=255) tatCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCg < 2:191226/146‑1 (MQ=255) tatCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGaa < 6:115087/148‑1 (MQ=255) tCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACCGGTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACATGTGGCCAGGATCCCGAAGt > 1:23061/1‑149 (MQ=255) tCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTc > 1:39760/1‑149 (MQ=255) tACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTGTGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGc > 6:58307/1‑149 (MQ=255) gAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGCGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGccc > 5:328158/1‑148 (MQ=255) gAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTTGGGGTAAAAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGTCCAGGATCCCGAAGGCCGCTAACttcgc > 4:293636/1‑144 (MQ=255) 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gACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGc > 5:280497/1‑149 (MQ=255) c‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGt < 2:221029/149‑1 (MQ=255) tGCGACCCTCGAGCGACTGTTGAATACAGCCTCTTCGGCGTGCTAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGTTTAACAAAGTCATTCTTGTCGGTAGCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGa < 7:371011/149‑1 (MQ=255) tGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGa < 6:274519/149‑1 (MQ=255) tGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGa < 6:184669/149‑1 (MQ=255) tGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGa > 2:133984/1‑149 (MQ=255) cGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGAc < 2:200621/148‑1 (MQ=255) cccTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGa < 8:106524/144‑1 (MQ=255) cccTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGa > 7:106524/1‑144 (MQ=255) cTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCt > 1:242101/1‑149 (MQ=255) 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ccGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGc > 5:134150/1‑146 (MQ=255) ccGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGc < 6:134150/146‑1 (MQ=255) cGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTAc > 6:103834/1‑149 (MQ=255) ggTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGt > 8:214833/1‑149 (MQ=255) aaCAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGc < 5:146830/148‑1 (MQ=255) aCAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCAc < 2:41951/149‑1 (MQ=255) cAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGt < 2:377245/101‑1 (MQ=255) cAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGt > 1:377245/1‑101 (MQ=255) aaaGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGcc < 4:153445/121‑1 (MQ=255) aaaGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCACCg > 6:384557/1‑149 (MQ=255) aaaGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGACGTGACCAAACTGAGCCTGGCCAACAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCACCg > 3:26622/1‑149 (MQ=255) aGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCACCgtg > 3:342267/1‑149 (MQ=255) tCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCACCgtgtg < 4:293978/149‑1 (MQ=255) gTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCACCGTGTGTCGCTGtt > 5:189295/1‑149 (MQ=255) ccTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCACCGTGTGTCGCTGTTCGGCaa < 5:103834/148‑1 (MQ=255) ccTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCACCGTGTGTCGCTGTTCGGCaa < 5:328061/148‑1 (MQ=255) GTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGc < 7:276107‑M1/111‑1 (MQ=255) GTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGc > 8:276107‑M1/1‑111 (MQ=255) GTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCACCGTGTGTCGCTGTTCGGCAAGGtt < 1:312650‑M1/149‑1 (MQ=255) | AAGAAGCCGCCATCTATATCAAACTGGATACGAAAATTTTGGACC‑GTGCGACCCTCGAGCGACTGGTGAATCCAGCCTCTTCGGCGTGCGAAGCCTAGGAGAACGTTATGGCCCGTGGGGTTAACAAAGTCATTCTGGTCGGTACCTGTGGCCAGGATCCCGAAGTCCGCTACCTGCCCAACGGTAACGCCGTGACCAACCTGAGCCTGGCCACCAGCGAGCAGTGGACTGACAAGCAGTCGGGCCAGAAGGTCGAGCGTACCGAGTGGCACCGTGTGTCGCTGTTCGGCAAGGTT > NC_002947/570922‑571217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |