New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 936724 | 56 (0.880) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 7.0% | coding (8898/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 936770 | 53 (0.890) | coding (8852/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
CCACGGCCAGACACGGCCAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTCGCCATTGCTCAGCACCAG > NC_002947/936578‑936870 | ccACGGCCAGACACGGCCAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGc > 8:87153/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCAGACACGGCCAGGCTGCCATCGCTCGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGGGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGc < 7:370676/149‑1 (MQ=255) cAGACACGGCCAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGccgagccg > 3:330065‑M1/1‑140 (MQ=255) acacGGCCAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCTTCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCggg < 6:85316/149‑1 (MQ=255) acacGGCCAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGc < 7:49273/139‑1 (MQ=255) acacGGCCAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGc > 8:49273/1‑139 (MQ=255) cacGGCCAGGCTGCCATCTCTTGCCTCCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTTTTGCCTTCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGt < 4:343065/149‑1 (MQ=255) cacGGCCAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGt < 3:228033/149‑1 (MQ=255) acGGCCAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTTGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTc < 6:298306/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAg < 4:29298/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAgg > 6:172342/1‑149 (MQ=255) gCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGt > 7:142439/1‑147 (MQ=255) gCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCa < 7:87153/149‑1 (MQ=255) ccATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCt > 4:272732/1‑149 (MQ=255) aTCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGATg > 8:127290/1‑148 (MQ=255) tCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGa > 5:282133/1‑148 (MQ=255) gCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATAGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGACTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAAc > 2:93122/1‑149 (MQ=255) cGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGc > 8:107335/1‑149 (MQ=255) tCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTc > 7:152852/1‑149 (MQ=255) tCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTc < 8:243110/149‑1 (MQ=255) ggCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCgg > 8:199320/1‑149 (MQ=255) gCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCgg > 2:91602/1‑148 (MQ=255) gacgaTCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGcaa < 6:215898‑M2/149‑4 (MQ=255) gacgaTCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGcaa < 6:167279‑M2/149‑4 (MQ=255) gaTCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGcaatgg < 6:51987‑M2/149‑7 (MQ=255) aTCGCTGGCGCGGTGATGGCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGcaatggc > 7:293242‑M2/1‑142 (MQ=255) gCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGccgagccggatggcagtttcagcctgaccctcgacccgccacaggccaatggcgag < 4:330065‑M1/149‑57 (MQ=255) cTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTg > 2:231782/1‑149 (MQ=255) ggCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGcc > 6:69866/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGc < 2:21999/147‑1 (MQ=255) ggggATTTCCGGTGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCCTTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCa < 8:142439/146‑1 (MQ=255) ggTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGAt > 3:247283/1‑147 (MQ=255) ggTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCa < 3:272732/149‑1 (MQ=255) ggTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGGGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCa < 8:152852/149‑1 (MQ=255) gTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCGGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAg > 8:110450/1‑149 (MQ=255) gTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGccgagccggatggcagtttcagcctgaccctcgacccgccacaggccaatgg < 2:308793‑M1/131‑53 (MQ=255) gTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGccgagccggatggcagtttcagcctgaccctcgacccgccacaggccaatgg > 1:308793‑M1/1‑79 (MQ=255) tCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGc < 6:282133/148‑1 (MQ=255) gggCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAg < 7:110450/149‑1 (MQ=255) gggCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAg < 5:172342/149‑1 (MQ=255) gggCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAg < 1:231782/149‑1 (MQ=255) ggCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAgg < 1:91602/149‑1 (MQ=255) ggCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAgg < 5:146370/149‑1 (MQ=255) ccACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCa > 5:121192/1‑149 (MQ=255) aCGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATc < 5:51987/149‑1 (MQ=255) cGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCt < 7:107335/149‑1 (MQ=255) cTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGAc < 5:215898/149‑1 (MQ=255) cGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGAc < 4:182971/138‑1 (MQ=255) cGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGAc > 3:182971/1‑138 (MQ=255) aaGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTgcg > 4:346656/1‑149 (MQ=255) gcctgccGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCtt > 6:110899/1‑149 (MQ=255) ccGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTg < 7:127290/147‑1 (MQ=255) ccGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCa < 5:110899/149‑1 (MQ=255) ccGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGAGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGc < 5:246606/148‑1 (MQ=255) gCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGt > 2:251150/1‑132 (MQ=255) cATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTCTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTa > 5:376134/1‑149 (MQ=255) gTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGc > 4:126067/1‑149 (MQ=255) aCGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAg > 3:86736/1‑149 (MQ=255) cGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAgg < 4:247283/149‑1 (MQ=255) aTGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTc > 3:311825/1‑149 (MQ=255) aCAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGATCCTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGAGCTCTACTCGTGCGACGGCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTCGCCa < 1:226212/149‑1 (MQ=255) aCAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTCGCCa < 3:346656/149‑1 (MQ=255) aGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTCGCCAtt > 7:27566/1‑149 (MQ=255) ggTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTCGCCATTGc > 1:168825/1‑149 (MQ=255) ctcGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGcaatggcgagaccctgtccatcaccgtgaccgatgcggcaggcaacacttcggtgccgctgagctacgtggccccggacatcaccgcgccagc < 4:330065‑M2/149‑94 (MQ=255) ctcGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTCGCCATTGCt > 3:57071/1‑147 (MQ=255) tcGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCTGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTCGCCATTGCTCAg > 1:34731/1‑149 (MQ=255) gCCATTGccgagccggatggcagtttcagcctgaccctcgacccgccacaggccaatggcgagaccctgtccatcaccgtgaccgatgcggcaggcaacacttcggtgccgctgagctacgtggccccggccatcaccgcgccagcgat > 7:293242‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTCGCCATTGCTCa < 6:121192/146‑1 (MQ=255) gCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTCGCCATTGCTCAg < 2:221435/147‑1 (MQ=255) ccATTGccgagccggatggcagtttcagcctgaccctcgacccgccacaggccaatggcgagaccctgtccatcaccgtgaccgatgcggcaggcaacacttcggtgccgctgagctacgtggccccggacatcaccgcgccagcgatc < 6:51987‑M1/149‑144 (MQ=255) ccATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGcaatggcgagaccctgtccatcaccgtgaccgatgcggcaggcaacacttcggtgccgctgagctacgtggccccggac < 2:308793‑M2/131‑80 (MQ=255) ccATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGcaatggcgagaccctgtccatcaccgtgaccgatgcggcaggcaacacttcggtgccgctgagctacgtggccccggac > 1:308793‑M2/1‑52 (MQ=255) ttGccgagccggatggcagtttcagcctgaccctcgacccgccacaggccaatggcgagaccctgtccatcaccgtgaccgatgcggcaggcaacacttcggtgccgctgagctacgtggccccggacatcaccgcgccagcgatcgtc < 6:215898‑M1/149‑147 (MQ=255) ttGccgagccggatggcagtttcagcctgaccctcgacccgccacaggccaatggcgagaccctgtccatcaccgtgaccgatgcggcaggcaacacttcggtgccgctgagctacgtggccccggacatcaccgcgccagcgatcgtc < 6:167279‑M1/149‑147 (MQ=255) | CCACGGCCAGACACGGCCAGGCTGCCATCGCTTGCCACCACGTCGGCGACGATCGCTGGCGCGGTGATGTCCGGGGCCACGTAGCTCAGCGGCACCGAAGTGTTGCCTGCCGCATCGGTCACGGTGATGGACAGGGTCTCGCCATTGGCCTGTGGCGGGTCGAGGGTCAGGCTGAAACTGCCATCCGGCTCGGCAATGGCGCTGCCGATCAGGTTGCCCGAGGCATCTTTGACCTCTACTCGTGCGCCCCCTTCTGCAGTACCGGCCAGGCTGTCGCCATTGCTCAGCACCAG > NC_002947/936578‑936870 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |