| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5628057 = | 85 (1.340) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 3.7% | coding (474/837 nt) | rlmJ | 23S rRNA (adenine(2030)‑N(6))‑methyltransferase |
| ? | NC_002947 | 5628131 = | 74 (1.220) | coding (400/837 nt) | rlmJ | 23S rRNA (adenine(2030)‑N(6))‑methyltransferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GGTAGTAGCGGGTCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGC > NC_002947/5627909‑5628204 | aagcgcctgaatgccgatggcgagctgcgctactacccggggtcgcccgaactggcccgtcgcctgatgcgccagcaggaccgcgccctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagaccc < 2:127703‑M1/1‑1 (MQ=255) gtagtaGCGGGTCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATcg < 2:200836/149‑1 (MQ=255) gtagtaGCGGGTCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATc < 3:56931/148‑1 (MQ=255) gtagtaGCGGGTCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTGTGAGCTCATCGGCCTGCTCGACCGGCGGGTCGATCAGCATGATc < 4:278665/148‑1 (MQ=255) gcgcctgaatgccgatggcgagctgcgccactacccggggtcgcccgaactggcccgtcgcctgatgcgccagcaggaccgcgccctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagacccgc > 5:233844‑M1/147‑149 (MQ=255) gcctgaatgccgatggcgagctgcgctactacccggggtcgccctaactggcccgtcgcctgatgcgccagcaggaccgcgccctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagacccgcgc > 4:293786‑M1/145‑149 (MQ=255) gcctgaatgccgatggcgagctgcgctactacccggggtcgcccgaactggcccgtcgcctgatgcgccagcaggaccgcgccctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagacccgcgc > 4:7689‑M1/145‑149 (MQ=255) gcctgaatgccgatggcgagctgcgctactacccggggtcgcccgaactggcccgtcgcctgatgcgccagcaggaccgcgccctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagacccgcgc < 4:136516‑M1/5‑1 (MQ=255) tagCGGGTCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATcgcgcg > 7:235737/1‑149 (MQ=255) cctgaatgccgatggcgagctgcgctactacccggggtcgcccgaactggcccgtcgcctgatgcgccagcaggaccgcgccctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagacccgcgcg < 2:95655‑M1/6‑1 (MQ=255) ctgaatgccgatggcgagctgcgctactacccggggtcgcccgaactggcccgtcgcctgatgcgccagcaggaccgcgccctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagaccCgcgcgc < 7:148038‑M1/7‑1 (MQ=255) gCGGGTCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGGCTGCTCGAACTGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCt > 1:329847/1‑149 (MQ=255) gCGGGTCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCt > 1:8843/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCtttt < 8:141880/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTc < 6:179920/149‑1 (MQ=255) tCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTcc > 5:216075/1‑149 (MQ=255) agcgagcgCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTg > 2:327581/1‑149 (MQ=255) cgagcgCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCa < 3:21458/149‑1 (MQ=255) cgagcgCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCa > 7:104600/1‑149 (MQ=255) cgagcgCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTCAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCGTATCCTGCa > 6:44587/1‑149 (MQ=255) agcgCTGGTCCTTGATCGGGTTCCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCAcc < 3:118981/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCg < 7:324465/149‑1 (MQ=255) cgcTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAATGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCgg > 7:213338/1‑149 (MQ=255) cgcTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCgg < 6:117689/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGgcagc > 2:225606/1‑148 (MQ=255) gTCCTTGATCGGGTACCAGATGGACGCAACGGTCTGGCGCATTCGGCCTATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGgcag < 2:329847/147‑1 (MQ=255) tGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGcc > 8:312951/1‑149 (MQ=255) gATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGccc > 4:351717/1‑149 (MQ=255) gATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGccc > 1:3479/1‑149 (MQ=255) tCGGGTACCAGATGGCCGCAATGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCcgc < 8:213338/149‑1 (MQ=255) tCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCcgc > 8:30056/1‑149 (MQ=255) gggTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCgg > 7:43543/1‑149 (MQ=255) gggTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCgg < 3:139012/149‑1 (MQ=255) ggTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGAgg > 3:249233/1‑148 (MQ=255) tACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGca > 5:279197/1‑148 (MQ=255) cAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATg > 7:61950/1‑149 (MQ=255) ggCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGc > 3:123999/1‑149 (MQ=255) cGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCtt > 4:333842/1‑149 (MQ=255) cAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCa < 8:334828/149‑1 (MQ=255) cAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCa < 4:151153/149‑1 (MQ=255) gTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTTGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGTCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTACTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAg < 7:103957/149‑1 (MQ=255) tCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAgg > 1:386865/1‑149 (MQ=255) tGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTg > 3:277106/1‑149 (MQ=255) 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ggCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAc‑g > 2:390282/1‑149 (MQ=255) ccagcaggaccgcgccctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagaccCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAc‑gcg < 4:341272‑M1/72‑1 (MQ=255) ccGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAc‑gcg > 3:343115/1‑149 (MQ=255) ccGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGGCCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAc‑gcg < 6:236602/149‑1 (MQ=255) gCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCACCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCACGTGCACg > 6:123814/1‑135 (MQ=255) ctctTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCATCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCtt > 7:155757/1‑149 (MQ=255) accgcgccctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagaccCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCtt > 3:341272‑M1/70‑149 (MQ=255) cgccctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagaccCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCtttttt > 8:148038‑M1/66‑149 (MQ=255) tCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCtttttt < 4:343115/148‑1 (MQ=255) tCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCtttt < 8:353810/146‑1 (MQ=255) tCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAACTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCtttttt > 1:70249/1‑148 (MQ=255) cATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTc < 7:312951/148‑1 (MQ=255) cctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagacccgcgc < 4:231035‑M1/5‑1 (MQ=255) cctgcttaacgaaaagcaccccgaagacgggccgctcctcaaggaaaacatgaaaaaagacccgcgc > 3:231035‑M1/63‑67 (MQ=255) aTGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCAt > 8:244574/1‑149 (MQ=255) tGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATg > 4:221058/1‑149 (MQ=255) 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tggtgCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTcc < 7:30056/149‑1 (MQ=255) gCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTga < 6:279197/149‑1 (MQ=255) gCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTga < 2:8843/149‑1 (MQ=255) gCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTga < 7:244574/149‑1 (MQ=255) gCAGCGTTTGAACTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTga < 2:70249/149‑1 (MQ=255) aGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGtt < 6:188322/139‑1 (MQ=255) aGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGtt > 5:188322/1‑139 (MQ=255) aGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGt < 5:226063/138‑1 (MQ=255) aGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGt > 6:226063/1‑138 (MQ=255) gCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCAAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTgagga > 7:14608/1‑149 (MQ=255) cGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTgaggag < 3:333842/149‑1 (MQ=255) gCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCg > 7:21583/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTGCTCGAACGGCCGGTAGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCAGCGGCACATGCAAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGTGTCATTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTc > 6:124583/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCggg < 1:225606/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCggg < 4:123999/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCgggg > 5:179246/1‑149 (MQ=255) cTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGc < 8:43543/148‑1 (MQ=255) tCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCTGGGGGGGGGTCGGAGGACGGCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTACTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGc > 1:127703/1‑149 (MQ=255) gAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCtttt > 6:364325/1‑149 (MQ=255) ggcggGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGtt < 1:390282/149‑1 (MQ=255) cggGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTaa < 6:148145/149‑1 (MQ=255) ggTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTa > 7:83754/1‑146 (MQ=255) ggTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGc < 3:221058/149‑1 (MQ=255) aTCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGgc > 8:309978/1‑149 (MQ=255) aGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGcgcg < 6:216075/149‑1 (MQ=255) gCATGAGCGCGCGCTTTCCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCgg < 4:249233/149‑1 (MQ=255) cATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGt > 3:136516/1‑149 (MQ=255) cATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGt > 6:60504/1‑149 (MQ=255) cATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGt > 1:176004/1‑149 (MQ=255) tGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTcc > 5:379014/1‑149 (MQ=255) tCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCctgc < 2:386865/149‑1 (MQ=255) | GGTAGTAGCGGGTCAGCGAGCGCTGGTCCTTGATCGGGTACCAGATGGCCGCAACGGTCTGGCGCATGCGGCCGATCGCCTCTTTCATGGCCGTGGTGCAGCGTTTGAGCTCATCGGCCTGCTCGAACGGCGGGTCGATCAGCATGATCGCGCGCTTTTCCTGCACCGGCAGCAAGGCCCGCGGCACATGCCAGCCTTCACCCAGGTGCACGG‑TCAC‑GCGCGGGTCTTTTTTCATGTTTTCCTTGAGGAGCGGCCCGTCTTCGGGGTGCTTTTCGTTAAGCAGGGCGCGGTCCTGC > NC_002947/5627909‑5628204 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |