New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5652712 = | 75 (1.180) | 3 (0.050) | 3/260 | NT | 3.7% | coding (188/330 nt) | PP_4961 | lipoprotein |
? | NC_002947 | 5652749 = | 85 (1.370) | coding (151/330 nt) | PP_4961 | lipoprotein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
CCAGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGC > NC_002947/5652566‑5652860 | ccAGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACAcc > 8:81325/1‑149 (MQ=255) agcgcttttggccgtgacggccctggcgacactggcaggatgctcactgctgcagccggcgcaaccggccccggcagacaactggacccgttgggtctgcgccacccaggctgaggtgctttggcgcttcgccgatgcgcaacgtgAc < 3:213526‑M1/2‑1 (MQ=255) aGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTg > 6:101496/1‑149 (MQ=255) gTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATACCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTgg > 7:279079/1‑149 (MQ=255) aCGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGACGCACCCGGTTCACCCTTGATCCGGT‑ACACCTGGTcg > 8:261326/1‑149 (MQ=255) cGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTcgc > 5:226599/1‑149 (MQ=255) tCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAAcc < 6:226599/149‑1 (MQ=255) gATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTgg > 4:333938/1‑149 (MQ=255) aTCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCTCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑Ggcg < 8:297340/135‑1 (MQ=255) aTCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑Ggcg > 7:297340/1‑135 (MQ=255) gttgCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTg > 4:143609/1‑149 (MQ=255) ttgCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTgc < 1:76413/149‑1 (MQ=255) ttgCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTgc > 1:187190/1‑149 (MQ=255) ctcactgctgcagccggcgcaaccggccccggcagacaactggacccgttgggtctgcgacacccaggctgaggtgctttggcgcttcgccgatgcgcaacgtgACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTg > 5:279473‑M1/105‑148 (MQ=255) cACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCAt > 1:59019/1‑149 (MQ=255) cACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCAt > 7:240185/1‑149 (MQ=255) cAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGc < 2:332841/149‑1 (MQ=255) gTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCCCGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCg > 5:302019/1‑148 (MQ=255) cagccggcgcaaccggccccggcagacaactggacccgttgggtctgcgacacccaggctgaggtgctttggcgcttcgccgatgcgcaacgtgACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCa > 7:310173‑M1/95‑133 (MQ=255) cagccggcgcaaccggccccggcagacaactggacccgttgggtctgcgacacccaggctgaggtgctttggcgcttcgccgatgcgcaacgtgACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCa < 8:310173‑M1/39‑1 (MQ=255) acacCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAg > 5:386209/1‑149 (MQ=255) cacCAGCCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAgc < 7:261326/149‑1 (MQ=255) acCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCAt > 6:137139/1‑139 (MQ=255) acCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCAt < 5:137139/139‑1 (MQ=255) acCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAgcg < 8:162667/149‑1 (MQ=255) acCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAgcg > 2:150302/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAgcgc > 6:375813/1‑148 (MQ=255) ggCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCa > 8:85539/1‑148 (MQ=255) gCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCa > 5:325066/1‑147 (MQ=255) cttcttCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAg > 5:28824/1‑148 (MQ=255) cttcttCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAg > 5:23296/1‑148 (MQ=255) cttcttCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGc > 4:37678/1‑149 (MQ=255) cttcGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCAc < 5:11427/148‑1 (MQ=255) cGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCt > 6:155179/1‑147 (MQ=255) gCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTcgc > 5:142790/1‑86 (MQ=255) gCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTcgc < 6:142790/86‑1 (MQ=255) ggTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTgg < 6:325066/148‑1 (MQ=255) ggTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTg < 6:131168/147‑1 (MQ=255) gtgGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGgtgt > 1:17426/1‑149 (MQ=255) ggAAGGCCAGCATGCCAGCGCTGTACAGCGCACGCGAGGCACCCTGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCg < 7:63200/149‑1 (MQ=255) gAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCg > 4:213526/1‑148 (MQ=255) ggCCAGCATGCCATCGCTCTACAGCGCACCCGAGGCACCCTGATCACCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTCGTCACGGTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGa < 8:296925/149‑1 (MQ=255) ccAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGAcc > 8:65543/1‑149 (MQ=255) cATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGtt > 8:306506/1‑98 (MQ=255) cATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGtt < 7:306506/98‑1 (MQ=255) cATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAAc < 7:65543/149‑1 (MQ=255) tGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACgg < 5:101496/149‑1 (MQ=255) gCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACggg > 4:310641/1‑149 (MQ=255) ccATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACggg < 7:81325/148‑1 (MQ=255) aTCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGc > 1:393377/1‑134 (MQ=255) aTCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGc < 2:393377/134‑1 (MQ=255) tCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCa < 1:150302/149‑1 (MQ=255) gCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAg < 2:187190/148‑1 (MQ=255) gCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGt > 2:200818/1‑149 (MQ=255) tGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAg > 5:62300/1‑109 (MQ=255) tGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAg < 6:62300/109‑1 (MQ=255) tGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTg > 2:368620/1‑149 (MQ=255) aGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGc > 6:16422/1‑149 (MQ=255) 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4:279771/1‑149 (MQ=255) ccGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCggg < 3:275082/146‑1 (MQ=255) ccGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCggg > 4:275082/1‑146 (MQ=255) ccGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGcc > 5:48446/1‑149 (MQ=255) cggCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGt < 8:240185/148‑1 (MQ=255) cccGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAAGGGCGCACGTCACCCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCCCCTCAGCCGGGGTGTCGCAGCCCCACCGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTgcg > 1:75092/1‑149 (MQ=255) cccGGTTCAGCCTTGAGACGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTgcgc > 1:282126/1‑149 (MQ=255) ccGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGcc > 2:112731/1‑149 (MQ=255) cGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCg > 5:79587/1‑149 (MQ=255) cAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTg > 3:16880/1‑148 (MQ=255) cAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGGGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTg < 3:333938/148‑1 (MQ=255) aGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTgca < 3:143609/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCAAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTgcag > 5:204680/1‑148 (MQ=255) aGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGt > 8:49821/1‑147 (MQ=255) aGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGa < 6:28824/149‑1 (MQ=255) aGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGa < 6:23296/149‑1 (MQ=255) gCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAg > 1:242954/1‑149 (MQ=255) gCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAg > 6:201322/1‑149 (MQ=255) ggT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCAt > 6:324314/1‑149 (MQ=255) gT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTGAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCa < 2:335043/105‑1 (MQ=255) gT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATc < 3:37678/149‑1 (MQ=255) ACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGc > 5:155179‑M1/1‑149 (MQ=255) | CCAGTCACGGTGCCTTGCAGCCCCGCCCAATCAGATCGTTGGTTGCCACCCAGTACACCAGGCCTTCTTCGCCCTTGGTGTGGAAGGCCAGCATGCCATCGCTGTACAGCGCACCCGAGGCACCCGGTTCAGCCTTGAGCCGGT‑ACACCTGGTCGCCGCCGCCAA‑GGCGCACGTCAACCTGGTCACGTTGCGCATCGGCGAAGCGCCAAAGCACCTCAGCCTGGGTGTCGCAGACCCAACGGGTCCAGTTGTCTGCCGGGGCCGGTTGCGCCGGCTGCAGCAGTGAGCATCCTGC > NC_002947/5652566‑5652860 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |