New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1208312 | 74 (1.160) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 5.2% | coding (689/3150 nt) | PP_1058 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1208388 | 76 (1.250) | coding (613/3150 nt) | PP_1058 | hypothetical protein |
CCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTGGGGGTAGTTGTACTGGTACAGCGT > NC_002947/1208242‑1208535 | ccGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGTCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGTAGGCCTTGGCAAAGGGtg > 6:300182‑M2/1‑147 (MQ=255) ccGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGtg > 5:171488‑M2/1‑147 (MQ=255) ccGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGtg < 7:61517‑M2/149‑3 (MQ=255) ggATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGtggc < 8:245048‑M2/149‑5 (MQ=255) ggATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGtggc < 3:273795‑M2/149‑5 (MQ=255) agaTCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGtggc > 2:96906‑M2/2‑145 (MQ=255) tctcCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTc > 2:3329/1‑148 (MQ=255) ctcCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTGCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTTGCAAAGCGtggcca > 4:153402‑M2/1‑138 (MQ=255) ctcCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGAACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTcc < 3:99/148‑1 (MQ=255) tcCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCAc > 7:175862/1‑149 (MQ=255) cgcgCCCGACACCGTCAGGCCGGCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCa < 6:27052/146‑1 (MQ=255) cgcCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGcc < 8:237492/149‑1 (MQ=255) cgcCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGcc > 2:193316/1‑149 (MQ=255) ccGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCggg < 8:61517/149‑1 (MQ=255) ccGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCggg > 4:179607/1‑149 (MQ=255) gACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGgtt < 7:207858/149‑1 (MQ=255) gACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGgtt < 6:87466/149‑1 (MQ=255) gACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGgtt > 5:146009/1‑149 (MQ=255) 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gCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGTTCGCTGCAAAGTCCGGGTACAg < 2:109134/149‑1 (MQ=255) gACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGt > 3:224273/1‑149 (MQ=255) gACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGt > 4:127775/1‑149 (MQ=255) ccTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGc > 4:136077/1‑149 (MQ=255) cTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCt > 3:382369/1‑149 (MQ=255) gCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTggg < 3:136077/149‑1 (MQ=255) gCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTgg < 4:251513/148‑1 (MQ=255) gCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGGGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTgg < 6:146009/148‑1 (MQ=255) cTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTgggg < 4:306309/149‑1 (MQ=255) tGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTggggg > 1:210807/1‑149 (MQ=255) tGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTggggg > 6:302190/1‑149 (MQ=255) tAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTGGGGGTa < 7:360855/149‑1 (MQ=255) ggcggcCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTGGGGGTAg < 7:260859/148‑1 (MQ=255) gcCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTGGGGGTAGTTGTa > 2:187953/1‑149 (MQ=255) cTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCCGGATGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGCTTTTCGATGAACAGCACGCTGTTGAACATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCTGCTACAGGTGCTGGGGGTAGTTGTACt > 4:117410/1‑149 (MQ=255) aaaGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTGGGGGTAGTTGTACTGGTa > 5:293564/1‑147 (MQ=255) cGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTGGGGGTAGTTGTACTGGTACAGCgt > 6:62505/1‑149 (MQ=255) | CCGGATCTTCTCCGCGCCCGACACCGTCAGGCCGTCGGGTGAGTGGCGATATTTCTCCAGCTGTGTGGCCAGGGTGCTGCCGCCGGCAGACTGGCCGGGCAGGGCCAGGTACTTGGCGACCTGGCTGTAGGCGGCCTTGGCAAAGCGTGGCCAGTCCACTGCCGGGTTGTTACGTGGGTCCTGGGTATCCAGCAGGTCGCGGTTTTCGATGAACAGCAAGCTGTTGACCATCACGGGAGGGATCGCTGCAAAGTCCGGGTACAGGTGCTGGGGGTAGTTGTACTGGTACAGCGT > NC_002947/1208242‑1208535 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |