New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5210219 = | 50 (0.790) | 5 (0.090) | 5/234 | NT | 9.1% | intergenic (‑85/+93) | rnd/PP_4592 | ribonuclease D/metal dependent hydrolase |
? | NC_002947 | 5210310 = | 56 (1.000) | intergenic (‑176/+2) | rnd/PP_4592 | ribonuclease D/metal dependent hydrolase |
TATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCAGGCA > NC_002947/5210166‑5210458 | tataCGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGACGCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAAAACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTAGCGGGCGTGCCCGCACCCACAGGGCtt > 1:314229/1‑148 (MQ=255) gcgcGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCtt > 7:176153/1‑149 (MQ=255) gggCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGgcc < 8:176153/149‑1 (MQ=255) tGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGccgcccgc > 4:250962/1‑149 (MQ=255) ggTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GGGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAg < 4:268323/149‑1 (MQ=255) taaaCTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑Gcc < 6:199234/148‑1 (MQ=255) aaccTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGACGGCACCACGGTGTAGGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGGGGGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑Gccg < 5:173091/146‑1 (MQ=255) aaaCTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGGGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCTGGCGGCCAAgcgc < 7:213114/148‑4 (MQ=38) tGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCTGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCATCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑Gcccgcaa > 6:171770/1‑149 (MQ=255) tCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGAAACACGGTGTATGGCACGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACACGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑Gccggcaacc > 3:170346/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑Gccggcaaccgg > 1:39753/1‑149 (MQ=255) cGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑Gccggcaaccgg > 1:1264/1‑148 (MQ=255) ttttCGGGGTGAGTCCACCCTGTGGGA‑GGGGGCGCGCCGGCGATTGATGGCAACACGGTGTATGGCCGGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCAACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCaaa < 2:274430/149‑1 (MQ=38) ttCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAAc > 4:95757/1‑148 (MQ=255) gggggCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑t < 3:304138/149‑1 (MQ=255) ggCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑Tc > 1:134557/1‑147 (MQ=255) cAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGGGTAGGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGc < 5:217332/149‑1 (MQ=255) tCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCCCAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGAc > 3:322669/1‑149 (MQ=255) 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gcgggcacgcccgcgaacccgggcaaacccgggccatacaccgtgttgccttcattcgcgggcgcgcccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTc > 6:196737‑M2/82‑149 (MQ=255) CGGGCGCGCCCGCGAATTAAGGCCACAGGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTGCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCg > 8:369738‑M1/1‑149 (MQ=255) ggcacgcccgcgaacccgggcaaacccgggccatacaccgtgttgccttcattcgcgggcgcgcccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCgg > 2:43517‑M2/79‑148 (MQ=255) GCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTa < 5:340059‑M1/149‑1 (MQ=255) CGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCAAAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATGATCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTa > 1:12016‑M1/1‑149 (MQ=255) 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ccgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTAGGTGTGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGACTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGGTg > 4:302886‑M2/15‑149 (MQ=255) cgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGa < 2:134557‑M2/136‑1 (MQ=255) cgctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGa < 2:1264‑M2/136‑1 (MQ=255) gctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCgg > 5:113423‑M2/13‑137 (MQ=255) gctcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCgg < 6:113423‑M2/125‑1 (MQ=255) tcccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGcc > 3:163160‑M2/11‑149 (MQ=255) ccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGACGAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGt > 7:66129‑M2/9‑149 (MQ=255) ccacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGt > 7:329965‑M2/9‑149 (MQ=255) cacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTg > 4:388702‑M2/8‑149 (MQ=255) cacagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACAGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTg < 2:257382‑M2/142‑1 (MQ=255) cagggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGc > 7:30727‑M2/6‑148 (MQ=255) agggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCa < 6:125010‑M2/145‑1 (MQ=255) gggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGCCTGCTGGTAGAGCTCGGGATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGCGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCAg > 5:397407‑M2/4‑149 (MQ=255) ggCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCAgg < 4:322669‑M2/147‑1 (MQ=255) cTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCTGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCAGGCa < 4:170346/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCAgg > 1:166436/1‑147 (MQ=255) cTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCAGGCa < 7:132438/149‑1 (MQ=255) | TATACGGCGCGGGCACTGCGGGTGAAACTGTCCCGCTTTTCGGGGGCAGTCCACCCTGTGGGA‑GCGGGCGCGCCCGCGAATGAAGGCAACACGGTGTATGGCCCGGGTTTGCCCGGGTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGGCTTCAGCGCTTGGCCGCCAGCCAAG‑GCCGGCAACCGGCAAACATG‑TCCAGCGACTGCTGGTAGAGCTCGGTATGTACCTGCAACAGGCCAAGCATCGAGTGGAACAGGTTGTCCTGGGACAGCGGGGCATCGCTGAGCCGTGCCAGGCA > NC_002947/5210166‑5210458 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |