New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5645143 | 70 (1.100) | 3 (0.050) | 3/258 | NT | 4.5% | coding (496/2184 nt) | PP_4954 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 5645181 | 58 (0.940) | coding (534/2184 nt) | PP_4954 | membrane protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACGGCAAGGTGGTGGCCGCGCTGAACGCAGCCAAG > NC_002947/5645035‑5645325 | acCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGgc < 6:57078‑M2/149‑3 (MQ=255) acCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGgc < 3:169523‑M2/149‑3 (MQ=255) tGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGa < 2:386930/149‑1 (MQ=255) gATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGTGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGAc > 5:146643/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGAc < 2:34058/148‑1 (MQ=255) gCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGttc < 8:137940/149‑1 (MQ=255) tGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGttcttc < 1:264374/149‑1 (MQ=255) gACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGttcttc > 3:212974/1‑147 (MQ=255) aCCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAg < 5:106606/149‑1 (MQ=255) cAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCt > 3:360294/1‑149 (MQ=255) cggcCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCt < 7:81984/149‑1 (MQ=255) gcCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTTGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTAc < 7:90975/149‑1 (MQ=255) gcCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTAc > 8:251334/1‑149 (MQ=255) aGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTg < 4:169523/149‑1 (MQ=255) tCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAg < 5:308886/149‑1 (MQ=255) aCCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGa > 1:164080/1‑145 (MQ=255) aCCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGa < 2:164080/145‑1 (MQ=255) aCCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCt > 7:83416/1‑149 (MQ=255) ccGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCt > 2:305072/1‑148 (MQ=255) cGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTc > 5:328887/1‑148 (MQ=255) gACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCaa < 8:40964/149‑1 (MQ=255) tGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTTGGTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑a > 1:294944/1‑149 (MQ=255) tGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGTCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑Ag < 1:284036/149‑1 (MQ=255) gCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCATGAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGc < 1:305072/149‑1 (MQ=255) gCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGACAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑Ag < 1:278620/147‑1 (MQ=255) aCGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCaa > 8:219984/1‑139 (MQ=255) aCGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCaa < 7:219984/139‑1 (MQ=255) aCGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTg > 4:12841/1‑149 (MQ=255) cGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGt < 1:148053/149‑1 (MQ=255) gAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGtt < 6:328887/149‑1 (MQ=255) gAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGtt < 4:212974/149‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGaa < 8:83416/149‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGaa > 4:40771/1‑149 (MQ=255) gctgctgctGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAAc < 1:161978/149‑1 (MQ=255) gctgctgctGGTGGCAGGTGCGGCCTGGGACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAAc < 7:251334/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGt > 7:354839/1‑149 (MQ=255) gCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGt > 1:203969/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCT‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGa < 5:57078/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGa < 6:41492/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGa < 6:272874/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGa < 8:146048/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGa < 3:40771/149‑1 (MQ=255) tGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAgg > 1:292447/1‑148 (MQ=255) ggTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCa > 5:54506/1‑149 (MQ=255) gggCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGgcg > 6:300010/1‑149 (MQ=255) ggCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGgcgc < 4:360294/149‑1 (MQ=255) gCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTAAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGcc > 5:357245/1‑149 (MQ=255) tgtt‑gtCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTg < 8:354839/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTgg < 5:280080/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTgg < 2:294944/149‑1 (MQ=255) tGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGgccacagcaccgacaacagcccgtaccaggccgcacctgccaccagcagcagcggttcgtgccagaagtcggagacctggccgccgcgctggtccacgccga < 7:265550‑M2/149‑103 (MQ=255) tgtgGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGgccacagcaccgacaacagcccgtaccaggccgcacctgccaccagcagcagcggttcgtgccagaagtcggt < 6:314920‑M2/117‑74 (MQ=255) tgtgGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGgccacagcaccgacaacagcccgtaccaggccgcacctgccaccagcagcagcggttcgtgccagaagtcggt > 5:314920‑M2/1‑44 (MQ=255) tgGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCcag < 6:146643/147‑1 (MQ=255) tgGCAGGCGCTGGTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCaagca < 6:391857/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACgg < 2:203969/149‑1 (MQ=255) cgcTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACgg > 1:224859/1‑148 (MQ=255) tGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACGGCAAg > 8:21461/1‑149 (MQ=255) tCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCA‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCACAGCAGAACGGCAAggtcgt > 6:392548/1‑149 (MQ=255) ccAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACGGCAAGgtggtg > 4:215671/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTgg > 4:69276/1‑122 (MQ=255) ccAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTgg < 3:69276/122‑1 (MQ=255) aGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACGGCAAGGTGGTGGCcgcg > 1:115132/1‑149 (MQ=255) gCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACGGCAAGGTGGTGGCCgcgc > 4:142168/1‑149 (MQ=255) tACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCCGTGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACGGCAAGGTGGTGGCCGCGCTGaa > 1:112449/1‑149 (MQ=255) gagCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTAAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACGGCAAGGTGGTGGCAGCGCTGAACGCAGcc > 3:306246/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACGGCAAGGTGGTGGCCGCGCTGAACGCAGCCAAg > 3:25511/1‑148 (MQ=255) | ACCATGATCGGCGTGGACCAGCGCGGCGGCCAGGTCACCGACTTCTGGCACGAACCGCTGCTGCTGGTGGCAGGTGCGGCCTGGTACGGGCTGTT‑GTCGGTGCTGTGGCAGGCGCTGTTTTCCAACCAGCCGGTACAGCA‑GAGCCTGGCCAGACTGTTCTTCGAGCTGGGCAGCTACCTGAAGCTCAAGGCC‑AGCCTGTTTGAACCGGTCCGCACGCTCGACGTCGAGGCACGGCGCCTGGAACTGGCCCAGCAGAACGGCAAGGTGGTGGCCGCGCTGAACGCAGCCAAG > NC_002947/5645035‑5645325 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |