New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 5913597 | 82 (1.290) | 5 (0.080) | 5/254 | NT | 6.3% | coding (866/1377 nt) | spuI | glutamylpolyamine synthetase |
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CACCACCTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTACGCGTACCGACCGGCTC > NC_002947/5913484‑5913774 | caccacCTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCTGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGtgc > 8:78120‑M2/1‑146 (MQ=255) accaccTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGtgct < 4:34737‑M2/149‑5 (MQ=255) ccaccTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGtgctc > 8:311217‑M2/1‑144 (MQ=255) caccTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGtgctc < 4:84739‑M2/148‑6 (MQ=255) caccTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACAACTT‑‑CACCAGCGAGCATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGtgctc < 7:215344‑M2/148‑6 (MQ=255) accTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCga < 8:200341/149‑1 (MQ=255) accTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCga < 1:260094/149‑1 (MQ=255) accTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCga < 1:390576/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGAcc < 3:84433/148‑1 (MQ=255) cATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGAcc < 3:77712/148‑1 (MQ=255) cATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGAcc < 3:34737/148‑1 (MQ=255) cATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGAcc < 3:135179/148‑1 (MQ=255) aTGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTTTCCACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGAcc < 1:117779/149‑1 (MQ=255) 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ccGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGa < 1:294174/148‑1 (MQ=255) cGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGtgctcgggatcctcgctggtgaagatgttgttgccatctttgtccagcacggaaatgtgcacgtgcaggccgttgcctgcctggcccggatagggcttggccatgaaggtg < 1:21143‑M2/149‑112 (MQ=255) cGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGAc > 7:349166/1‑148 (MQ=255) gCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAAcc < 3:117679/149‑1 (MQ=255) cAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGTTCtgctcgggatcctcgctggtgaagatgttgttgccatctttgtccagcacggaaatgtgcacgtgcaggccgttgcctgcctggcccggatagggcttggccatgaaggtggtgt < 8:265723‑M2/149‑116 (MQ=255) cAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCg > 7:61383/1‑149 (MQ=255) gAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGtgctcgggatcctcgctggtgaagatgttgttgccatctttgtccagcacggaaatgtgcacgtgcaggccgttgcctgcctggcccggatagggcttggccatgaaggtggtgtcc > 2:21143‑M2/1‑32 (MQ=255) gAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCa < 2:199614/149‑1 (MQ=255) gccgcGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCg > 3:64890/1‑148 (MQ=255) gcgcTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAgc < 5:389131/149‑1 (MQ=255) cTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCt < 2:111556/149‑1 (MQ=255) cggcccGCTGGCGGCGGGGGGCTCGAGACCCGCCCCGCGT‑CCCTGGCCTTCCTTCGCCCGAACGTCAACTCGTC‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAc < 8:349166/143‑1 (MQ=25) cGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAc < 8:60079/148‑1 (MQ=255) gTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAcgc < 4:44895/149‑1 (MQ=255) gTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAcgc < 1:27726/149‑1 (MQ=255) aCGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGTGCCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTAcgcg > 1:64743/1‑148 (MQ=255) ggTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTACGCGTACCGACCGGCTc < 2:64743/149‑1 (MQ=255) ggTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTACGCGTACCGACCGGCTc > 2:1025/1‑149 (MQ=255) | CACCACCTTCATGGCCAAGCCCTATCCGGGCCAGGCAGGCAACGGCCTGCACGTGCACATTTCCGTGCTGGACAAAGATGGCAACAACATCTT‑‑CACCAGCGAGGATCCCGAGCAGAACGCCGCGCTACGTCACGCTGTCGGCGGTGTGCTCGAGACCCTGCCCGCGT‑CCATGGCCTTCCTTTGCCCGAACGTCAACTCGTA‑CCGCCGCTTTGGCGCGCAGTTCTACGTGCCGAACGCGCCAAGCTGGGGCCTGGACAACCGCACCGTAGCGCTACGCGTACCGACCGGCTC > NC_002947/5913484‑5913774 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |