| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,699 | G→T | 8.6% | P41Q (CCG→CAG) | parA ← | chromosome partition protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,699 | 0 | G | T | 8.6% | 259.4 / 12.1 | 89 | P41Q (CCG→CAG) | parA | chromosome partition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/42); new base T (4/4); total (43/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.05e-01 | |||||||||||
GTCACGGTTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTT > NC_002947/1551‑1847 | gtcaCGGTTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCg > 5:356028/1‑149 (MQ=255) aCGGTTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGAt < 8:85272/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGa < 4:181373/149‑1 (MQ=255) ttGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAg < 5:194904/149‑1 (MQ=255) ttGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAg < 7:123240/149‑1 (MQ=255) ttGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAg < 2:183980/149‑1 (MQ=255) gCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGt < 1:216211/148‑1 (MQ=255) gCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAAAGCTCGAGCTCGTGCTTGTCAACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGCATCGAgg > 3:139108/1‑147 (MQ=255) ccGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTc > 1:178558/1‑148 (MQ=255) ccGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTc > 2:353425/1‑148 (MQ=255) ggCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGAt > 6:104028/1‑149 (MQ=255) gcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagc < 6:356028/149‑1 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagca < 3:276067/149‑1 (MQ=255) gAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCGGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGaca < 2:235163/148‑1 (MQ=255) aGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACacga < 4:182178/149‑1 (MQ=255) cTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGc > 7:17320/1‑149 (MQ=255) cTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGc > 8:308845/1‑149 (MQ=255) tCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCt > 6:381233/1‑149 (MQ=255) cGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCtt < 1:92029/148‑1 (MQ=255) cGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTACACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGGCGATCAGCAGGACACGACGCt < 6:45734/147‑1 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGacc > 2:230093/1‑118 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGacc > 2:235799/1‑118 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGacc < 1:235799/120‑3 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGacc < 1:230093/120‑3 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCg > 5:220921/1‑148 (MQ=255) ggAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGcag > 2:270508/1‑149 (MQ=255) ggAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGca < 1:213631/148‑1 (MQ=255) gCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAg > 6:56793/1‑149 (MQ=255) cATACCCTGCGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTCGACCGAATGCGCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAgg < 5:205613/149‑1 (MQ=255) tAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAggcg < 1:353425/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCCAAGTCCCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCGCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCGGCCCATGGGGGCGTTACCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGgcggcg < 2:178145/149‑1 (MQ=255) tGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAggcggc > 7:256708/1‑146 (MQ=255) ggCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGa > 6:18512/1‑138 (MQ=255) ggCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGa < 5:18512/138‑1 (MQ=255) ggCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCga < 8:256708/146‑1 (MQ=255) gCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGAtt > 6:113986/1‑149 (MQ=255) gCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGAtt < 5:113986/149‑1 (MQ=255) ccAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagca < 8:127314/108‑1 (MQ=255) ccAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagca > 7:127314/1‑108 (MQ=255) ccAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGAtt > 7:243020/1‑148 (MQ=255) tCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACa < 5:102164/149‑1 (MQ=255) cACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggt > 7:215288/1‑149 (MQ=255) tCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggtggt > 7:363167/1‑149 (MQ=255) tCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggtggt > 4:24060/1‑149 (MQ=255) ccccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt < 3:326420/149‑1 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt < 8:366255/148‑1 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTg > 7:163811/1‑149 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTg > 5:208841/1‑149 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTg > 4:282494/1‑149 (MQ=255) ccGATGACCAGGGCGTACACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTCCCCATGGGGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGt < 8:363167/149‑1 (MQ=255) gATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGGCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCt < 2:38755/149‑1 (MQ=255) cgCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGTGCTCGTGGTTGGCCACACCGCTGCCCATCGTGGCGTTGCCCTGCTGTTCGCGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCTCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGcc < 4:139108/148‑1 (MQ=255) gCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGccc > 6:229731/1‑149 (MQ=255) gTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGCGGCGGCGAGATTGCTACAGGTGGTTGTCGTGCCcaccc > 4:190694/1‑147 (MQ=255) gTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGc < 7:257456/143‑1 (MQ=255) gTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGc > 8:257456/1‑143 (MQ=255) gACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGTTCGTTGTCTAGCCCACACAACCtt > 8:146232/1‑149 (MQ=255) ccGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTc > 8:290080/1‑149 (MQ=255) cGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagcag > 6:25918/1‑75 (MQ=255) cGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCt < 8:17320/149‑1 (MQ=255) gAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTg < 8:215288/149‑1 (MQ=255) gAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTg < 5:56793/149‑1 (MQ=255) gAATGCTCGAGCTCGGGCTTGTCCAAACCGCTGCCCATGGTGGCTTTGCCCTGCGGTTGGAGGGCGATAATCAGTACACGACGCTTTGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTTATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACAGCACCTTTCTg < 1:343923/149‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGtt < 7:320670/149‑1 (MQ=255) cTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTcg > 5:185109/1‑149 (MQ=255) gCTCGTCCTTGTCCACACGGCTGCCCATGGTGGCTGGGCCCGGCGGATCGAGGGCGAGCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTTCCCACACCACCTTTCTGTTTCGCTAtt < 4:215418/149‑1 (MQ=255) cTCGTGCTTGGCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTg < 5:333980/149‑1 (MQ=255) gtcattGTCCACACCGCGTCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCTTGGTCCTTCTGCAGGACACGTCGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGc < 2:178558/143‑1 (MQ=255) gTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGc < 2:255983/78‑1 (MQ=255) gTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGc > 1:255983/1‑78 (MQ=255) gTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTCGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGGGATTGCg > 1:377137/1‑148 (MQ=255) tCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCt < 8:163811/148‑1 (MQ=255) cacaCCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTa < 6:185109/148‑1 (MQ=255) cacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGcc < 8:243020/149‑1 (MQ=255) acCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGCTACAGGTGGTTGTGTTGGCCACCCCCCCTTTCTGGTTCGCCGATGCGAAAACCTTAGGCa > 1:313724/1‑149 (MQ=255) cttggtggCGTTGCCCTGCGGTTCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 7:146232/147‑1 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCGCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 7:334420/1‑147 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGc > 3:17554/1‑98 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGc < 4:17554/98‑1 (MQ=255) tggtggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAgt < 5:104028/149‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTcc > 6:258901/1‑147 (MQ=255) gTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCa < 7:308845/149‑1 (MQ=255) gtgtccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAgt > 1:268603/5‑141 (MQ=255) gtgtccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAgt < 2:268603/137‑1 (MQ=255) tgtccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGt > 2:123623/4‑149 (MQ=255) ccTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCAt > 5:364513/1‑149 (MQ=255) ccTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCAt > 2:26446/1‑149 (MQ=255) cTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGATTGTTCCCAGTCATg > 7:261773/1‑149 (MQ=255) cTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATg > 7:370738/1‑149 (MQ=255) gCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGcc > 7:260820/1‑149 (MQ=255) ggATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCtt < 3:24060/149‑1 (MQ=255) | GTCACGGTTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTT > NC_002947/1551‑1847 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |