| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,743,363 | 0 | G | A | 7.9% | 228.8 / 6.2 | 79 | intergenic (‑196/+51) | fbp/glgP | class 1 fructose‑1,6‑bisphosphatase/glycogen phosphorylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/33); new base A (3/3); total (41/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.40e-01 | |||||||||||
GGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGC > NC_002947/5743216‑5743510 | gggAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGa < 7:199141/149‑1 (MQ=255) ggAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTg > 1:258396/1‑147 (MQ=255) ggAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTg > 7:147660/1‑147 (MQ=255) ggAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTg > 2:375856/1‑147 (MQ=255) gagaGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGaa < 7:286797/148‑1 (MQ=255) gagaGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAg > 4:313315/1‑149 (MQ=255) gACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGc < 8:40846/148‑1 (MQ=255) cGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTAGAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCga < 6:323901/148‑1 (MQ=255) cGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCga < 8:147660/148‑1 (MQ=255) cTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTCTCGCAAGCTTCAAGGCTTGCgctgtac < 5:97857/149‑7 (MQ=21) tAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACAcc > 8:171899/1‑149 (MQ=255) aGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGTCCGCTCCCACAGGTGTCTCGCAAGCTTCAAGGCTTGCGCTGTACCTGTgg < 6:320911/149‑1 (MQ=21) tgatgaGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTGTCTCGCAAGCTTCAAGGCTTGCGCTGTACCTGTGGGa < 2:168572/149‑1 (MQ=21) atgaGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCAATCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGa < 1:324073/148‑1 (MQ=255) atgaGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGc > 1:370381/1‑149 (MQ=255) atgaGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TACGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTAGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGc > 1:96476/1‑149 (MQ=255) agaCTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCgg < 1:375856/148‑1 (MQ=255) agaCTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCgg < 5:6296/148‑1 (MQ=255) agaCTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCACTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCgg < 5:42945/148‑1 (MQ=255) gaCTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGTGAGACACCTGTGGGAGCGGGc < 8:317617/149‑1 (MQ=255) gaCTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGGCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTCGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGc < 2:153006/149‑1 (MQ=255) aCTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGAC‑TTCGCCCGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGGACATCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGTCGCGGGCg > 5:204470/1‑149 (MQ=255) gCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCC‑TTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACACCTGTGGGAGCGGGCGTGc < 6:28416/148‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |