| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,749,039 | T→A | 5.3% | N314I (AAC→ATC) | typA ← | ribosome associated GTPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,749,039 | 0 | T | A | 5.3% | 217.5 / 2.1 | 75 | N314I (AAC→ATC) | typA | ribosome associated GTPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/34); new base A (2/2); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.81e-01 | |||||||||||
CCACGGCCCGAAACCTTGAACTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGAAACCGCTGATGCAGACGATATCGCCAGCCTGGGCTTCTTCGA > NC_002947/5748895‑5749186 | ccacGGCCCGAAACCTTGAACTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGAc < 4:151384/149‑1 (MQ=255) cccGAAACCTTGAACTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑Tgg > 2:232917/1‑147 (MQ=255) cccAAAACCTTGAACTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTTCCTTCTTTACAGAAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑Tgg > 5:327468/1‑147 (MQ=255) cGAAACCTTGAACTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAgg > 5:339827/1‑149 (MQ=255) cGAAACCTTGAACTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAgg > 1:48096/1‑149 (MQ=255) gAAACCTTGAACTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGt > 1:357746/1‑149 (MQ=255) gAAACCTTGAACTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGt > 4:358229/1‑149 (MQ=255) ccTTGAACTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATc < 8:3746/149‑1 (MQ=255) cTTGAATTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGCCGGTCCTGGATGTTACGGCTGGTGACGACCTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACG‑TGGAAGGT‑cgtg > 8:159761/1‑145 (MQ=255) gAACTTGTCTGGGGAGTTGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGATGACC‑TTCCAGGT‑CAACGa < 3:363728/147‑1 (MQ=255) aaCTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGaaa < 1:174462/148‑1 (MQ=255) aaCTTGTCTGGGGAGTCGGGCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGaaa < 3:34862/148‑1 (MQ=255) tCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCgg < 7:159761/149‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTCTCCTGAACGCGCATGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGCCGGGCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGCACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGcgc < 3:179206/148‑3 (MQ=255) gggAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTc < 1:244705/148‑1 (MQ=255) gggAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑g > 3:147477/1‑149 (MQ=255) gggAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑g > 8:240419/1‑149 (MQ=255) ggTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACg < 1:116462/148‑1 (MQ=255) tcCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGtt > 7:117180/1‑107 (MQ=255) tcCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGtt < 8:117180/107‑1 (MQ=255) tcCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAg > 3:314197/1‑149 (MQ=255) cTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCg > 3:217349/1‑149 (MQ=255) tGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGATGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCgg > 3:7670/1‑149 (MQ=255) aCGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCtt < 1:296477/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCa > 2:216652/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCa > 1:159008/1‑149 (MQ=255) gcAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACg > 4:303434/1‑134 (MQ=255) gcAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACg < 3:303434/134‑1 (MQ=255) gggCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGATC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCt > 8:81968/1‑149 (MQ=255) cgatcttACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTAc < 3:261622/143‑1 (MQ=255) aCAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTAc > 4:261622/1‑142 (MQ=255) cagcagCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCg < 7:81968/149‑1 (MQ=255) cagcagCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCg < 7:240419/149‑1 (MQ=255) agcagcTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCgg < 3:62925/149‑1 (MQ=255) gcagcTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCggg > 1:6294/1‑149 (MQ=255) cagcTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCgggg < 3:358229/149‑1 (MQ=255) agcTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGgc < 1:232917/149‑1 (MQ=255) cTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGgcg > 7:256055/1‑148 (MQ=255) cTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGca > 5:208656/1‑147 (MQ=255) ttGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATc < 1:312323/87‑1 (MQ=255) ttGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATc > 2:312323/1‑87 (MQ=255) gTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAg < 2:48096/147‑1 (MQ=255) ccAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCTACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGgtg > 8:274654/1‑149 (MQ=255) aGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTc > 1:281794/1‑149 (MQ=255) gACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCg < 2:6294/149‑1 (MQ=255) ggTCCTTGATGTTACGTCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACATGGTGTCGgag < 6:327468/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGATGTTACGGCTGGTGATGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGgaga < 4:7670/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGgaga < 2:190967/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGgaga < 1:216652/149‑1 (MQ=255) gTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGACGTTGACA‑TGGAAGGG‑AAGCGAAACGGGCGGATC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTAAACGCTTCTACCCAAACGGGGGCGCCCCGGGTGGCg > 2:41037/1‑145 (MQ=255) tCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGAt < 2:281794/149‑1 (MQ=255) tCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCCCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGAt < 1:223316/149‑1 (MQ=255) cTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATg > 2:109566/1‑148 (MQ=255) cTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTAGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATg > 5:168494/1‑148 (MQ=255) ttGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGaa > 6:13566/1‑149 (MQ=255) aTGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGaa > 7:352843/1‑146 (MQ=255) aTGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAg < 4:217349/149‑1 (MQ=255) gTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCACCGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCt > 2:309318/1‑149 (MQ=255) ggTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACCGTGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGaaa > 1:86090/1‑149 (MQ=255) gAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGAAACCGCTGa < 8:256055/149‑1 (MQ=255) aCTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGaaa > 8:132211/1‑140 (MQ=255) aCTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGaaa < 7:132211/140‑1 (MQ=255) gCCTTCTTTACCGCATAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGAGGACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGAAACCGCTGa < 2:74929/143‑1 (MQ=255) gCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGTGCATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGACCAGCTCATCGAAACCGCTGa > 1:74929/1‑144 (MQ=255) ccTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCTGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGAAACCGCTGATGCAGAc < 8:352843/149‑1 (MQ=255) ccGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGAAACCGCTGATGCAGACGATATCGc > 5:213811/1‑148 (MQ=255) cGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAgg > 2:62145/1‑98 (MQ=255) 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accgtttCGATGACC‑TTCCAGGT‑CAACGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATCAACAGCTCATCGAAACCGCTGATGCAGACGATATCGCAAGCCTGGGc > 8:250875/7‑149 (MQ=255) tttCGATGACC‑TTCCAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGAAACCGCTGa > 1:263358/3‑120 (MQ=255) tttCGATGACC‑TTCCAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGAAACCGCTGa < 2:263358/118‑1 (MQ=255) gTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGAAACCGCTGATGCAGACGATATCGCCAGCCTGGGCTTCTTCGa < 2:289056/149‑1 (MQ=255) | CCACGGCCCGAAACCTTGAACTTGTCTGGGGAGTCGGTCTCCTGAACGCGCAGGGCAACGTTGTACAGCAGCTCCTTGTCCAGACGGTCCTTGATGTTACGGCTGGTGACGAACTTGCCTTCTTTACCGCAGAACGGCGAGTCGTTGACC‑TGGAAGGT‑CATCGAAACGGTCGGCTC‑GTCAACGGTCAGCGGCTTCATCGCTTCTACCGCATCCGGGGCGCACAGGGTGTCGGAGATGAACAGCTCATCGAAACCGCTGATGCAGACGATATCGCCAGCCTGGGCTTCTTCGA > NC_002947/5748895‑5749186 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |