Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,791,129 | T→C | 5.7% | I197V (ATC→GTC) | hemE ← | uroporphyrinogen decarboxylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,791,129 | 0 | T | C | 5.7% | 258.8 / 3.7 | 88 | I197V (ATC→GTC) | hemE | uroporphyrinogen decarboxylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/44); new base C (3/2); total (41/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.63e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
TCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAGGGTCCAC > NC_002947/5790982‑5791274 | tCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATc > 6:243546/1‑149 (MQ=255) ccGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTgg > 6:52535/1‑149 (MQ=255) ccGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTgg > 6:197571/1‑149 (MQ=255) actgCACCTTTCTCCCCTCGTGATCTCGGATCAGTCAGCAGACGATCTTGATCATGTATTCCAGTTAGAACTCCTTATAGTCCTCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTgg < 6:390601/146‑1 (MQ=255) cGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGc > 1:126200/1‑149 (MQ=255) cGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGc > 8:60167/1‑149 (MQ=255) cGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGGCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGc < 5:213821/149‑1 (MQ=255) ggCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGcc < 3:335685/149‑1 (MQ=255) cACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGATCCTGGCCgg < 7:238149/149‑2 (MQ=255) ccTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTa < 3:167742/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGtt > 8:4382/1‑147 (MQ=255) cTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGtt > 2:363131/1‑147 (MQ=255) cTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTaa < 2:305042/149‑1 (MQ=255) tgcatcccTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAg < 2:259974/143‑1 (MQ=255) gcgcCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAgg < 6:34525/148‑1 (MQ=255) cgcCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGt < 1:143931/148‑1 (MQ=255) gcCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAg > 8:251721/1‑149 (MQ=255) gcCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCACTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAgg > 8:339587/1‑146 (MQ=255) cccTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCt < 5:143451/149‑1 (MQ=255) ccTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTg > 4:124643/1‑149 (MQ=255) gTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTg > 7:268524/1‑145 (MQ=255) gTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTg < 8:268524/145‑1 (MQ=255) gTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGa < 7:41023/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGa > 3:297282/1‑149 (MQ=255) gcgGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACt > 5:69893/1‑149 (MQ=255) ggATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTgg < 4:161899/149‑1 (MQ=255) ggATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTgg < 5:52535/149‑1 (MQ=255) ggATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTgg < 7:60167/149‑1 (MQ=255) ggATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTgg < 7:4382/149‑1 (MQ=255) ggCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGc < 2:126200/149‑1 (MQ=255) cacTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGACAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTg < 7:339587/147‑1 (MQ=255) cGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTTTACTGCCTGGGCGCCGGCCAGGAGCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTg < 6:289951/149‑1 (MQ=255) cGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCcagc < 1:172430/149‑1 (MQ=255) gcgcATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCcagcagc < 6:69893/145‑1 (MQ=255) gcgcATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCcagca < 2:62299/143‑1 (MQ=255) cATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCa < 5:243546/149‑1 (MQ=255) cATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCACCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCa < 2:318761/149‑1 (MQ=255) aGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGACCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCt > 2:359220/1‑149 (MQ=255) gCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTg > 5:133737/1‑149 (MQ=255) ccAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGc < 3:370572/149‑1 (MQ=255) aGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTc > 2:226713/1‑125 (MQ=255) aGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGATGGTGCCCGCCTGGGCCAGCTTGTCCAGCGGCAGGGGCAGGGCTTGCgg > 5:56106/1‑149 (MQ=255) gggAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCggg < 2:3466/149‑1 (MQ=255) gggAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCggg > 7:180080/1‑149 (MQ=255) ggAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCcagcagcag < 2:48856/132‑1 (MQ=255) ggAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCcagcagcag > 1:48856/1‑132 (MQ=255) gagaACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGtt < 3:124643/149‑1 (MQ=255) tCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCg > 6:29550/1‑147 (MQ=255) cTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAgg > 7:29125/1‑149 (MQ=255) cTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAg < 4:297282/148‑1 (MQ=255) gATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGc > 7:240823/1‑148 (MQ=255) gccgccgccGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTGGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGc > 8:84189/1‑149 (MQ=255) ccgccgccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGcc < 1:363131/149‑1 (MQ=255) cggcgccgACAGGTTGCCGCGCCAGGTGGTGAAGATCTGTTCGGCGTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCt < 6:16171/146‑1 (MQ=255) cgccgccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCt > 4:306891/1‑149 (MQ=255) ccgccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTg < 5:197571/149‑1 (MQ=255) aggtcgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTg < 6:288447/145‑1 (MQ=255) gccgACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGt > 1:148401/1‑149 (MQ=255) ccgAGAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTc < 8:240823/149‑1 (MQ=255) gACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCtt < 7:251721/149‑1 (MQ=255) gACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCtt > 2:10892/1‑149 (MQ=255) gACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCtt > 6:48986/1‑149 (MQ=255) gACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGACCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCtt < 1:359220/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCgg > 3:168702/1‑148 (MQ=255) gTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCgg > 3:255167/1‑148 (MQ=255) 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gccCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGAACGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCt > 5:324804/1‑149 (MQ=255) ccccAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGGGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCtt < 6:352179/149‑1 (MQ=255) cccAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTc > 7:112180/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTcg < 3:306891/149‑1 (MQ=255) tCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAgc < 1:144106/148‑1 (MQ=255) gAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAgccgc > 2:146396/1‑149 (MQ=255) aaGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACAGACTCGGCCAGCTTGTCAAGCAGCAGGTGCAGGGCTAGCGGTTTGTCGTATGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAATTCATTCGACGAgccgcc > 5:243709/1‑149 (MQ=255) aTCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTc > 4:144382/1‑149 (MQ=255) tACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCa > 2:301559/1‑149 (MQ=255) tACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCa < 3:144382/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtag < 5:48986/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtagg > 2:218533/1‑149 (MQ=255) ccttaacGGCCAGATCCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCTGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtagg > 2:25398/7‑147 (MQ=255) cttaacGGCCAGATCCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATgtaggtag > 2:125610/6‑149 (MQ=255) cGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAgg < 8:180080/149‑1 (MQ=255) cGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAgg < 1:280831/149‑1 (MQ=255) cGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAgg < 5:29550/149‑1 (MQ=255) ggATATGGCCGTTAAGGTAGCTTGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGAAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAGGGTCCAc < 6:324804/149‑1 (MQ=255) | TCACCGGCACCTTGCGCCCCTCGTGCTCGCGGATCAGGCCGCTGACGATCTTGCGCATGTAGGCCAGGGAGAACTCCTGATAGGCCGCCGCCGACAGGTTGCCGCCCCAGGTGTCGAAGATCTGTACGGCCTGGGCGCCGGCCAGGATCTGGCCGTTAAGGTAGCTGGTGACCGACTGGGCCAGCTTGTCCAGCAGCAGGTGCAGGGCTTGCGGGTTGTCGTAGGCCATGGCCTTGGTCTTGCGGAAGTCCTTCGACGAGCCGCCTTCGACCATGTAGGTAGCCAGGGTCCAC > NC_002947/5790982‑5791274 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |