| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,894,573 | A→G | 5.5% | V258A (GTG→GCG) | cysW ← | sulfate ABC transporter permease CysW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,894,573 | 0 | A | G | 5.5% | 214.6 / 2.3 | 73 | V258A (GTG→GCG) | cysW | sulfate ABC transporter permease CysW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/37); new base G (2/2); total (34/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.25e-01 | |||||||||||
GAAGCTGTTGAAGCGCTTGCTGACGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTACACAGCACCACGCCGT > NC_002947/5894425‑5894720 | gAAGCTGTTGATGCGCTTGCTGACGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCa < 8:108702/149‑1 (MQ=255) aGCTGTTGAAGCGCTTGCTGACGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACg < 3:382140/149‑1 (MQ=255) gCTGTTGAAGCGCTTGCTGACGTTACGATCTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGc > 1:225090/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCGCTTGCTGACGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGaa < 7:13701/149‑1 (MQ=255) gcTTGCTGACGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCcgc > 8:290757/1‑148 (MQ=255) gCTGACGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGt > 7:314785/1‑149 (MQ=255) cTGACGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTg < 7:45868/149‑1 (MQ=255) tGACGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTg > 6:227337/1‑134 (MQ=255) tGACGTTACGAACCTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTg < 5:227337/134‑1 (MQ=255) actgaaCGAACATCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGtt < 8:315141/144‑1 (MQ=255) aCGTTACTAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGtt < 1:135261/149‑1 (MQ=255) aCGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTgg < 6:183151/147‑1 (MQ=255) aCGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGt < 8:26893/148‑1 (MQ=255) gTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACATGCTGGCCACGATGAAGGACGCGTCGTGGTTg > 4:41882/1‑148 (MQ=255) gTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGa < 6:223301/140‑1 (MQ=255) gTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGa > 5:223301/1‑140 (MQ=255) aCGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTAc < 3:265018/148‑1 (MQ=255) aCGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACt > 5:367484/1‑149 (MQ=255) cGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTc < 5:353908/149‑1 (MQ=255) gAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCg > 5:33873/1‑149 (MQ=255) gAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCg > 4:82172/1‑149 (MQ=255) gAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCg > 1:328434/1‑149 (MQ=255) aCTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGtt < 3:82172/149‑1 (MQ=255) aCTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGtt < 4:171037/149‑1 (MQ=255) cTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTg < 7:290757/149‑1 (MQ=255) ttCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTg > 5:167410/1‑148 (MQ=255) atcgaCATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTagag < 1:235169/149‑1 (MQ=255) tGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTcc < 1:285434/149‑1 (MQ=255) aTTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATg > 3:88438/1‑148 (MQ=255) ttCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATg > 8:89750/1‑147 (MQ=255) tcctccGCGGCGCTGTGGCGCAGGTGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTAc < 7:226919/123‑1 (MQ=255) tcctccGCGGCGCTGTGGCGCAGGTGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTAc > 8:226919/1‑123 (MQ=255) cctccGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAg < 6:339204/148‑1 (MQ=255) ctccGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCg > 7:46405/1‑149 (MQ=255) tccGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCgg > 3:267845/1‑149 (MQ=255) gcgcTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGgt < 2:328434/149‑1 (MQ=255) gcTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGgtgt < 6:367484/149‑1 (MQ=255) tgGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTg < 6:68178/147‑1 (MQ=255) cAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCGCGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGc > 7:239838/1‑149 (MQ=255) cGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACg > 8:67426/1‑149 (MQ=255) ggTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACg > 5:8671/1‑148 (MQ=255) ttAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCGCGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGAt < 8:239838/149‑1 (MQ=255) ctcGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGac < 6:33873/148‑1 (MQ=255) gCTCCACTGCTTGAGCAGGAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACATGCTGCCCACGCTGAAGGCCGCGTCGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGCATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGAcacca < 3:41882/149‑1 (MQ=255) gCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGAcacca > 4:50136/1‑149 (MQ=255) tCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACaccacc > 1:13884/1‑149 (MQ=255) cACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCGCGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGccc < 1:89748/138‑1 (MQ=255) cACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCGCGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGccc > 2:89748/1‑138 (MQ=255) cACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGa > 2:112105/1‑149 (MQ=255) aCTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTg < 8:9953/83‑1 (MQ=255) aCTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTg > 7:9953/1‑83 (MQ=255) aCTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGa > 7:265203/1‑148 (MQ=255) cagcagcAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACcgc < 6:12997/146‑1 (MQ=255) agcagGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCaaa > 3:345789/1‑149 (MQ=255) gATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGc > 7:118714/1‑149 (MQ=255) gATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGc < 4:345789/149‑1 (MQ=255) gAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCGGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCa > 2:189973/1‑149 (MQ=255) agagCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATg < 8:314785/149‑1 (MQ=255) agagCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATg > 3:290985/1‑149 (MQ=255) agagCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATg < 8:118714/149‑1 (MQ=255) agCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGc < 6:8671/149‑1 (MQ=255) aGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCcgcgc < 4:267845/149‑1 (MQ=255) aGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCcgcgc < 4:290985/149‑1 (MQ=255) gATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACTTGGTTGTAGTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCgg < 8:46405/149‑1 (MQ=255) gATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCgg < 2:225090/149‑1 (MQ=255) tCAGCAACCGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTa > 5:337690/1‑149 (MQ=255) aGCAACAGGCTGGCCACGCTGAGGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTaca > 7:247930/1‑149 (MQ=255) aGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTac < 7:122712/148‑1 (MQ=255) gCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTac > 8:122712/1‑147 (MQ=255) aaCAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTACACAg > 3:60538/1‑149 (MQ=255) aaCAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTACACAg < 6:337690/149‑1 (MQ=255) aGGCTGGCCACGCTGAAGTCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTACACAGcac < 4:88438/149‑1 (MQ=255) ccACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTACACAGCACCACGCCg > 6:398518/1‑149 (MQ=255) cACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTACACAGCACCACGCCGt < 6:288972/149‑1 (MQ=255) aCGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTACACAGCACCACGCCGt > 5:152016/1‑148 (MQ=255) | GAAGCTGTTGAAGCGCTTGCTGACGTTACGAACTTCGATCGACATGAATCATTCCTCCGCGGCGCTGTGGCGCAGGCGGTTAATACGGTTCTCGCTCCACTGCTTGAGCAGCAGGATGAAGAGCGCCAGGATCAGCAACAGGCTGGCCACGCTGAAGGCCGCGACGTGGTTGTACTCGTTGTAGAGGATCTCCACATGCAGCGGCAAGGTGTTGGTCACGCCACGGATGTGGCCCGACACCACCGACACCGCGCCAAACTCGCCCATGGCCCGCGCGGTACACAGCACCACGCCGT > NC_002947/5894425‑5894720 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |