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cTGGCGGGCGAACCAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAggcgct < 5:272072/149‑1 (MQ=255) tGGCGGGCGAACCAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAggcgctg > 5:216990/1‑149 (MQ=255) ggcgggcgAACCAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTc < 8:169218/112‑1 (MQ=255) ggcgAACCAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAggcgctggcgct > 6:213799/1‑149 (MQ=255) gcgAACCAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGgcgctggcgctg > 3:28208/1‑149 (MQ=255) gAACCAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGt > 4:180721/1‑149 (MQ=255) gAACCAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGt < 7:8564/149‑1 (MQ=255) gAACCAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGt > 6:356963/1‑149 (MQ=255) cAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGt < 4:268327/116‑1 (MQ=255) cAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGt > 3:268327/1‑116 (MQ=255) cAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGa > 5:357236/1‑147 (MQ=255) cAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGa > 4:134302/1‑147 (MQ=255) cAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGa > 3:14989/1‑147 (MQ=255) cAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATa < 6:240864/149‑1 (MQ=255) aGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGTGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAg < 2:380143/149‑1 (MQ=255) aGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAg > 2:389236/1‑149 (MQ=255) aGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATACCCAGTTCCAGGCGCTCGCGCTGGAGATac > 6:240956/1‑148 (MQ=255) aGCTTTTTGCCGGTGACAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAg < 3:233852/149‑1 (MQ=255) cTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGc < 7:236924/149‑1 (MQ=255) | CGGCACCCAGGTACGGTGGGTAGAGGTTCAGCATCCAGCGCAGCATGCGCGCCCGGCGCGCCAGTTTACGCGGGTTGCTCATGCCTGGCCCCGCGGATCAGGGCGGGTGCCCAGGCCCATCGCCTGGCGGGCGAACCAGCTTTTTGCCGGTGGCAACAGGTCGAGCCCGAGCAGGCCAAGGTTGCGTCCGGCCGTCAGCAACGGCTGATTGCTGCCGAACAGGCGGGTGACCTGGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGC > NC_002947/5930792‑5931079 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |