| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,931,171 | T→C | 18.7% | Q300R (CAG→CGG) | ubiH ← | 2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenyl hydroxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,931,171 | 0 | T | C | 18.7% | 162.6 / 31.1 | 80 | Q300R (CAG→CGG) | ubiH | 2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenyl hydroxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/32); new base C (7/8); total (40/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
GGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGC > NC_002947/5931025‑5931318 | ggTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTgg > 4:42383/1‑149 (MQ=255) gTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGc > 1:156766/1‑149 (MQ=255) gTCGGAGAAGCCGATGGGCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTg < 8:18004/147‑1 (MQ=255) ggAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTACTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGACAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCcg > 4:47953/1‑149 (MQ=255) aGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGGCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATg < 4:28208/149‑1 (MQ=255) gCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATgg > 4:381205/1‑149 (MQ=255) gCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATgg > 6:362314/1‑149 (MQ=255) gATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGt < 5:160979/149‑1 (MQ=255) gccatCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGt < 7:333799/144‑1 (MQ=255) tCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCTGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAgg > 4:244997/1‑149 (MQ=255) tCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAgg < 1:371821/149‑1 (MQ=255) tCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAgg > 1:212981/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCtgt < 5:234721/148‑1 (MQ=255) gTCCTGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGTCTGCAGCGTTGTCAGGTAGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGAAAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTTTGtgct < 7:315471/148‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACTGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGtgctgc < 7:198902/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGtgctgc < 7:134347/149‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGtgctgc > 5:316093/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCGTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGtgctgc < 8:270185/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCg > 5:306923/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGt > 3:298182/1‑149 (MQ=255) gcgctggTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGca < 4:298182/149‑1 (MQ=255) gctggTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGcacc < 6:316093/149‑1 (MQ=255) gggATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCAccacca < 5:296677/147‑1 (MQ=255) tGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAg > 2:193917/1‑149 (MQ=255) aTAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGt > 1:250976/1‑149 (MQ=255) tAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTg < 4:38405/149‑1 (MQ=255) cTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGtgctg < 1:189853/122‑1 (MQ=255) cTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGtgctg > 2:189853/1‑122 (MQ=255) aGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCAc > 6:45566/1‑149 (MQ=255) gTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCAccgg > 5:60432/1‑147 (MQ=255) tCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGcaccac > 7:267612/1‑127 (MQ=255) tCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGcaccac < 8:267612/127‑1 (MQ=255) tCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTggtgg < 4:94789/149‑5 (MQ=255) gttCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTgg < 1:41918/147‑1 (MQ=255) ggTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTgg < 5:362314/149‑1 (MQ=255) gTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTggg < 5:45566/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGCCAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAg < 5:277851/123‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAg > 6:277851/1‑123 (MQ=255) gCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTggg < 1:17315/146‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTggg > 2:17315/1‑146 (MQ=255) cAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTc > 3:178110/1‑148 (MQ=255) tggCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGa < 7:200294/148‑1 (MQ=255) gcgctgctGGCGGGCCCACAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCCCGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGGCTCGa > 5:104696/3‑149 (MQ=255) aGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGa > 4:112414/1‑149 (MQ=255) cgctgctGGCGGGCCCACAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGAt > 5:355882/2‑149 (MQ=255) gctgctGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCGGCGCCTGGGCCTCCAta > 8:200294/1‑148 (MQ=255) tgctgTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATc > 3:34056/1‑147 (MQ=255) ctgTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAg < 6:306923/148‑1 (MQ=255) ctgTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAg > 6:4980/1‑148 (MQ=255) tgtgGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGa > 2:224291/1‑149 (MQ=255) tgGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGa < 2:250976/147‑1 (MQ=255) gggCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAg > 5:96944/1‑149 (MQ=255) ggCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGc < 3:254990/149‑1 (MQ=255) ggCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGc > 7:87918/1‑149 (MQ=255) ggCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGc > 3:54846/1‑149 (MQ=255) ccGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCggg < 8:87918/149‑1 (MQ=255) cGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGt < 2:217501/149‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTa < 5:4980/149‑1 (MQ=255) cagcagCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTaga < 3:381205/149‑1 (MQ=255) agcagcGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTtgag < 3:42383/149‑1 (MQ=255) agcagcGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTagag > 1:6680/1‑149 (MQ=255) cgcTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCCGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGcc < 4:54846/149‑1 (MQ=255) 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aaCCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGaa > 4:118951/1‑148 (MQ=255) cccTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGCGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAacac > 8:176433/1‑149 (MQ=255) cTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGc < 3:118951/149‑1 (MQ=255) | GGTCGGAGAAGCCGATGGTCATAGCCTGGTCCAGGCGCTGGCGCTGGTGATAGGCCTGCAGCGTGGTCAGGTCGCCAGGCTGCTGTGGGCCCGCCAGCAGCGCTTCGGCCAGGGCCTGCACATCACGCAACGACAGATTGAAACCCTGGCCCGCGATGGGGTGCAGGCTGTGTGCTGCGTTGCCCAGCACCACCAGGTGCGGCCGCACCTGCTCCTGGGCCTCGATCAAGGACAGCGGGTAGAGGTGCCGTGCGCCAACTTGGCGCAGCGCGCCCAGGCGGTAGCCGAACACGC > NC_002947/5931025‑5931318 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |