Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,948,139 | G→A | 9.1% | A112V (GCC→GTC) | rho ← | transcription termination factor Rho |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,948,139 | 0 | G | A | 9.1% | 181.1 / 5.3 | 66 | A112V (GCC→GTC) | rho | transcription termination factor Rho |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/31); new base A (4/2); total (32/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.34e-01 |
ACGCGACCGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAACGCAG > NC_002947/5947992‑5948281 | aCGCGACCGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGc < 6:284883/149‑1 (MQ=255) gcgACCGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCg > 5:282603/1‑148 (MQ=255) gcgACCGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCg > 3:356290/1‑148 (MQ=255) gcgACCGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACg > 1:193071/1‑148 (MQ=255) aCCGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGACTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAg > 8:175498/1‑148 (MQ=255) cGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTaa < 2:40657/149‑1 (MQ=255) gTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCATGGCGAAGTAAc > 7:372434/1‑148 (MQ=255) gTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACg < 3:221497/149‑1 (MQ=255) tCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGc > 2:20541/1‑149 (MQ=255) aaGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTc > 5:190303/1‑149 (MQ=255) aaGTCCTCGGTGGACCCCTTACCGGCCTCCAACGTCACGCGCTTGATCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTACGAACAGGATCATGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGCTCGAAGTTGATGGTATCGCCCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTc > 6:274376/1‑149 (MQ=255) aGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTcc < 3:333637/149‑1 (MQ=255) ccTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTcccc < 3:106269/148‑1 (MQ=255) ccGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAggg < 6:60256/129‑1 (MQ=255) ccGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTgg > 5:134283/1‑149 (MQ=255) gTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGc < 2:209284/149‑1 (MQ=255) gTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGc < 3:198575/149‑1 (MQ=255) ttACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCg > 2:14681/1‑149 (MQ=255) cGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATc > 2:35848/1‑149 (MQ=255) cGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATc < 2:193071/149‑1 (MQ=255) gCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCtt < 5:350171/149‑1 (MQ=255) tgcATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGCTCTTGTTGTTCGCGTTGTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGGCCGTCAGCAGGGCGAAGTAGCGCTCGCCTGCCTGCGGTGGCGGGAGCTTGcc > 4:305900/3‑149 (MQ=255) ccATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCcg > 4:344215/1‑149 (MQ=255) cATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCcg < 6:282603/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGAt < 4:45955/147‑1 (MQ=255) cAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATgg > 3:29900/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGgtgt > 3:388092/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCGTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACGTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGgtgt > 4:89229/1‑149 (MQ=255) cTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTCTCGc > 3:177659/1‑149 (MQ=255) cTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTCTCGc < 7:117849/149‑1 (MQ=255) tCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTa > 7:172553/1‑149 (MQ=255) ggAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCTCATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGc < 1:35848/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAg < 8:172553/149‑1 (MQ=255) aGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTCTCGCCGGTACGCAGGtt < 3:344215/149‑1 (MQ=255) ggcgTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGaa < 4:356290/149‑1 (MQ=255) gTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGa < 6:100265/149‑1 (MQ=255) gAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATctgg < 1:20541/148‑1 (MQ=255) gAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATctgg < 5:172893/148‑1 (MQ=255) gAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTCTCGCCGGTACGCAGGTTGaaa < 5:316227/136‑1 (MQ=255) gAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTCTCGCCGGTACGCAGGTTGaaa > 6:316227/1‑136 (MQ=255) ttGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCgaga > 1:159802/1‑148 (MQ=255) tGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGCAGTAATGCTCCGGTTCGTTCGCTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTTCGCAGGTTGATACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACa > 5:89379/1‑149 (MQ=255) ggtcttcGAGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCTGCAGGGCGAAGTAAGGCTCCCCTTCCTTCTGTGGGCGTTTCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGAc < 5:274376/145‑1 (MQ=255) gTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGAGCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCga < 6:190303/144‑1 (MQ=255) ttcttaGCTTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCGCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATa < 8:372434/149‑1 (MQ=255) ttcGCGTTTTCCGGGCGGTCGAGGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGaa > 5:255012/1‑148 (MQ=255) ttcGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGa > 4:193487/1‑148 (MQ=255) ttcGCGGTGTCCGGGCGGTCGATGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAg < 6:255012/147‑1 (MQ=255) gcgTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATc < 7:175498/149‑1 (MQ=255) cGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTgg < 5:401304/147‑1 (MQ=255) cGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTgg > 6:401304/1‑147 (MQ=255) gggCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGggcc < 4:388092/149‑1 (MQ=255) gCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGACGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGggccgg > 1:45070/1‑149 (MQ=255) ggTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGggccggcc < 4:29900/149‑1 (MQ=255) tagAAGTTGATGGTATAGACCTTCAGCAGGGAGAAGTAACGCTCACCTTCCTTCTTTGGGAGGATCTTGCCGACGATGGTCTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCAGGGCGAGCAATAGATATCGTCTTGGCCGGACAg > 7:188573/3‑149 (MQ=255) tCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCga < 2:227804/122‑1 (MQ=255) tCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCga > 1:227804/1‑122 (MQ=255) tCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAg > 2:150655/1‑149 (MQ=255) tGATGTTATCGACCTTCAGCAGGTCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTTCCGACGTTGGTCTCGCCGGTACGCATTTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTTGGCCGGCCAGGTATGa < 8:188573/148‑1 (MQ=255) gATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACg > 8:292795/1‑149 (MQ=255) tGGTATCGCCCTTCAGCAGGACGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAACCGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGCTATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACgga > 6:101758/1‑147 (MQ=255) tGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCa < 1:150655/149‑1 (MQ=255) aTCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAg > 8:92273/1‑149 (MQ=255) gACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGcc < 3:89229/148‑1 (MQ=255) tCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAACg > 5:52887/1‑148 (MQ=255) agcagGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAACGCAg < 6:134283/149‑1 (MQ=255) agcagGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTCTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAACGCa < 4:177659/148‑1 (MQ=255) | ACGCGACCGGTCAAGTCCTCGGTGGAGCCGTTACCGGCCTCCATCTTCAGGCGCTTGTTCGGGAACAGCGGCGTCAGGTTTTCGAACAGGATCTTGTTCTTCGCGTTTTCCGGGCGGTCGAAGTTGATGGTATCGACCTTCAGCAGGGCGAAGTAACGCTCCCCTTCCTTCGGTGGGCGGATCTTGCCGACGATGGTGTCGCCGGTACGCAGGTTGAAACGGCGGATCTGGCTGGGCGAGACATAGATATCGTCTGGGCCGGCCAGGTAGGACGCATCAGCCGAACGCAG > NC_002947/5947992‑5948281 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |