| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,959,826 | T→C | 6.4% | D36G (GAC→GGC) | rnk ← | nucleotide diphosphokinase regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,959,826 | 0 | T | C | 6.4% | 225.5 / 4.2 | 78 | D36G (GAC→GGC) | rnk | nucleotide diphosphokinase regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/38); new base C (2/3); total (37/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.94e-01 | |||||||||||
CCGGCCCGGCATCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAATGT > NC_002947/5959680‑5959971 | ccggcccggcATCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTc < 7:344432/148‑1 (MQ=255) ggcccggcATCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTGCCGCGTGCCCGACCACCGGGTCGGCGCGGTCCCGCGCGTCCTg > 8:248813/1‑149 (MQ=255) gcccggcATCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTg > 6:183822/1‑148 (MQ=255) ccggcATCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAg > 3:185544/1‑149 (MQ=255) cggcATCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAgg > 1:297194/1‑149 (MQ=255) tCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGGCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGCCCTGCAGGACGAg < 2:58214/149‑1 (MQ=255) ttGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGCCCTGCAGGACGAGc < 3:261024/147‑1 (MQ=255) ttGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGCCCTGCAGGACGAGc > 4:261024/1‑147 (MQ=255) ggggTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGcac < 4:13194/147‑1 (MQ=255) gggTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACAcc < 1:354719/149‑1 (MQ=255) gggTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTCCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACAcc < 5:353881/149‑1 (MQ=255) ggTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACAccc < 2:107015/149‑1 (MQ=255) ggTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACAccc > 5:350697/1‑149 (MQ=255) ggTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACAccc < 1:257070/149‑1 (MQ=255) tACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCgg < 7:325622/149‑1 (MQ=255) cacCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCg < 7:270602/149‑1 (MQ=255) acCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCg > 8:355593/1‑148 (MQ=255) cAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTAc > 1:89262/1‑149 (MQ=255) cAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTAc > 1:120170/1‑149 (MQ=255) tCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACtctc < 7:355593/148‑1 (MQ=255) aGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGCCCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCtcgtc > 5:283863/1‑149 (MQ=255) gtggtAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGa < 8:159397/149‑1 (MQ=255) gtggtAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGa < 7:106087/149‑1 (MQ=255) ggtAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAgg > 6:179640/1‑149 (MQ=255) aGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTg > 4:57743/1‑149 (MQ=255) gTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGt > 1:27050/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGAt < 2:297194/147‑1 (MQ=255) gCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGAc > 2:189701/1‑149 (MQ=255) gCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTc < 6:350697/149‑1 (MQ=255) cTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCa < 4:370145/146‑1 (MQ=255) cTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCa > 3:370145/1‑146 (MQ=255) cTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGCCCTGCAGGACGAGctt > 7:340087/1‑103 (MQ=255) cTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGCCCTGCAGGACGAGctt < 8:340087/105‑3 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAg > 6:105195/1‑125 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAg < 5:105195/125‑1 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACg < 3:253615/140‑1 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACg > 4:253615/1‑140 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACg > 5:255525/1‑149 (MQ=255) tCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTACCTCCTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCAGCAGCGCGAGCACACCCGGCGAACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACg > 6:277554/1‑149 (MQ=255) cACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGc > 5:21910/1‑149 (MQ=255) gCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGc < 4:62600/136‑1 (MQ=255) gCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGc > 3:62600/1‑136 (MQ=255) tGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTc > 6:322837/1‑149 (MQ=255) tGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGGACGTc < 5:179640/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATc < 5:329805/123‑1 (MQ=255) aCCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATc > 6:329805/1‑123 (MQ=255) ccGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATc > 5:183036/1‑149 (MQ=255) gcgAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCgg < 4:185544/149‑1 (MQ=255) gTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGa < 8:136885/149‑1 (MQ=255) gTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGa < 5:84336/149‑1 (MQ=255) gTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGa < 4:55396/149‑1 (MQ=255) cATGGTCACCATGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAgg < 7:187072/148‑1 (MQ=255) aTGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGAt > 8:25488/1‑149 (MQ=255) ggTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGAt > 2:188780/1‑147 (MQ=255) ccacGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACg < 6:204849/118‑1 (MQ=255) ccacGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGACGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACg > 5:204849/1‑118 (MQ=255) gaccgccgGCACTTCCTCGTGACACACCACCTGCTCGGCGCGTTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCCGCGTAATCACGTCGAGAATGTCGATCAGACCCTCCAGACGCTGTACGACCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCt > 5:163407/3‑149 (MQ=255) cccgccGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCtt > 2:221418/1‑149 (MQ=255) ccgccgGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTg < 6:189631/149‑1 (MQ=255) ccgccgGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTg < 2:89262/149‑1 (MQ=255) ccgccgGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTg < 2:27050/149‑1 (MQ=255) ccgGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAATCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTAGATCa > 4:344547/1‑96 (MQ=255) ccgGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGAGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCa < 3:344547/96‑1 (MQ=255) cACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCa < 5:183822/149‑1 (MQ=255) aCTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCATCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCAt > 4:136317/1‑149 (MQ=255) ccTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGAGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGCTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGAt > 5:175007/1‑148 (MQ=255) cTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATcc < 6:255525/149‑1 (MQ=255) cGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTgg < 7:303201/135‑1 (MQ=255) cGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTgg > 8:303201/1‑135 (MQ=255) tGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTACTGCAGGGCGAGCACAACCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTc < 7:218023/149‑1 (MQ=255) ccgaccACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGa < 5:322837/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCGCGGTCACGCTCGTCCGGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATGAGACGGTCCAGACGCTGTTCGTGCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCttt < 5:277554/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGaa > 5:215551/1‑149 (MQ=255) cTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGa < 1:188780/147‑1 (MQ=255) tCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGtttt < 2:120170/149‑1 (MQ=255) aaGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTc > 4:7595/1‑148 (MQ=255) tCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAAtgt > 7:307216/1‑149 (MQ=255) gTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAAtgt < 1:201967/147‑1 (MQ=255) | CCGGCCCGGCATCCTTGGGGTACACCAGTGTCAGGTGGTAGTCCTTGCCGCTGGCTTCCTCACGGCAGTGCACCCGCGAGTTCATGGTCACCACGCCCGCCGGCACTTCCTCGTGACCGACCACCTGCTCGGCGCGGTCAAGCTCGTCCTGCAGGGCGAGCACACCCGGCGTACTCTCGTCGAGGCTGTCGATCAGACGCTCCAGACGCTGTACGTCCAATCGGGTGAGGATGAGGGAAGGCTTGGTGCTCATGATCCAGTCAGACTCCTTTGAACAGGCAGTTTTCAATGT > NC_002947/5959680‑5959971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |