| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,987,906 | C→A | 5.0% | L330M (CTG→ATG) | kefB‑III → | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,987,906 | 0 | C | A | 5.0% | 451.6 / 10.2 | 139 | L330M (CTG→ATG) | kefB‑III | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (65/65); new base A (2/5); total (67/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.63e-01 | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
ATCAGCGTGGGCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGA > NC_002947/5987759‑5988053 | gTGGGCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCt < 2:41285/149‑1 (MQ=255) tGGGCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTg > 5:49531/1‑149 (MQ=255) tGGCCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTg < 3:126007/149‑1 (MQ=255) ggCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTgg < 7:84838/148‑1 (MQ=255) ggCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTgg < 5:284560/148‑1 (MQ=255) gggCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAATGGCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATg > 1:235779/1‑149 (MQ=255) gggCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATgg > 1:145278/1‑149 (MQ=255) cAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTgg > 8:158479/1‑149 (MQ=255) cAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCACCATGCCCAGGCGCAGGGCGCTgg < 4:154112/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCACCATGCCCAGGCGCAGGGCGCTggcg < 8:58322/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTCGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTggcgg < 4:29585/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCACCATGCCCAGGCGCAGGGCGCTggcgct < 6:140078/149‑3 (MQ=38) gcgcCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATgg > 7:211857/1‑137 (MQ=255) cgcCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCg < 4:367711/148‑1 (MQ=255) cgcCTGCTGCTGGAAAT‑GCCAATGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGATGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGACTGAACAGCTCCACCGCCCTGCGCCTGGGCATGTGTCTGGCGGCggg > 8:343727/1‑149 (MQ=255) ctgctgctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTgg < 1:202002/149‑1 (MQ=255) tgctgctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGc > 4:145212/1‑149 (MQ=255) ctgctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGc < 2:203290/147‑1 (MQ=255) ctgctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGc < 6:293244/147‑1 (MQ=255) ctgctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGc < 5:221074/147‑1 (MQ=255) ctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCTAGtt > 8:103768/1‑149 (MQ=255) ctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGtt > 7:214498/1‑149 (MQ=255) ctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGt < 7:272517/148‑1 (MQ=255) ggAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCg > 5:357273/1‑149 (MQ=255) gAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGc < 8:16793/149‑1 (MQ=255) aaT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCt < 3:145212/149‑1 (MQ=255) aCTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtgg > 3:210164/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGGGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtggt < 2:226505/149‑1 (MQ=255) tggtggTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtggtg > 1:350816/1‑149 (MQ=255) gtggtgCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGGCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGtt < 4:115843/149‑1 (MQ=255) gtgCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCgg < 3:76025/122‑1 (MQ=255) gtgCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCgg > 4:76025/1‑122 (MQ=255) gtgCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtgg < 6:168800/142‑1 (MQ=255) gtgCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtgg > 5:168800/1‑142 (MQ=255) 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ggTCGGCGGCTTTAACATGGCCATGGCCCTGCTGCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTTGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAcc < 7:244361/148‑1 (MQ=255) ggTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAcc < 1:16272/148‑1 (MQ=255) ggTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAcc < 4:371444/148‑1 (MQ=255) ggTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAcc < 7:308166/148‑1 (MQ=255) tCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTg > 5:67120/1‑149 (MQ=255) ggcggcCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTgg < 8:366156/85‑1 (MQ=255) ggcggcCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTTGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTc < 7:103768/149‑1 (MQ=255) gcCTGAACCGGGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTTGTGTTCAAGCTGTGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATg < 7:343012/149‑1 (MQ=255) gcCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATg < 6:14489/149‑1 (MQ=255) aCAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCGGTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATc > 6:99639/1‑149 (MQ=255) cagcgccagcgcCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCa > 4:25557/1‑149 (MQ=255) agcgccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCAc > 5:313105/1‑149 (MQ=255) agcgccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGGTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGACTGATCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCAc > 7:252358/1‑149 (MQ=255) gccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCAcccc > 1:154315/1‑149 (MQ=255) ccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCATGGCCTGTACGAAACGCAGAGCTACGACCTGCTGCTGATGACCATAACCCAGTCAATGGCAATCAcccgg > 4:88835/1‑147 (MQ=38) cagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGcc < 5:260844/139‑1 (MQ=255) cagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGcc > 6:260844/1‑139 (MQ=255) cccTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCgctgct > 4:74203/1‑148 (MQ=255) ccTGGGGCTGGGCTTGGTTCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAATGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGa < 8:252358/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGa > 7:258610/1‑149 (MQ=255) | ATCAGCGTGGGCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGA > NC_002947/5987759‑5988053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |