Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,987,910 | G→C | 5.0% | R331P (CGC→CCC) | kefB‑III → | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,987,910 | 0 | G | C | 5.0% | 449.8 / 10.9 | 139 | R331P (CGC→CCC) | kefB‑III | glutathione‑regulated potassium/H+ antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (65/65); new base C (2/5); total (67/72) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.63e-01 |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
AGCGTGGGCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGA > NC_002947/5987762‑5988053 | aGCGTGGGCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTgcg < 5:96072/149‑1 (MQ=255) gTGGGCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCt > 8:164383/1‑149 (MQ=255) gTGGGCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCt < 2:41285/149‑1 (MQ=255) ggCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTgg < 5:284560/148‑1 (MQ=255) gCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTggg > 2:202002/1‑148 (MQ=255) gggCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAATGGCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATg > 1:235779/1‑149 (MQ=255) gggCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATgg > 1:145278/1‑149 (MQ=255) gggCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATgg > 5:253845/1‑149 (MQ=255) cAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCACCATGCCCAGGCGCAGGGCGCTgg < 4:154112/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTCGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTggcgg < 4:29585/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCACCATGCCCAGGCGCAGGGCGCTggcgct < 6:140078/149‑3 (MQ=38) gcgcCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATgg < 8:211857/137‑1 (MQ=255) cgcCTGCTGCTGGAAAT‑GCCAATGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGATGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGACTGAACAGCTCCACCGCCCTGCGCCTGGGCATGTGTCTGGCGGCggg > 8:343727/1‑149 (MQ=255) ctgctgctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTgg < 1:202002/149‑1 (MQ=255) ctgctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGc > 3:115843/1‑147 (MQ=255) ctgctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGc < 6:293244/147‑1 (MQ=255) ctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCTAGtt > 8:103768/1‑149 (MQ=255) ctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGtt > 7:204964/1‑149 (MQ=255) ctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGtt > 7:214498/1‑149 (MQ=255) ctgGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGt < 7:272517/148‑1 (MQ=255) gAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGc < 8:16793/149‑1 (MQ=255) aaT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCt < 3:145212/149‑1 (MQ=255) ccACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgt < 7:277579/149‑1 (MQ=255) aCTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtgg > 3:210164/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGGGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtggt < 2:226505/149‑1 (MQ=255) tggtggTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtggtg > 1:350816/1‑149 (MQ=255) gtggtgCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGGCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGtt < 4:115843/149‑1 (MQ=255) gtgCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtgg > 5:168800/1‑142 (MQ=255) ggCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGc > 1:159363/1‑120 (MQ=255) ggCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGc < 2:159363/120‑1 (MQ=255) ggCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTggg > 7:255369/1‑149 (MQ=255) ggCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTgg < 7:74496/148‑1 (MQ=255) ccTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGa > 8:334646/1‑120 (MQ=255) aCCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAgg < 2:235779/148‑1 (MQ=255) aCCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAgg < 8:255369/148‑1 (MQ=255) aCCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAgg < 6:253845/148‑1 (MQ=255) aCCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAg < 7:158479/147‑1 (MQ=255) aCCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAg < 8:204964/147‑1 (MQ=255) aCCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGa < 4:136544/149‑1 (MQ=255) ccTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAg < 6:290182/115‑1 (MQ=255) ccTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTgg < 8:122338/140‑1 (MQ=255) tGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtggt < 2:183059/127‑1 (MQ=255) ttGCTGGTGGGCGTTAATCTGCTGTTTCTGAGAGGAGTACGCCGCTTGTGCGGTGGCCTTAACAGAGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGAGAGTTCGCCTTAGTGGTGTTCAAGCTTGTAAAGGACCTAg < 6:113369/148‑1 (MQ=255) tggtggCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCACCATGCCCAGGCGCAGGGCGCTgg < 6:70059/93‑1 (MQ=25) ggtggCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtggtg < 2:143257/121‑1 (MQ=255) ggtggCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtggtg > 1:143257/1‑121 (MQ=255) tggCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTc < 4:210164/149‑1 (MQ=255) ggCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCg < 7:164383/149‑1 (MQ=255) ccgatatgctgctGTTGCTGATAGGCGTGGGCCGCTTGGTCGTCGGCCTGAACAGCTCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGTACCAATGCCTGTTCGa < 6:396687/141‑1 (MQ=38) cGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATa < 3:371727/149‑1 (MQ=255) tGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATAcc < 8:281280/149‑1 (MQ=255) aaGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATAcc > 5:164344/1‑147 (MQ=255) ctgctgTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGa > 5:396687/1‑140 (MQ=255) ctgTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTAGTCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTa > 7:325436/1‑149 (MQ=255) tgTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTAc > 8:308166/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCACCATGCCCAGGCGCAGGGCGCTggcgc < 2:73485/77‑2 (MQ=18) gTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCACCATGCCCAGGCGCAGGGCGCTggcgc > 1:73485/1‑76 (MQ=18) 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> 5:290193/1‑149 (MQ=255) tGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACctg > 5:158799/1‑149 (MQ=255) gATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCgtggtg < 8:369428/97‑1 (MQ=255) aTAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGt < 6:221821/75‑1 (MQ=255) aTAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGt > 5:221821/1‑75 (MQ=255) aTAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACctgc < 5:269057/148‑1 (MQ=255) aGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACctgctgc > 6:238281/1‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) ggCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACctgctgct > 4:243480/1‑143 (MQ=255) gCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGCGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGAGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGAc > 4:40465/1‑148 (MQ=255) ccGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGa > 8:160433/1‑132 (MQ=255) ccGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCa > 5:364793/1‑149 (MQ=255) ccGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGATGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCa > 7:62619/1‑149 (MQ=255) gCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCAt > 5:266577/1‑148 (MQ=255) cTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTa > 7:214996/1‑149 (MQ=255) attGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCATGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGCGCAAGGACCAAGGCCTGATCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGCCCATTa > 7:78849/2‑149 (MQ=255) ggTCGGCGGCTTTAACATGGCCATGGCCCTGCTGCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTTGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAcc < 7:244361/148‑1 (MQ=255) ggTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAccc > 5:386848/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAcc < 7:308166/148‑1 (MQ=255) ggTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAcc < 4:371444/148‑1 (MQ=255) ggTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTAcc < 1:16272/148‑1 (MQ=255) tCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTg > 5:67120/1‑149 (MQ=255) ggcggcCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTgg > 7:366156/1‑85 (MQ=255) ggcggcCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTTGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTc < 7:103768/149‑1 (MQ=255) gcCTGAACCGGGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTTGTGTTCAAGCTGTGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATg < 7:343012/149‑1 (MQ=255) cTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTACAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGCCCTGCTGATGATGACCATTACCCTGTCAAAGGc > 5:100572/1‑149 (MQ=255) agcgccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCAc > 5:313105/1‑149 (MQ=255) agcgccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGGTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGACTGATCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCAc > 7:252358/1‑149 (MQ=255) gccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCAcccc > 1:154315/1‑149 (MQ=255) ccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCATGGCCTGTACGAAACGCAGAGCTACGACCTGCTGCTGATGACCATAACCCAGTCAATGGCAATCAcccgg > 4:88835/1‑147 (MQ=38) ccagcgccCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCg > 8:366277/1‑149 (MQ=255) cccTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCgctgct > 4:74203/1‑148 (MQ=255) ccTGGGGCTGGGCTTGGTTCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAATGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGa < 8:252358/149‑1 (MQ=255) | AGCGTGGGCATGGGCGCCAACCTGCGCCTGCTGCTGGAAAT‑GCCACTGGTGGTGCTGGGCCTGACCCTGTTGCTGGTGGCCGTGAAGCTGCTGTTGCTGATAGGCGTCGGCCGCTTGGTCGGCGGCCTGAACAGCGCCAGCGCCCTGCGCCTGGGCATGGTGCTGGCGGCCGGTGGCGAGTTCGCCTTCGTGGTGTTCAAGCTGGGCAAGGACCAAGGCCTGTTCGATACCCAGACCTACGACCTGCTGCTGATGACCATTACCCTGTCAATGGCCATCACCCCGCTGCTGA > NC_002947/5987762‑5988053 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |