| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 479,496 | A→T | 7.2% | intergenic (‑28/+28) | cca ← / ← ycgB | multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase/type IV piliation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 479,496 | 0 | A | T | 7.2% | 248.5 / 7.0 | 83 | intergenic (‑28/+28) | cca/ycgB | multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase/type IV piliation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/38); new base T (4/2); total (43/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.63e-01 | |||||||||||
TAGCCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTG > NC_002947/479353‑479643 | tAGCCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAAc < 5:276507/148‑1 (MQ=255) ccATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGt > 3:218053/1‑149 (MQ=255) ccATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGt > 2:290564/1‑149 (MQ=255) cTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACGGGTTATCCTGTcggcag < 5:213215/148‑3 (MQ=255) cTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGt > 8:96697/1‑149 (MQ=255) gCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCAt > 3:130944/1‑149 (MQ=255) tttCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATggg < 4:139935/149‑1 (MQ=255) cGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTATCCATAACTGCCCACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCa > 1:256971/1‑149 (MQ=255) ggTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTGCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGGGGTCATGGGGTTGCATCag > 3:369035/1‑149 (MQ=255) tGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCagag < 4:354209/149‑1 (MQ=255) cccACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAggtggt < 6:98023/149‑1 (MQ=255) cccACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAggtggt < 6:62481/149‑1 (MQ=255) ccaccaGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGAt < 4:351678/149‑1 (MQ=255) caccaGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGAt > 4:211927/1‑148 (MQ=255) cagccagTCGATATCCCGGACAGGGCGGCCGACCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACa < 4:369035/149‑1 (MQ=255) gccagTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGc > 6:341658/1‑149 (MQ=255) agTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAg < 2:241755/149‑1 (MQ=255) gTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAgg > 3:184682/1‑149 (MQ=255) gATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGTCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTcc < 5:234710/149‑1 (MQ=255) atatCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCa > 7:335530/1‑149 (MQ=255) tatCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCa < 8:218270/148‑1 (MQ=255) tCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGc < 1:172934/149‑1 (MQ=255) gCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCgg < 4:184682/149‑1 (MQ=255) tGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAAATGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGc > 1:295102/1‑149 (MQ=255) tGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGAATAACAGCCAGGTCCATGCGGc > 3:331294/1‑148 (MQ=255) aCAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGcc < 7:96697/147‑1 (MQ=255) aCAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCa > 8:283797/1‑148 (MQ=255) aGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAg > 2:213913/1‑149 (MQ=255) gcggcCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCg < 4:218053/149‑1 (MQ=255) gcggcCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCg > 8:232613/1‑149 (MQ=255) ccGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGgcgc > 3:164857/1‑149 (MQ=255) ccGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGgcgc > 8:154090/1‑149 (MQ=255) ccGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAAC‑TTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCt > 1:358384/1‑149 (MQ=255) aGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCttt < 4:130944/149‑1 (MQ=255) gCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTc > 5:172694/1‑149 (MQ=255) aaaCGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTGGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAAGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGAGCTTTCGc > 1:128162/1‑149 (MQ=255) aaaCGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGc < 5:49276/149‑1 (MQ=255) aCGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTa < 7:154090/149‑1 (MQ=255) cGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GCTGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACCGGATATCCCGGCGGCGGTCATGGGGTTGCCTCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTAt < 8:250371/149‑1 (MQ=255) cGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTAt < 3:360449/149‑1 (MQ=255) cGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTAt > 2:377627/1‑149 (MQ=255) gcgcACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGCTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTcg > 4:71852/1‑149 (MQ=255) cgccgcCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCgcgg < 1:213913/149‑1 (MQ=255) cgccgcCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCgcgg < 2:128162/149‑1 (MQ=255) gccAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGcggcg‑g > 6:64421/1‑148 (MQ=255) cAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCgcggcg > 8:56769/1‑145 (MQ=255) cAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCgcggcg < 7:56769/145‑1 (MQ=255) cAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCAt > 5:291017/1‑149 (MQ=255) 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tGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATgtgg < 1:351955/147‑1 (MQ=255) tGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATgtgg < 1:367114/147‑1 (MQ=255) tGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGAATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATgtggt < 4:331294/148‑1 (MQ=255) tGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTAATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGTAAAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCTGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATgtgg < 2:369067/147‑1 (MQ=255) gTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCaga > 6:209848/1‑72 (MQ=255) gTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCaga < 5:209848/72‑1 (MQ=255) gTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATgtggtg < 7:283797/148‑1 (MQ=255) tA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAg < 2:358384/149‑1 (MQ=255) tgcatgtgcaGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACtca < 1:290564/149‑1 (MQ=255) tgcatgtgcaGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACtca > 2:41253/1‑149 (MQ=255) catgtgcaGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGAGCAAGTGATGAGTACtcac < 5:341658/149‑2 (MQ=255) catgtacaGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGACATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACtcat > 1:80023/1‑148 (MQ=255) ccccATGACCGCCGACGGGTTATCCTGTCGGCAGTTATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTa > 2:139343/3‑132 (MQ=37) ccccATGACCGCCGACGGGTTATCCTGTCGGCAGTTATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTa < 1:139343/130‑1 (MQ=37) ccATGACCGCCGACGGGTTATCCTGTCGGCAGTTATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCtt > 1:386712/1‑149 (MQ=38) ccATGACCGCCGACGGGTTATCCTGTCGGCAGTTATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCtt > 6:239415/1‑149 (MQ=38) ccATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCtt > 1:65839/1‑149 (MQ=255) aTAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGCCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCAAGGACCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATCCTCGCCGAGCGCCG‑GCATGTGGTGAGTACTCAACACTTGCTCGACTTg > 5:235143/1‑148 (MQ=255) aaCTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCAc > 2:229171/1‑149 (MQ=255) aCTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACg < 6:172694/149‑1 (MQ=255) tGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGAG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGt > 1:348605/1‑149 (MQ=255) gCCGACGGGTTATCCTGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGtc > 6:259863/1‑149 (MQ=255) ccGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGtct > 6:11042/1‑149 (MQ=255) ccGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGtc < 6:291017/148‑1 (MQ=255) ccGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGtc < 2:295102/148‑1 (MQ=255) aCAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGtctc > 7:322521/1‑147 (MQ=255) ggATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGt < 7:232613/149‑1 (MQ=255) gATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTg > 2:362776/1‑149 (MQ=255) gATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTg > 4:1986/1‑149 (MQ=255) | TAGCCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTA‑GATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCG‑GCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTG > NC_002947/479353‑479643 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |