| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,137,497 | T→C | 5.1% | intergenic (+41/‑49) | PP_5733 → / → czcC | metal‑binding protein/CzcC family metal RND transporter outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,137,497 | 0 | T | C | 5.1% | 288.5 / 2.9 | 95 | intergenic (+41/‑49) | PP_5733/czcC | metal‑binding protein/CzcC family metal RND transporter outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/44); new base C (2/3); total (48/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCGAGCCCGCACTCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTC > NC_002947/6137353‑6137639 | tCGAGCCCGCACTCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAAc < 2:303667/149‑1 (MQ=255) aGCCCGCACTCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGAt > 1:77308/1‑149 (MQ=255) gCCCGCACTCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGAt > 8:292930/1‑148 (MQ=255) cccGCACTCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGa > 2:85368/1‑149 (MQ=255) ccGCACTCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCT‑CCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGAt > 1:381440/1‑145 (MQ=255) ccGCACTCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCT‑CCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGAt < 2:381440/145‑1 (MQ=255) gCACTCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGacac < 6:320002/149‑1 (MQ=255) aCTCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACAcgc > 5:352530/1‑149 (MQ=255) cTCACCTTCGCCACTACACCTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCGTTAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACAcgc < 1:85368/149‑1 (MQ=255) tCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACgcgc < 6:352530/149‑1 (MQ=255) aCCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCt < 1:173627/131‑1 (MQ=255) aCCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCt > 2:173627/1‑131 (MQ=255) ccTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGAGGACACGCGCCtg > 6:252887/1‑149 (MQ=255) ttCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCtgtg > 2:275613/1‑149 (MQ=255) gCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTgcgc > 3:279476/1‑149 (MQ=255) gCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTgcgc > 3:284733/1‑149 (MQ=255) tACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGtt > 8:184053/1‑149 (MQ=255) acGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGttttt < 7:292930/149‑1 (MQ=255) gTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTc < 4:318326/149‑1 (MQ=255) gTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTc > 4:115341/1‑149 (MQ=255) gTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTc < 2:84607/149‑1 (MQ=255) ccAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGa < 8:2073/149‑1 (MQ=255) ccAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCCGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTc > 3:212007/1‑147 (MQ=255) cAGTCGATACCTACGGTCTGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGa < 4:320972/148‑1 (MQ=255) cAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGa < 5:222277/148‑1 (MQ=255) cAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAg < 5:113971/149‑1 (MQ=255) aGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAg > 6:316197/1‑148 (MQ=255) ggcGATACCTACGCGCAGAGCCTTTTCACCAGGGCGCCCCCCGATCCCTGGCGCCCTCCTCCCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCGCGGCGGCCGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAggc < 4:339710/147‑2 (MQ=255) tCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTgcgc > 2:387025/1‑133 (MQ=255) tCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTgcgc < 1:387025/133‑1 (MQ=255) tCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGaa < 2:181619/149‑1 (MQ=255) aCCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAatcatc < 3:286561/149‑1 (MQ=255) cTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTc < 2:63655/136‑1 (MQ=255) cTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTc > 1:63655/1‑136 (MQ=255) cTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCAtctc > 6:121694/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCa < 2:77308/148‑1 (MQ=255) gTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGa < 3:115341/149‑1 (MQ=255) agagCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTc < 4:284733/149‑1 (MQ=255) agagCCGTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTc < 4:279476/149‑1 (MQ=255) ccTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCt < 1:275613/149‑1 (MQ=255) ccTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCt < 8:260229/149‑1 (MQ=255) cTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCCGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTa > 1:13162/1‑149 (MQ=255) ttttAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTAt > 1:133765/1‑149 (MQ=255) aCCAGGGCTCCCCCCTATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTTTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTcc < 5:1241/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTcc > 7:117514/1‑148 (MQ=255) cAGGGCTCCCACCGATCACTGGCGCCCTACTCGCGACTGATTACTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCACCATGCCTCCCGGATGCACCCa > 4:365416/1‑149 (MQ=255) aGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCAt < 8:144024/149‑1 (MQ=255) tCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGtttt < 8:79632/106‑1 (MQ=255) tCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGtttt > 7:79632/1‑106 (MQ=255) cccccGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTAt < 8:42792/134‑1 (MQ=255) cccccGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTAt > 7:42792/1‑134 (MQ=255) cccccGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGc > 4:1558/1‑149 (MQ=255) ccccGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAatc > 4:174755/1‑114 (MQ=255) cTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGAtgcttgc < 5:316197/149‑1 (MQ=255) tGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCAtt > 6:372902/1‑132 (MQ=255) gcgcCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTccc < 7:319076/127‑1 (MQ=255) gcgcCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTccc > 8:319076/1‑127 (MQ=255) 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cctcGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTg < 4:102702/149‑1 (MQ=255) ctcGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTg < 7:184053/148‑1 (MQ=255) tcGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTgg > 2:352078/1‑148 (MQ=255) gcgcCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTAt < 8:253878/110‑1 (MQ=255) gcgcCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTAt > 7:253878/1‑110 (MQ=255) gcCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCCGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTc < 2:13162/149‑1 (MQ=255) cTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCct > 5:141940/1‑149 (MQ=255) aTTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGAtgcttg < 2:131121/127‑1 (MQ=255) aTTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGAtgcttg > 1:131121/1‑127 (MQ=255) aTTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCctg < 3:10042/147‑1 (MQ=255) ttCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCctgctg > 6:2842/1‑149 (MQ=255) ttCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCctgctg > 5:180770/1‑149 (MQ=255) ttCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCCGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCctgct < 4:212007/148‑1 (MQ=255) ccTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCtgctgc < 3:4210/148‑1 (MQ=255) ttCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCtgt < 4:304907/57‑1 (MQ=255) ttCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCtgt > 3:304907/1‑57 (MQ=255) ttCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCgg > 4:41383/1‑149 (MQ=255) ttCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCgg > 5:187806/1‑149 (MQ=255) ttCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCgg > 6:114906/1‑149 (MQ=255) g‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGgcgc < 4:192654/149‑1 (MQ=255) tCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGgc > 6:48876/1‑149 (MQ=255) cacCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCa < 3:1558/149‑1 (MQ=255) cATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCGCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGc > 5:305854/1‑149 (MQ=255) cATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGgcg > 7:74218/1‑135 (MQ=255) cATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGgcg < 8:74218/135‑1 (MQ=255) cATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGc < 6:305854/149‑1 (MQ=255) cATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGc > 2:393365/1‑149 (MQ=255) ttCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACt > 5:245536/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCGGCTGAATGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCt > 4:249302/1‑148 (MQ=255) ccTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCg < 5:2842/146‑1 (MQ=255) ccTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCt > 4:174113/1‑148 (MQ=255) tCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCg > 7:141596/1‑129 (MQ=255) tCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCg < 8:141596/129‑1 (MQ=255) ggcggcTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCActc > 2:82898/1‑149 (MQ=255) | TCGAGCCCGCACTCACCTTCGCCACTACACGTCCAGTCGATACCTACGGTCAGAGCCTTTTAACCAGGGCTCCCCCCGATCACTGGCGCCCTCCTCGCGCCTGATTCCTTCG‑TAAAACTCACACCATTGTTCTGCCTCGGCGGCTGAACGATGACACGCGCCTGTGCGCTGGTTTTTTCGAGGAATCATCTCCATGACTCCCCTATGCTCCCATTCAGGGCGGATGCTTGCTGCCGCCTTGGTACTCCTGCTGCCGGCGCTATCGGCGCAGGCGAACTCGCTCACTC > NC_002947/6137353‑6137639 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |